More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0861 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1107  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  44.16 
 
 
1631 aa  1001    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06520  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  69.61 
 
 
1243 aa  1798    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.57325 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13720  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  71.85 
 
 
1254 aa  1844    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0025  phosphoribosylformylglycinamidine synthase, putative  48.33 
 
 
1241 aa  1144    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.435502  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3350  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  52.59 
 
 
1293 aa  1308    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.611392  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0262  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  75.78 
 
 
1238 aa  1949    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.414169  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0300  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  59.46 
 
 
1231 aa  1459    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0554  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  55.57 
 
 
1256 aa  1369    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.749527  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0671  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  51.46 
 
 
1266 aa  1259    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0669  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  51.7 
 
 
1266 aa  1262    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1031  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  70.92 
 
 
1251 aa  1865    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2106  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  49.21 
 
 
1244 aa  1167    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0046  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  48.05 
 
 
1236 aa  1164    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0050  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II (FGAM synthetase)  48.45 
 
 
1241 aa  1146    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1471  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  54.09 
 
 
1284 aa  1345    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0680923  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0499  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  55.64 
 
 
1256 aa  1380    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000277776  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0861  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  100 
 
 
1244 aa  2555    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0351  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  69.14 
 
 
1251 aa  1793    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2183  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  48.11 
 
 
1252 aa  1166    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2372  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.5 
 
 
962 aa  281  7e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2622  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.1 
 
 
985 aa  268  4e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0168341  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1829  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.25 
 
 
966 aa  268  5.999999999999999e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1170  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.09 
 
 
947 aa  258  6e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0620  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.41 
 
 
945 aa  256  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1795  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.66 
 
 
981 aa  254  6e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0956476  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0379  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.17 
 
 
953 aa  251  5e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.41 
 
 
953 aa  250  1e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0779511  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0361  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.79 
 
 
953 aa  249  2e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00613542  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.06 
 
 
959 aa  240  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.384894  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0213  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.74 
 
 
973 aa  231  8e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1061  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.98 
 
 
979 aa  221  7.999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.726589  normal  0.0660038 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1629  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  27.36 
 
 
979 aa  219  2.9999999999999998e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.521268  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0472  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.62 
 
 
982 aa  216  2.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.311423  normal  0.43995 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1279  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.45 
 
 
766 aa  212  3e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2699  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.22 
 
 
996 aa  210  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.12 
 
 
989 aa  207  1e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1496  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26 
 
 
989 aa  204  6e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1147  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.7 
 
 
996 aa  204  6e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540487  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2484  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.74 
 
 
1004 aa  204  8e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0395  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.56 
 
 
1297 aa  202  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1941  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.41 
 
 
996 aa  200  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3013  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.86 
 
 
993 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2411  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.59 
 
 
995 aa  199  3e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147677 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0498  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.3 
 
 
1295 aa  199  4.0000000000000005e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.46 
 
 
989 aa  196  3e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.783256  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2350  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.14 
 
 
1293 aa  195  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004280  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.47 
 
 
1297 aa  195  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01396  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.74 
 
 
1295 aa  194  8e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1328  phosphoribosylformylglycinamidine synthase glutamine amidotransferase subunit  26.69 
 
 
1020 aa  193  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1564  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.91 
 
 
1293 aa  192  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1634  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II, putative  26.36 
 
 
996 aa  192  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.494383  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3414  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.02 
 
 
1298 aa  192  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1269  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.37 
 
 
1298 aa  191  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4189  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.24 
 
 
1299 aa  191  8e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1078  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.34 
 
 
1299 aa  190  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.528102  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0116  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.02 
 
 
1221 aa  190  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.722762  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1223  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.08 
 
 
1295 aa  191  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1183  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.49 
 
 
993 aa  189  3e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2066  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.28 
 
 
996 aa  189  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1317  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.48 
 
 
1293 aa  189  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1301  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26 
 
 
1293 aa  189  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1459  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.18 
 
 
1298 aa  188  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2484  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.53 
 
 
1301 aa  188  5e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234479  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1889  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.36 
 
 
996 aa  188  6e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4001  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.11 
 
 
1299 aa  188  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00163478  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0206  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.81 
 
 
993 aa  188  6e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0750  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.45 
 
 
1309 aa  188  7e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1037  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.18 
 
 
1299 aa  187  8e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3191  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.74 
 
 
993 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0198403  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75569  5'-phosphoribosylformyl glycinamidine synthetase  25.15 
 
 
1343 aa  186  3e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0273535 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1141  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.19 
 
 
1293 aa  186  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0902  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.39 
 
 
1345 aa  186  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0999  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.78 
 
 
1298 aa  185  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.346614 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2331  AIR synthase related protein  25.21 
 
 
996 aa  185  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0296  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.54 
 
 
1234 aa  184  1e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.391304 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0534  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.54 
 
 
800 aa  183  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.6525 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4724  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.93 
 
 
1217 aa  182  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375625  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1034  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.02 
 
 
1299 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.559579  normal  0.890548 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3052  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.11 
 
 
1295 aa  182  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2768  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25 
 
 
1295 aa  180  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2354  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.6 
 
 
1283 aa  180  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2943  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25 
 
 
1295 aa  180  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1913  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.9 
 
 
999 aa  180  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1988  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.6 
 
 
1283 aa  180  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0545  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.15 
 
 
1341 aa  180  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.226471  unclonable  0.00000000702475 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1082  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.61 
 
 
1295 aa  179  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.60233  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15740  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.35 
 
 
1298 aa  180  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.989806  hitchhiker  0.000000174992 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2727  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.13 
 
 
1295 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1240  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.7 
 
 
1293 aa  178  7e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1550  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.03 
 
 
1292 aa  177  9e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00364402  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1501  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.11 
 
 
1291 aa  177  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3339  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.26 
 
 
751 aa  177  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01150  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.57 
 
 
1298 aa  177  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17772  predicted protein  24.65 
 
 
1313 aa  177  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2090  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.8 
 
 
1223 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1354  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.31 
 
 
1298 aa  177  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.297913  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3042  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.55 
 
 
1295 aa  176  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.631936  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1238  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.61 
 
 
1293 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1309  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.8 
 
 
1293 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2831  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.83 
 
 
1295 aa  176  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>