More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1170 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0379  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.38 
 
 
953 aa  726    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.96 
 
 
953 aa  717    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0779511  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0620  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  68.04 
 
 
945 aa  1284    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0361  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42 
 
 
953 aa  727    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00613542  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2372  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  64.55 
 
 
962 aa  1288    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0206  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  41.24 
 
 
993 aa  639    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1829  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.78 
 
 
966 aa  706    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1170  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  100 
 
 
947 aa  1934    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2622  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.39 
 
 
985 aa  634  1e-180  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0168341  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0213  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.27 
 
 
973 aa  630  1e-179  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3013  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  39.84 
 
 
993 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1795  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.43 
 
 
981 aa  610  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0956476  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2699  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.32 
 
 
996 aa  611  1e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1941  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.1 
 
 
996 aa  610  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.18 
 
 
959 aa  611  1e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.384894  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2484  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  40.83 
 
 
1004 aa  611  1e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3191  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  39.02 
 
 
993 aa  600  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0198403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1634  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II, putative  37.87 
 
 
996 aa  597  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.494383  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2331  AIR synthase related protein  38.79 
 
 
996 aa  597  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1889  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  38.75 
 
 
996 aa  597  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1328  phosphoribosylformylglycinamidine synthase glutamine amidotransferase subunit  39.44 
 
 
1020 aa  592  1e-167  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1913  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  40.76 
 
 
999 aa  591  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2411  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  40.17 
 
 
995 aa  587  1e-166  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147677 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1279  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.43 
 
 
766 aa  579  1e-164  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2066  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.82 
 
 
996 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1147  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.03 
 
 
996 aa  554  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540487  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0534  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.05 
 
 
800 aa  526  1e-147  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.6525 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0351  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  35.27 
 
 
1007 aa  499  1e-139  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1629  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  36.58 
 
 
979 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.521268  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0658  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.87 
 
 
1004 aa  486  1e-136  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0472  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.78 
 
 
982 aa  479  1e-133  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.311423  normal  0.43995 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1061  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  34.78 
 
 
979 aa  477  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.726589  normal  0.0660038 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.68 
 
 
989 aa  474  1e-132  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1496  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.72 
 
 
989 aa  474  1e-132  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.91 
 
 
989 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.783256  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0913  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II domain-containing protein  37.65 
 
 
1032 aa  464  1e-129  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.294336  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1183  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.12 
 
 
993 aa  464  1e-129  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0432  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  36.19 
 
 
1009 aa  465  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117579  normal  0.85361 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0912  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  35.2 
 
 
768 aa  458  1e-127  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.137299  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0482  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34 
 
 
998 aa  427  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0812  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.79 
 
 
946 aa  392  1e-107  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0064  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  34.79 
 
 
746 aa  369  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.250893  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4362  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.89 
 
 
767 aa  346  1e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516732  normal  0.595476 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4346  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.89 
 
 
759 aa  344  5e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0491496  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit II  36.02 
 
 
727 aa  343  1e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262148  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0397  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.13 
 
 
744 aa  340  5e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4214  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.89 
 
 
759 aa  340  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317587  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0554  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  27.99 
 
 
1256 aa  340  9.999999999999999e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.749527  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0521  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  34.4 
 
 
733 aa  334  4e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4369  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.88 
 
 
759 aa  334  4e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1135  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.03 
 
 
742 aa  333  8e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  34.07 
 
 
761 aa  327  8.000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0504799  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2048  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  34.43 
 
 
733 aa  324  4e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2298  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.6 
 
 
734 aa  323  8e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.032092 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1471  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  27.6 
 
 
1284 aa  323  9.999999999999999e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0680923  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0259  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.54 
 
 
742 aa  323  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10818  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.7 
 
 
754 aa  320  9e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0131091  normal  0.548571 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5056  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.29 
 
 
807 aa  319  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1053  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.38 
 
 
743 aa  317  8e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.207294 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.7 
 
 
764 aa  316  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.252255  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0499  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.53 
 
 
1256 aa  315  2.9999999999999996e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000277776  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0028  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.81 
 
 
752 aa  314  5.999999999999999e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0671  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  28.26 
 
 
1266 aa  313  9e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0669  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  28.38 
 
 
1266 aa  313  1e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0937  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.21 
 
 
758 aa  312  2e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0312  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.72 
 
 
758 aa  311  4e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.43 
 
 
758 aa  310  1.0000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2366  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.7 
 
 
741 aa  310  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2074  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.74 
 
 
754 aa  309  1.0000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.905222  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2586  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.33 
 
 
739 aa  309  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.236603 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4321  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.23 
 
 
764 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06520  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  29.1 
 
 
1243 aa  307  5.0000000000000004e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.57325 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6876  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.71 
 
 
752 aa  305  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2051  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.9 
 
 
715 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00206417  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1630  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.79 
 
 
781 aa  306  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.503896  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6405  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.8 
 
 
758 aa  304  4.0000000000000003e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.773242  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0300  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  28.09 
 
 
1231 aa  304  6.000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1277  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.11 
 
 
744 aa  303  7.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3688  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.59 
 
 
767 aa  303  9e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02500  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.82 
 
 
768 aa  303  1e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0678  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.62 
 
 
769 aa  303  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.97 
 
 
751 aa  302  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.843538  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3592  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  34.36 
 
 
755 aa  301  3e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.911773  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4068  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.72 
 
 
772 aa  301  5e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0005  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  34.04 
 
 
737 aa  301  5e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0508779 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1643  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II (FGAM synthase II)  30.15 
 
 
780 aa  299  1e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4929  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.56 
 
 
768 aa  300  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4546  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.56 
 
 
768 aa  299  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0540  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.55 
 
 
772 aa  300  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4633  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.56 
 
 
768 aa  299  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1650  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II (FGAM synthase II)  30.04 
 
 
780 aa  298  4e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0155  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.29 
 
 
769 aa  298  4e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513467  normal  0.0402011 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1184  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.47 
 
 
735 aa  298  4e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3742  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.18 
 
 
767 aa  298  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182155 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0008  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.86 
 
 
737 aa  297  7e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.70389  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0708  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.95 
 
 
740 aa  295  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1459  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.59 
 
 
732 aa  295  2e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.8 
 
 
739 aa  295  3e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0340  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.67 
 
 
739 aa  294  5e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0291  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.78 
 
 
787 aa  294  7e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>