More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_06520 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_2183  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  48.63 
 
 		 1252 aa  1177    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0300  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  57.89 
 
 		 1231 aa  1437    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0025  phosphoribosylformylglycinamidine synthase, putative  47.23 
 
 		 1241 aa  1139    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.435502  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0262  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  72.33 
 
 		 1238 aa  1853    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.414169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3350  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  52.09 
 
 		 1293 aa  1288    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.611392  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0046  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  47.17 
 
 		 1236 aa  1182    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1471  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  55.24 
 
 		 1284 aa  1385    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0680923  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0351  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  66.77 
 
 		 1251 aa  1714    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1031  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  64.11 
 
 		 1251 aa  1678    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0499  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  55.4 
 
 		 1256 aa  1377    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000277776  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0671  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  52.15 
 
 		 1266 aa  1298    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0669  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  52.19 
 
 		 1266 aa  1306    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2106  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  49.09 
 
 		 1244 aa  1209    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0554  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  55.72 
 
 		 1256 aa  1395    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.749527  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13720  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  67.65 
 
 		 1254 aa  1739    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0050  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II (FGAM synthetase)  47.35 
 
 		 1241 aa  1140    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06520  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  100 
 
 		 1243 aa  2560    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.57325 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0861  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  69.61 
 
 		 1244 aa  1798    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1107  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  43.58 
 
 		 1631 aa  1003    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2372  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.63 
 
 		 962 aa  313  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1170  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.1 
 
 		 947 aa  294  8e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0620  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.92 
 
 		 945 aa  293  1e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0361  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.23 
 
 		 953 aa  284  9e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00613542  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0379  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.08 
 
 		 953 aa  281  5e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.59 
 
 		 953 aa  271  4e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0779511  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2622  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.56 
 
 		 985 aa  270  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0168341  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1829  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.51 
 
 		 966 aa  269  2e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1795  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.7 
 
 		 981 aa  261  9e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0956476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0213  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.9 
 
 		 973 aa  259  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1941  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.33 
 
 		 996 aa  254  9.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2699  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.32 
 
 		 996 aa  244  7.999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1279  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.04 
 
 		 766 aa  243  2e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.77 
 
 		 959 aa  242  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.384894  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2484  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.95 
 
 		 1004 aa  235  5e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0206  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.35 
 
 		 993 aa  234  6e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1629  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  29.15 
 
 		 979 aa  231  8e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.521268  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2066  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.93 
 
 		 996 aa  226  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3013  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.24 
 
 		 993 aa  224  6e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2411  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.33 
 
 		 995 aa  224  8e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147677 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1634  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II, putative  26.75 
 
 		 996 aa  223  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.494383  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1889  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.25 
 
 		 996 aa  222  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2331  AIR synthase related protein  26.74 
 
 		 996 aa  221  5e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.15 
 
 		 989 aa  221  6e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1061  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.48 
 
 		 979 aa  221  7.999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.726589  normal  0.0660038 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1496  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.91 
 
 		 989 aa  221  1e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.5 
 
 		 989 aa  219  2e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.783256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1328  phosphoribosylformylglycinamidine synthase glutamine amidotransferase subunit  26.91 
 
 		 1020 aa  220  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1147  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.61 
 
 		 996 aa  218  5e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540487  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0395  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.93 
 
 		 1297 aa  217  9e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0472  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.96 
 
 		 982 aa  217  9e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.311423  normal  0.43995 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0534  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.22 
 
 		 800 aa  210  1e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.6525 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2350  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.97 
 
 		 1293 aa  206  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1301  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.93 
 
 		 1293 aa  202  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004280  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.48 
 
 		 1297 aa  202  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1078  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.17 
 
 		 1299 aa  201  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.528102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1034  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.08 
 
 		 1299 aa  201  9e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.559579  normal  0.890548 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1317  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.44 
 
 		 1293 aa  201  9e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0116  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.65 
 
 		 1221 aa  199  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.722762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0812  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.95 
 
 		 946 aa  198  6e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39660  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.43 
 
 		 1298 aa  197  8.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4189  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.25 
 
 		 1299 aa  197  9e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1183  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.81 
 
 		 993 aa  197  1e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0296  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.82 
 
 		 1234 aa  196  2e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.391304 
 
 
-
 
NC_002978  WD0913  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II domain-containing protein  26.98 
 
 		 1032 aa  196  2e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.294336  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3414  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.81 
 
 		 1298 aa  196  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01150  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.51 
 
 		 1298 aa  196  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4001  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.04 
 
 		 1299 aa  195  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00163478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0912  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.74 
 
 		 768 aa  195  5e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.137299  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15740  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.45 
 
 		 1298 aa  195  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.989806  hitchhiker  0.000000174992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4724  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.8 
 
 		 1217 aa  195  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375625  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1037  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.93 
 
 		 1299 aa  194  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1913  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.54 
 
 		 999 aa  194  8e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3191  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.22 
 
 		 993 aa  194  9e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0198403  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1354  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.49 
 
 		 1298 aa  194  9e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.297913  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2090  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.87 
 
 		 1223 aa  192  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0750  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.4 
 
 		 1309 aa  192  5e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1240  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.06 
 
 		 1293 aa  191  8e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1459  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.64 
 
 		 1298 aa  191  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1269  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.26 
 
 		 1298 aa  190  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1309  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.43 
 
 		 1293 aa  191  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2973  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.53 
 
 		 1222 aa  190  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1141  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.42 
 
 		 1293 aa  189  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0482  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.55 
 
 		 998 aa  188  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1550  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.26 
 
 		 1292 aa  189  4e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00364402  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1238  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.43 
 
 		 1293 aa  188  5e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26 
 
 		 1293 aa  188  6e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1280  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.39 
 
 		 1222 aa  186  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17772  predicted protein  24.83 
 
 		 1313 aa  186  3e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1501  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.37 
 
 		 1291 aa  185  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2484  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.11 
 
 		 1301 aa  185  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234479  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1564  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.8 
 
 		 1293 aa  185  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0902  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.92 
 
 		 1345 aa  185  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3339  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.97 
 
 		 751 aa  185  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3318  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.55 
 
 		 1297 aa  185  6e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0498  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.45 
 
 		 1295 aa  185  6e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0999  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.47 
 
 		 1298 aa  184  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346614 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01396  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.14 
 
 		 1295 aa  184  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06195  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  22.74 
 
 		 1214 aa  183  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0543  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.75 
 
 		 1294 aa  183  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.164924  normal  0.914439 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75569  5'-phosphoribosylformyl glycinamidine synthetase  24.96 
 
 		 1343 aa  181  8e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0273535 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>