More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1829 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0379  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.95 
 
 		 953 aa  889    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1634  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II, putative  43.5 
 
 		 996 aa  746    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.494383  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.67 
 
 		 953 aa  870    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0779511  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2622  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.42 
 
 		 985 aa  858    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0168341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1795  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.82 
 
 		 981 aa  832    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0956476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0620  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.3 
 
 		 945 aa  681    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1328  phosphoribosylformylglycinamidine synthase glutamine amidotransferase subunit  41.5 
 
 		 1020 aa  718    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2066  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.04 
 
 		 996 aa  729    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0213  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.38 
 
 		 973 aa  805    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1941  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.19 
 
 		 996 aa  780    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3191  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  42.19 
 
 		 993 aa  708    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0198403  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2484  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  42.79 
 
 		 1004 aa  736    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2411  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  41.96 
 
 		 995 aa  692    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147677 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1889  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  42.59 
 
 		 996 aa  708    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2699  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.25 
 
 		 996 aa  746    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3013  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  42.9 
 
 		 993 aa  720    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2372  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.78 
 
 		 962 aa  709    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2331  AIR synthase related protein  42.79 
 
 		 996 aa  711    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1829  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  100 
 
 		 966 aa  1996    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0361  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.43 
 
 		 953 aa  869    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00613542  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1913  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  42.59 
 
 		 999 aa  684    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1170  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.78 
 
 		 947 aa  686    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1147  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.75 
 
 		 996 aa  709    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540487  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0206  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  42.31 
 
 		 993 aa  721    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.76 
 
 		 959 aa  797    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.384894  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1279  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.27 
 
 		 766 aa  631  1e-179  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0534  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.21 
 
 		 800 aa  610  1e-173  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.6525 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1061  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  40.61 
 
 		 979 aa  590  1e-167  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.726589  normal  0.0660038 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1496  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  39.37 
 
 		 989 aa  591  1e-167  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  39.55 
 
 		 989 aa  588  1e-166  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.783256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  39.41 
 
 		 989 aa  586  1e-166  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1183  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  36.97 
 
 		 993 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0913  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II domain-containing protein  42.09 
 
 		 1032 aa  566  1e-160  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.294336  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0658  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  40.59 
 
 		 1004 aa  566  1e-160  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0472  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  40.06 
 
 		 982 aa  568  1e-160  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.311423  normal  0.43995 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1629  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  39.07 
 
 		 979 aa  568  1e-160  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.521268  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0351  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.72 
 
 		 1007 aa  558  1e-157  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0482  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  37.28 
 
 		 998 aa  547  1e-154  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0912  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.46 
 
 		 768 aa  490  1e-137  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.137299  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0432  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  37.22 
 
 		 1009 aa  478  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117579  normal  0.85361 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0812  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.21 
 
 		 946 aa  469  1.0000000000000001e-131  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  35.31 
 
 		 758 aa  372  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0521  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.63 
 
 		 733 aa  365  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0259  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.7 
 
 		 742 aa  357  7.999999999999999e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1135  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.42 
 
 		 742 aa  352  1e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  34.15 
 
 		 761 aa  350  9e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0504799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0158  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.89 
 
 		 765 aa  345  2e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.89 
 
 		 739 aa  345  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0312  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  35.32 
 
 		 758 aa  345  2.9999999999999997e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0340  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.77 
 
 		 739 aa  344  4e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2366  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.55 
 
 		 741 aa  343  9e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0005  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.29 
 
 		 737 aa  343  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0508779 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1184  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.98 
 
 		 735 aa  342  2e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0155  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  34.96 
 
 		 769 aa  341  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513467  normal  0.0402011 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.66 
 
 		 739 aa  341  4e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0367  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.89 
 
 		 739 aa  341  4e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22130  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.61 
 
 		 733 aa  341  4e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.759305  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.89 
 
 		 739 aa  340  5e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.89 
 
 		 739 aa  340  5e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0281  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.89 
 
 		 739 aa  340  5e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0294  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.89 
 
 		 739 aa  340  5e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0266  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.19 
 
 		 739 aa  340  7e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2048  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.44 
 
 		 733 aa  340  7e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1053  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.21 
 
 		 743 aa  340  9e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.207294 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0064  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.98 
 
 		 746 aa  339  9.999999999999999e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.250893  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0269  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.19 
 
 		 739 aa  339  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0275  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.77 
 
 		 739 aa  339  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0708  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.63 
 
 		 740 aa  338  3.9999999999999995e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6876  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.95 
 
 		 752 aa  337  5.999999999999999e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0008  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  34.13 
 
 		 737 aa  336  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.70389  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0028  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.15 
 
 		 752 aa  336  1e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2051  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.47 
 
 		 715 aa  335  2e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00206417  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1015  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.87 
 
 		 736 aa  335  4e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0723  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.71 
 
 		 738 aa  334  4e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5401  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.99 
 
 		 735 aa  333  9e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6405  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.95 
 
 		 758 aa  333  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.773242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5056  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.69 
 
 		 807 aa  333  1e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2586  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32 
 
 		 739 aa  332  3e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236603 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3970  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.46 
 
 		 724 aa  330  5.0000000000000004e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0786403 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1934  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.2 
 
 		 743 aa  330  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1619  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.69 
 
 		 739 aa  329  1.0000000000000001e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3592  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  35.05 
 
 		 755 aa  328  2.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.911773  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5410  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.71 
 
 		 764 aa  329  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539592  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1643  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II (FGAM synthase II)  32.13 
 
 		 780 aa  328  3e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1591  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.77 
 
 		 736 aa  328  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1127  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  34.12 
 
 		 741 aa  328  3e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4321  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.33 
 
 		 764 aa  328  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4090  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.11 
 
 		 749 aa  328  4.0000000000000003e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0863  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.98 
 
 		 737 aa  327  7e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.472862  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1650  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II (FGAM synthase II)  32.21 
 
 		 780 aa  325  2e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0540  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.33 
 
 		 772 aa  325  2e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10818  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.87 
 
 		 754 aa  325  3e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0131091  normal  0.548571 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.44 
 
 		 736 aa  324  5e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.67 
 
 		 758 aa  324  5e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.69 
 
 		 764 aa  324  5e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.252255  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2144  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.02 
 
 		 744 aa  324  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.470328  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0536  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.85 
 
 		 715 aa  323  8e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0829  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.65 
 
 		 740 aa  323  9.999999999999999e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0837  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.65 
 
 		 740 aa  323  9.999999999999999e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41714  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0010  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.93 
 
 		 741 aa  323  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>