More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2090 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E2922  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.73 
 
 		 1295 aa  677    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02449  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.89 
 
 		 1295 aa  676    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1111  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.97 
 
 		 1295 aa  680    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.503937  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2973  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  74.84 
 
 		 1222 aa  1934    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2090  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  100 
 
 		 1223 aa  2538    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06195  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  69.58 
 
 		 1214 aa  1784    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0296  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  60.18 
 
 		 1234 aa  1539    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.391304 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1022  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.33 
 
 		 1359 aa  651    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0673  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.04 
 
 		 1288 aa  639    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0903216  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3138  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.15 
 
 		 1293 aa  682    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217265 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1539  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  36.02 
 
 		 1307 aa  692    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4724  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  77.72 
 
 		 1217 aa  2000    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375625  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0116  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  74.73 
 
 		 1221 aa  1941    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.722762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0746  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.3 
 
 		 1296 aa  673    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17772  predicted protein  36 
 
 		 1313 aa  735    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3287  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.74 
 
 		 1293 aa  670    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1459  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.75 
 
 		 1298 aa  644    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1832  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.06 
 
 		 1357 aa  647    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.875637 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3042  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.17 
 
 		 1295 aa  667    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.631936  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1301  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.88 
 
 		 1293 aa  665    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1446  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  32.85 
 
 		 1353 aa  648    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1034  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.52 
 
 		 1299 aa  639    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.559579  normal  0.890548 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2710  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.97 
 
 		 1295 aa  678    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3792  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.89 
 
 		 1295 aa  677    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.753577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1269  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.41 
 
 		 1298 aa  640    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0750  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.54 
 
 		 1309 aa  657    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1925  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.92 
 
 		 1309 aa  671    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.741982 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1354  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.93 
 
 		 1298 aa  656    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.297913  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39660  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.49 
 
 		 1298 aa  636    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1390  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.06 
 
 		 1348 aa  651    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256104  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.15 
 
 		 1293 aa  655    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0629  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.35 
 
 		 1318 aa  643    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.385038 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3623  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.46 
 
 		 1296 aa  653    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2463  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  32.93 
 
 		 1366 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1907  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.78 
 
 		 1300 aa  681    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.819061  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0999  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.62 
 
 		 1298 aa  647    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346614 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2342  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  32.85 
 
 		 1359 aa  648    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1120  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.81 
 
 		 1295 aa  678    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5215  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.06 
 
 		 1354 aa  641    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903244  normal  0.536737 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2303  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  32.93 
 
 		 1356 aa  653    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.874748  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1564  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.75 
 
 		 1293 aa  662    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1937  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.28 
 
 		 1354 aa  647    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1550  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.41 
 
 		 1292 aa  678    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00364402  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0395  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.51 
 
 		 1297 aa  670    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2383  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.68 
 
 		 1303 aa  681    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2768  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.49 
 
 		 1295 aa  661    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2135  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.01 
 
 		 1414 aa  655    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.077761  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3368  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  32.85 
 
 		 1356 aa  650    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.930904  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0643  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.22 
 
 		 1306 aa  671    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4001  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.9 
 
 		 1299 aa  683    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00163478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2842  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.81 
 
 		 1295 aa  677    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2808  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.41 
 
 		 1295 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1478  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.15 
 
 		 1290 aa  669    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.704135 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1082  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.57 
 
 		 1295 aa  669    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.60233  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2771  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.62 
 
 		 1295 aa  671    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.661973  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1501  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.31 
 
 		 1291 aa  653    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2283  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  32.13 
 
 		 1361 aa  651    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.67 
 
 		 1293 aa  655    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000193442  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.91 
 
 		 1293 aa  671    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3203  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.94 
 
 		 1311 aa  683    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1988  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.41 
 
 		 1283 aa  636    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1870  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.74 
 
 		 1348 aa  655    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.395748 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0002  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.67 
 
 		 1297 aa  647    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6165  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.36 
 
 		 1354 aa  648    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.281992  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2727  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.49 
 
 		 1295 aa  661    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3113  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.58 
 
 		 1295 aa  641    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1253  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.46 
 
 		 1296 aa  653    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1667  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  63.23 
 
 		 1231 aa  1576    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.209803  normal  0.519263 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01150  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.36 
 
 		 1298 aa  651    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3654  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.63 
 
 		 1296 aa  679    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1503  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.83 
 
 		 1297 aa  640    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1238  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.67 
 
 		 1293 aa  673    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1309  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.15 
 
 		 1293 aa  671    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2474  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.65 
 
 		 1295 aa  660    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1141  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.1 
 
 		 1293 aa  664    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1902  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.21 
 
 		 1354 aa  643    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0378241  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15740  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.96 
 
 		 1298 aa  651    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.989806  hitchhiker  0.000000174992 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1210  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  32.85 
 
 		 1356 aa  650    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2642  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.34 
 
 		 1293 aa  682    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.873456  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1280  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  71.91 
 
 		 1222 aa  1828    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1147  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.39 
 
 		 1296 aa  652    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3414  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.82 
 
 		 1298 aa  654    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1914  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.36 
 
 		 1354 aa  648    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.662035  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2196  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.24 
 
 		 1299 aa  658    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0353893  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2943  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.49 
 
 		 1295 aa  661    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2354  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.41 
 
 		 1283 aa  636    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1240  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.69 
 
 		 1293 aa  673    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1317  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.3 
 
 		 1293 aa  654    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2831  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.33 
 
 		 1295 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1360  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  32.6 
 
 		 1354 aa  638    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2350  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.26 
 
 		 1293 aa  665    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1223  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.09 
 
 		 1295 aa  657    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41441  predicted protein  35.76 
 
 		 1348 aa  714    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3052  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.28 
 
 		 1295 aa  662    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2994  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.07 
 
 		 1293 aa  678    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2484  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.17 
 
 		 1301 aa  662    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234479  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2710  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.97 
 
 		 1295 aa  680    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01396  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.57 
 
 		 1295 aa  644    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1917  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  32.35 
 
 		 1361 aa  659    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1383  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.99 
 
 		 1293 aa  677    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>