More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0499 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2183  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  52.25 
 
 
1252 aa  1273    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0025  phosphoribosylformylglycinamidine synthase, putative  47.26 
 
 
1241 aa  1142    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.435502  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1471  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  61.53 
 
 
1284 aa  1654    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0680923  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1031  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  54.9 
 
 
1251 aa  1366    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2106  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  55.1 
 
 
1244 aa  1407    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0499  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  100 
 
 
1256 aa  2590    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000277776  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0671  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  55.85 
 
 
1266 aa  1432    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0669  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  55.65 
 
 
1266 aa  1428    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0050  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II (FGAM synthetase)  46.81 
 
 
1241 aa  1141    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0351  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  55 
 
 
1251 aa  1396    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0046  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  52.31 
 
 
1236 aa  1288    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1107  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  43.73 
 
 
1631 aa  1014    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06520  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  55.4 
 
 
1243 aa  1377    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.57325 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3350  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  58.2 
 
 
1293 aa  1493    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.611392  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13720  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  53.22 
 
 
1254 aa  1337    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0861  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  55.64 
 
 
1244 aa  1380    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0300  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  57.15 
 
 
1231 aa  1435    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0554  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  67.01 
 
 
1256 aa  1787    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.749527  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0262  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  55.81 
 
 
1238 aa  1391    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.414169  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2372  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.82 
 
 
962 aa  307  7e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1170  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.53 
 
 
947 aa  299  2e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0620  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.81 
 
 
945 aa  296  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0361  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.14 
 
 
953 aa  270  8.999999999999999e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00613542  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.46 
 
 
953 aa  269  2.9999999999999995e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0779511  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0379  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.99 
 
 
953 aa  266  2e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1829  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.41 
 
 
966 aa  264  1e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1795  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.65 
 
 
981 aa  263  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0956476  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.78 
 
 
959 aa  259  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.384894  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0213  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.22 
 
 
973 aa  255  4.0000000000000004e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1279  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.11 
 
 
766 aa  253  2e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2622  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.08 
 
 
985 aa  252  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0168341  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.67 
 
 
989 aa  234  1e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1496  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  27.05 
 
 
989 aa  229  2e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.34 
 
 
989 aa  228  4e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.783256  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1061  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.51 
 
 
979 aa  228  6e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.726589  normal  0.0660038 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2484  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.62 
 
 
1004 aa  227  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1328  phosphoribosylformylglycinamidine synthase glutamine amidotransferase subunit  24.78 
 
 
1020 aa  225  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1629  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.69 
 
 
979 aa  212  3e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.521268  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1634  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II, putative  22.93 
 
 
996 aa  211  5e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.494383  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0206  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.45 
 
 
993 aa  211  8e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1183  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.21 
 
 
993 aa  211  1e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2411  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.81 
 
 
995 aa  210  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147677 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0472  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.42 
 
 
982 aa  209  4e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.311423  normal  0.43995 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2699  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.23 
 
 
996 aa  208  6e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1941  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.43 
 
 
996 aa  203  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2066  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.11 
 
 
996 aa  202  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1889  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.37 
 
 
996 aa  202  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1147  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.12 
 
 
996 aa  202  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540487  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1913  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.44 
 
 
999 aa  201  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3191  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.46 
 
 
993 aa  199  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0198403  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3013  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.2 
 
 
993 aa  196  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0658  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.85 
 
 
1004 aa  195  4e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2331  AIR synthase related protein  25.26 
 
 
996 aa  195  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0545  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.21 
 
 
1341 aa  194  1e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.226471  unclonable  0.00000000702475 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0351  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.46 
 
 
1007 aa  192  4e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0913  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II domain-containing protein  26.35 
 
 
1032 aa  191  7e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.294336  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2350  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.21 
 
 
1293 aa  189  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0534  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.75 
 
 
800 aa  188  7e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.6525 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0912  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.28 
 
 
768 aa  186  2.0000000000000003e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.137299  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1269  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.5 
 
 
1298 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.39 
 
 
1293 aa  187  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000193442  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1238  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.15 
 
 
1293 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.09 
 
 
1293 aa  187  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3414  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.45 
 
 
1298 aa  186  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1309  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.06 
 
 
1293 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1240  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.98 
 
 
1293 aa  185  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01150  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.64 
 
 
1298 aa  184  9.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1459  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.41 
 
 
1298 aa  184  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1141  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.15 
 
 
1293 aa  183  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1667  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.78 
 
 
1231 aa  181  8e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.209803  normal  0.519263 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3138  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.06 
 
 
1293 aa  180  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.217265 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3287  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.72 
 
 
1293 aa  180  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2994  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.72 
 
 
1293 aa  180  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.89 
 
 
1293 aa  181  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004280  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.77 
 
 
1297 aa  179  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0187  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.13 
 
 
1342 aa  179  2e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0359438  normal  0.315795 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0999  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.32 
 
 
1298 aa  180  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.346614 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0812  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.3 
 
 
946 aa  180  2e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0116  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.35 
 
 
1221 aa  179  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.722762  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1383  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.63 
 
 
1293 aa  179  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1501  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.83 
 
 
1291 aa  178  6e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0395  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.07 
 
 
1297 aa  177  8e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1301  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.84 
 
 
1293 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2642  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.78 
 
 
1293 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.873456  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4189  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.83 
 
 
1299 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06195  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.66 
 
 
1214 aa  176  2.9999999999999996e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0746  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.29 
 
 
1296 aa  176  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0643  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.29 
 
 
1306 aa  176  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0208  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.17 
 
 
1345 aa  175  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0384538  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3318  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.79 
 
 
1297 aa  175  5.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1503  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.9 
 
 
1297 aa  174  7.999999999999999e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1564  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.6 
 
 
1293 aa  174  9e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1078  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.5 
 
 
1299 aa  173  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.528102  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3203  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.19 
 
 
1311 aa  173  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1317  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.56 
 
 
1293 aa  173  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39660  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.24 
 
 
1298 aa  172  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1223  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.34 
 
 
1295 aa  172  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1034  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.46 
 
 
1299 aa  172  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.559579  normal  0.890548 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2710  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.37 
 
 
1295 aa  172  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2922  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.96 
 
 
1295 aa  171  8e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>