More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_13720 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0861  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  71.91 
 
 		 1244 aa  1850    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0554  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  53.34 
 
 		 1256 aa  1348    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.749527  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0025  phosphoribosylformylglycinamidine synthase, putative  46.29 
 
 		 1241 aa  1102    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.435502  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2183  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  46.7 
 
 		 1252 aa  1146    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0499  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  53.5 
 
 		 1256 aa  1343    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000277776  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0300  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  57.06 
 
 		 1231 aa  1402    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1107  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  43.97 
 
 		 1631 aa  992    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0671  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  50.67 
 
 		 1266 aa  1251    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0669  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  50.28 
 
 		 1266 aa  1243    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0262  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  72.19 
 
 		 1238 aa  1861    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.414169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3350  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  51.19 
 
 		 1293 aa  1278    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.611392  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0046  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  46.05 
 
 		 1236 aa  1131    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0050  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II (FGAM synthetase)  46.45 
 
 		 1241 aa  1097    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0351  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  66.85 
 
 		 1251 aa  1746    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13720  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  100 
 
 		 1254 aa  2592    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2106  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  47.36 
 
 		 1244 aa  1163    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1031  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  65.29 
 
 		 1251 aa  1714    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06520  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  67.94 
 
 		 1243 aa  1746    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.57325 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1471  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  53.13 
 
 		 1284 aa  1323    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0680923  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2372  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.07 
 
 		 962 aa  274  7e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1795  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.81 
 
 		 981 aa  264  6.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0956476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2622  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.97 
 
 		 985 aa  263  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0168341  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0379  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.97 
 
 		 953 aa  258  6e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0361  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.14 
 
 		 953 aa  257  8e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00613542  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1170  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.85 
 
 		 947 aa  254  6e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1829  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.45 
 
 		 966 aa  254  7e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0620  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.09 
 
 		 945 aa  253  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.26 
 
 		 953 aa  250  1e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0779511  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0213  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.52 
 
 		 973 aa  241  5.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.11 
 
 		 959 aa  235  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.384894  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1279  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.62 
 
 		 766 aa  234  8.000000000000001e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1629  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  28.71 
 
 		 979 aa  227  1e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.521268  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2699  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.92 
 
 		 996 aa  222  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1634  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II, putative  26.3 
 
 		 996 aa  211  5e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.494383  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0472  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.82 
 
 		 982 aa  211  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.311423  normal  0.43995 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1941  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.62 
 
 		 996 aa  209  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1147  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.96 
 
 		 996 aa  209  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540487  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3191  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.82 
 
 		 993 aa  209  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0198403  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2411  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.66 
 
 		 995 aa  209  4e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147677 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1061  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.42 
 
 		 979 aa  209  4e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.726589  normal  0.0660038 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2484  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.47 
 
 		 1004 aa  208  6e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3013  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.76 
 
 		 993 aa  207  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2066  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.62 
 
 		 996 aa  206  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1889  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.41 
 
 		 996 aa  199  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0206  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.31 
 
 		 993 aa  199  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1496  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.25 
 
 		 989 aa  198  6e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.33 
 
 		 989 aa  197  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.783256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2331  AIR synthase related protein  25.26 
 
 		 996 aa  197  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.69 
 
 		 989 aa  196  3e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1328  phosphoribosylformylglycinamidine synthase glutamine amidotransferase subunit  24.64 
 
 		 1020 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1183  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.91 
 
 		 993 aa  191  1e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0116  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.34 
 
 		 1221 aa  190  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.722762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1913  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.21 
 
 		 999 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0534  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.47 
 
 		 800 aa  186  2.0000000000000003e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.6525 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0841  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.25 
 
 		 1313 aa  186  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4724  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.24 
 
 		 1217 aa  183  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375625  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1564  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.39 
 
 		 1293 aa  179  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0296  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.44 
 
 		 1234 aa  178  6e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.391304 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0912  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.07 
 
 		 768 aa  177  9e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.137299  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0913  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II domain-containing protein  26.44 
 
 		 1032 aa  176  2.9999999999999996e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.294336  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2090  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.65 
 
 		 1223 aa  176  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2350  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.61 
 
 		 1293 aa  176  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0812  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.91 
 
 		 946 aa  174  1e-41  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3339  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.59 
 
 		 751 aa  173  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2973  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.95 
 
 		 1222 aa  173  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1280  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.02 
 
 		 1222 aa  173  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1550  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.91 
 
 		 1292 aa  172  3e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00364402  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1309  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.38 
 
 		 1293 aa  172  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1240  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.86 
 
 		 1293 aa  172  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004280  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.71 
 
 		 1297 aa  172  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0482  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.15 
 
 		 998 aa  172  5e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1301  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.98 
 
 		 1293 aa  171  7e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4001  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.51 
 
 		 1299 aa  171  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00163478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06195  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  22.69 
 
 		 1214 aa  169  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0395  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.68 
 
 		 1297 aa  170  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1238  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.56 
 
 		 1293 aa  170  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0999  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.14 
 
 		 1298 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346614 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41441  predicted protein  25.04 
 
 		 1348 aa  167  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1317  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.96 
 
 		 1293 aa  166  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39660  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.96 
 
 		 1298 aa  165  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1503  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.11 
 
 		 1297 aa  164  8.000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1501  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.62 
 
 		 1291 aa  163  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3414  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.25 
 
 		 1298 aa  162  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0351  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.3 
 
 		 1007 aa  162  4e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4189  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.8 
 
 		 1299 aa  161  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1141  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.38 
 
 		 1293 aa  161  8e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0746  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.51 
 
 		 1296 aa  161  1e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0658  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.3 
 
 		 1004 aa  160  1e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05940  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.98 
 
 		 798 aa  160  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6876  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.09 
 
 		 752 aa  159  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3287  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.27 
 
 		 1293 aa  159  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1037  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.49 
 
 		 1299 aa  158  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17772  predicted protein  23.26 
 
 		 1313 aa  158  6e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2196  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.57 
 
 		 1299 aa  158  6e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0353893  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.6 
 
 		 1293 aa  158  7e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1383  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.54 
 
 		 1293 aa  157  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.28 
 
 		 751 aa  157  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.843538  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3138  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.48 
 
 		 1293 aa  156  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217265 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1269  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.91 
 
 		 1298 aa  156  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1034  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.57 
 
 		 1299 aa  156  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.559579  normal  0.890548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>