More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0704 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0704  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  467  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00127495  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0246  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.91 
 
 		 225 aa  291  8e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0272164  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  48.91 
 
 		 224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 256 aa  206  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  43.23 
 
 		 241 aa  206  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  43.23 
 
 		 241 aa  206  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.23 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  42.22 
 
 		 223 aa  202  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  42.67 
 
 		 223 aa  203  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  42.67 
 
 		 223 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  42.67 
 
 		 223 aa  203  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  42.22 
 
 		 223 aa  202  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  42.22 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  42.67 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  42.67 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2915  two component transcriptional regulator, winged helix family  44 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.892207  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  42.22 
 
 		 223 aa  202  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1055  DNA-binding response regulator SrrA  44.59 
 
 		 241 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.48 
 
 		 240 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 223 aa  199  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  43.23 
 
 		 230 aa  198  6e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4198  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.33 
 
 		 226 aa  197  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.17 
 
 		 223 aa  197  7.999999999999999e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1399  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129694  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1200  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 238 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2250  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 225 aa  195  6e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000295266  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.92 
 
 		 226 aa  194  7e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1601  DNA-binding response regulator ResD  43.04 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953648  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5471  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 221 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00800002  hitchhiker  0.0013378 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1386  DNA-binding response regulator ResD  43.04 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1359  response regulator  43.04 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1358  response regulator  43.04 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1497  DNA-binding response regulator ResD  43.04 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862661  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1637  DNA-binding response regulator ResD  43.04 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0246031  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1569  DNA-binding response regulator ResD  43.04 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45334e-32 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.22 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3814  DNA-binding response regulator ResD  43.04 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.95849e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1531  DNA-binding response regulator ResD  43.04 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  41.85 
 
 		 229 aa  192  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3288  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 225 aa  191  8e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1606  DNA-binding response regulator  42.41 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  hitchhiker  0.0000000112462 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2855  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000952101  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3709  DNA-binding response regulator  42.41 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2662  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.72 
 
 		 231 aa  190  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2811  DNA-binding response regulator  42.11 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  42.54 
 
 		 228 aa  189  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 223 aa  190  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2749  transcription response regulator-like protein  40.36 
 
 		 221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00061025  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3620  DNA-binding response regulator  42.41 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0597824  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3396  DNA-binding response regulator  42.41 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000765328  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3358  transcriptional regulatory protein  42.41 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200566  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3612  DNA-binding response regulator  42.41 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.20142e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3627  DNA-binding response regulator  42.41 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3308  transcriptional regulatory protein  42.41 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000872353  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3661  DNA-binding response regulator  42.41 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2180  DNA-binding response regulator  42.11 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1891  DNA-binding response regulator  42.11 
 
 		 223 aa  189  4e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.35 
 
 		 219 aa  188  5.999999999999999e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00404304  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.43 
 
 		 233 aa  188  5.999999999999999e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  42.17 
 
 		 239 aa  187  8e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  42.17 
 
 		 239 aa  187  8e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2563  transcriptional regulatory protein ResD  40.71 
 
 		 221 aa  187  9e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803163 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  38.1 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2424  two component transcriptional regulator  39.56 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245011  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.57 
 
 		 236 aa  186  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.74 
 
 		 231 aa  184  8e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.42 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  38.1 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1658  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.97 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515101  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0402  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.49 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2911  two component transcriptional regulator  39.11 
 
 		 228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0707  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 227 aa  182  5.0000000000000004e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 239 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2159  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 		 227 aa  181  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00177162  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  38.86 
 
 		 236 aa  181  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 239 aa  181  7e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4952  DNA-binding response regulator  39.3 
 
 		 229 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.57 
 
 		 224 aa  180  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  37.89 
 
 		 229 aa  180  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.04 
 
 		 236 aa  180  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.1 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  38.94 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.57 
 
 		 242 aa  179  4e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4546  DNA-binding response regulator  39.3 
 
 		 229 aa  179  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4564  DNA-binding response regulator  38.86 
 
 		 229 aa  178  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4969  DNA-binding response regulator  38.43 
 
 		 229 aa  178  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3429  two component transcriptional regulator  39.57 
 
 		 233 aa  177  8e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0608192  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.77 
 
 		 235 aa  177  9e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  37 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4932  DNA-binding response regulator  38.86 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4707  DNA-binding response regulator  38.86 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5068  DNA-binding response regulator  38.86 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  38.53 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3085  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.05 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000315463  hitchhiker  0.000599707 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4646  two component transcriptional regulator  38.43 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>