More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3013 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1496  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  41.55 
 
 		 989 aa  728    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  41.63 
 
 		 989 aa  736    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.783256  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0379  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.78 
 
 		 953 aa  703    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1634  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II, putative  58.15 
 
 		 996 aa  1143    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.494383  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0913  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II domain-containing protein  43.71 
 
 		 1032 aa  645    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.294336  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.53 
 
 		 953 aa  696    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0779511  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  42.17 
 
 		 989 aa  733    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2411  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  64.56 
 
 		 995 aa  1316    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147677 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2066  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  57.86 
 
 		 996 aa  1129    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0482  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  43.77 
 
 		 998 aa  726    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0213  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.18 
 
 		 973 aa  650    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1328  phosphoribosylformylglycinamidine synthase glutamine amidotransferase subunit  57.72 
 
 		 1020 aa  1143    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1941  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  58.08 
 
 		 996 aa  1144    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3191  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  67.71 
 
 		 993 aa  1378    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0198403  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  40.65 
 
 		 959 aa  661    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.384894  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3013  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  100 
 
 		 993 aa  2060    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1061  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.73 
 
 		 979 aa  698    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.726589  normal  0.0660038 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1889  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  56.3 
 
 		 996 aa  1103    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2622  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.28 
 
 		 985 aa  670    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0168341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0472  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  43.19 
 
 		 982 aa  679    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.311423  normal  0.43995 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2484  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  67.13 
 
 		 1004 aa  1355    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2699  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  57.43 
 
 		 996 aa  1129    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1183  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  42.2 
 
 		 993 aa  719    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2331  AIR synthase related protein  56.2 
 
 		 996 aa  1102    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0432  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  43.18 
 
 		 1009 aa  724    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117579  normal  0.85361 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1795  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.05 
 
 		 981 aa  664    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0956476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1147  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  57 
 
 		 996 aa  1107    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540487  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1913  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  61.54 
 
 		 999 aa  1256    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1629  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  43.78 
 
 		 979 aa  712    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.521268  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1829  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.9 
 
 		 966 aa  720    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0361  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42 
 
 		 953 aa  702    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00613542  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0206  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  66.17 
 
 		 993 aa  1332    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0658  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  40.39 
 
 		 1004 aa  634  1e-180  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0620  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  40.1 
 
 		 945 aa  622  1e-176  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0351  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.22 
 
 		 1007 aa  615  9.999999999999999e-175  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1170  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.84 
 
 		 947 aa  595  1e-168  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2372  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.85 
 
 		 962 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1279  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  40.92 
 
 		 766 aa  547  1e-154  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0534  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.66 
 
 		 800 aa  545  1e-153  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.6525 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0812  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  34.59 
 
 		 946 aa  461  9.999999999999999e-129  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0912  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.81 
 
 		 768 aa  394  1e-108  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.137299  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0259  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.55 
 
 		 742 aa  309  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4346  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.33 
 
 		 759 aa  302  2e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0491496  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4214  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.45 
 
 		 759 aa  300  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317587  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4362  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.57 
 
 		 767 aa  298  3e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516732  normal  0.595476 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0005  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.4 
 
 		 737 aa  295  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0508779 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1135  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.27 
 
 		 742 aa  293  8e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4369  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.96 
 
 		 759 aa  293  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8978  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  32.1 
 
 		 765 aa  292  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05940  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.78 
 
 		 798 aa  292  2e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.11 
 
 		 761 aa  292  3e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0504799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.19 
 
 		 751 aa  291  3e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.843538  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0008  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.34 
 
 		 737 aa  290  8e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.70389  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3339  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.16 
 
 		 751 aa  288  5e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0275  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.51 
 
 		 739 aa  285  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.59 
 
 		 739 aa  285  3.0000000000000004e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0266  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.78 
 
 		 739 aa  284  6.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0340  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.41 
 
 		 739 aa  284  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.39 
 
 		 739 aa  284  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5056  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.49 
 
 		 807 aa  284  7.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.51 
 
 		 739 aa  282  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1619  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.21 
 
 		 739 aa  282  2e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4090  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.87 
 
 		 749 aa  282  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0367  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.38 
 
 		 739 aa  281  4e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0281  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.51 
 
 		 739 aa  281  5e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0294  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.51 
 
 		 739 aa  281  5e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.51 
 
 		 739 aa  281  5e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0269  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.26 
 
 		 739 aa  280  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0708  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.37 
 
 		 740 aa  279  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1019  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.82 
 
 		 761 aa  278  3e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1053  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.33 
 
 		 743 aa  278  3e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.207294 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit II  30.26 
 
 		 727 aa  278  3e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262148  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6876  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.95 
 
 		 752 aa  278  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0291  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.86 
 
 		 787 aa  278  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3970  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.35 
 
 		 724 aa  278  5e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0786403 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.59 
 
 		 758 aa  277  6e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6405  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.26 
 
 		 758 aa  277  6e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.773242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0064  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.38 
 
 		 746 aa  277  7e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.250893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.26 
 
 		 764 aa  277  9e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.252255  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0723  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.38 
 
 		 738 aa  276  1.0000000000000001e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3742  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.41 
 
 		 767 aa  276  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.182155 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0521  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.74 
 
 		 733 aa  276  2.0000000000000002e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3688  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.93 
 
 		 767 aa  275  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1310  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.3 
 
 		 760 aa  274  5.000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.831791  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1133  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.31 
 
 		 741 aa  274  5.000000000000001e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3636  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.73 
 
 		 777 aa  274  7e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2586  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.94 
 
 		 739 aa  273  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0010  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.11 
 
 		 741 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0011  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.77 
 
 		 741 aa  271  5e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3587  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.94 
 
 		 782 aa  271  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.565249 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.49 
 
 		 777 aa  270  7e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.400519  normal  0.10064 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2074  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.67 
 
 		 754 aa  270  7e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.905222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0012  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.02 
 
 		 741 aa  270  7e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2366  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.52 
 
 		 741 aa  270  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0540  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.88 
 
 		 772 aa  270  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1752  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.99 
 
 		 736 aa  269  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0678  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.16 
 
 		 769 aa  269  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02500  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.3 
 
 		 768 aa  269  2e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0155  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.01 
 
 		 769 aa  268  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513467  normal  0.0402011 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2051  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.08 
 
 		 715 aa  268  4e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00206417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>