102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2034 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2034  protein of unknown function DUF62  100 
 
 
268 aa  548  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1832  protein of unknown function DUF62  55.43 
 
 
277 aa  300  2e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2370  protein of unknown function DUF62  54.26 
 
 
274 aa  275  7e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2027  hypothetical protein  47.53 
 
 
280 aa  261  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.920292  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0408  protein of unknown function DUF62  47.89 
 
 
277 aa  239  5e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  45.9 
 
 
1827 aa  229  3e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0388  hypothetical protein  43.63 
 
 
267 aa  223  3e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.496549 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1293  protein of unknown function DUF62  41.13 
 
 
264 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1320  protein of unknown function DUF62  40.75 
 
 
264 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0998105 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3652  hypothetical protein  41.48 
 
 
272 aa  203  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000216585  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3794  hypothetical protein  39.39 
 
 
266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1448  protein of unknown function DUF62  39.85 
 
 
273 aa  192  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4783  hypothetical protein  39.41 
 
 
271 aa  192  4e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0668  hypothetical protein  39.69 
 
 
252 aa  192  5e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.721814  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0702  hypothetical protein  40.68 
 
 
262 aa  190  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00401534  normal  0.259483 
 
 
-
 
NC_002936  DET1548  hypothetical protein  40.57 
 
 
282 aa  187  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4209  hypothetical protein  40.07 
 
 
269 aa  184  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.31115  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3530  hypothetical protein  40.88 
 
 
276 aa  183  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2641  protein of unknown function DUF62  40.98 
 
 
261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233531 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0002  hypothetical protein  40.15 
 
 
263 aa  182  6e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.246824  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0603  hypothetical protein  43.02 
 
 
262 aa  179  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1067  hypothetical protein  40.07 
 
 
259 aa  177  2e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.0014432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1378  hypothetical protein  39.93 
 
 
280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.278488  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3529  hypothetical protein  38.96 
 
 
262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.879853  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2209  hypothetical protein  38.7 
 
 
261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.171783  normal  0.703654 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1350  protein of unknown function DUF62  37.24 
 
 
254 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0963991  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0919  hypothetical protein  39.46 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.628003  normal  0.0175561 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2246  protein of unknown function DUF62  38.37 
 
 
274 aa  163  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0792  protein of unknown function DUF62  36.06 
 
 
272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2013  hypothetical protein  38.06 
 
 
269 aa  160  2e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00694223 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1901  hypothetical protein  37.98 
 
 
252 aa  160  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1546  hypothetical protein  35.94 
 
 
298 aa  159  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.890208  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1405  hypothetical protein  36.82 
 
 
261 aa  158  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1364  hypothetical protein  35.77 
 
 
261 aa  157  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0427667  hitchhiker  0.000196172 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1405  hypothetical protein  36.7 
 
 
278 aa  156  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.01301  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0608  hypothetical protein  34.73 
 
 
262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.425504  normal  0.0157157 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1230  protein of unknown function DUF62  35.69 
 
 
278 aa  155  8e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1168  protein of unknown function DUF62  34.35 
 
 
244 aa  155  8e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0614  protein of unknown function DUF62  37.55 
 
 
252 aa  155  9e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0140429  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0080  hypothetical protein  38.15 
 
 
252 aa  154  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.158966  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3689  protein of unknown function DUF62  40 
 
 
258 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235553  normal  0.0332263 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1438  hypothetical protein  36.78 
 
 
263 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3306  hypothetical protein  36.4 
 
 
267 aa  151  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0271  hypothetical protein  34.34 
 
 
263 aa  149  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293388  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0269  hypothetical protein  34.34 
 
 
263 aa  149  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.136318  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1502  protein of unknown function DUF62  37.12 
 
 
263 aa  148  7e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.937007  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1597  protein of unknown function DUF62  37.12 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1391  protein of unknown function DUF62  34.08 
 
 
295 aa  146  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8926  protein of unknown function DUF62  37.27 
 
 
270 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2069  hypothetical protein  36.64 
 
 
262 aa  145  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.119618 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2362  hypothetical protein  37.25 
 
 
263 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.817205  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2108  protein of unknown function DUF62  34.36 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.111438 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1507  hypothetical protein  37.8 
 
 
256 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.941751  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1640  protein of unknown function DUF62  39.36 
 
 
244 aa  138  7.999999999999999e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0216  hypothetical protein  33.07 
 
 
263 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2703  hypothetical protein  31.82 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1812  hypothetical protein  36.33 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0204  hypothetical protein  36.05 
 
 
250 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1412  hypothetical protein  32.05 
 
 
268 aa  134  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.303049  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0005  hypothetical protein  33.08 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.148664 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0791  hypothetical protein  37.26 
 
 
265 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244115  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0432  hypothetical protein  36.43 
 
 
242 aa  132  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4936  protein of unknown function DUF62  34.42 
 
 
297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.455313  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3201  protein of unknown function DUF62  36.23 
 
 
254 aa  129  7.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.171976 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0876  hypothetical protein  30.74 
 
 
266 aa  128  9.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000358269  normal  0.0734484 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2297  hypothetical protein  32.3 
 
 
242 aa  125  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.515706  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0222  hypothetical protein  32.08 
 
 
281 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1909  hypothetical protein  32.51 
 
 
299 aa  123  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0485  hypothetical protein  32.69 
 
 
254 aa  122  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.757673 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07650  hypothetical protein  32.62 
 
 
279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2710  hypothetical protein  32.12 
 
 
282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.758971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2767  hypothetical protein  32.12 
 
 
282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0260268  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4274  hypothetical protein  30.74 
 
 
300 aa  119  7.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1498  hypothetical protein  32.04 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000610491  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4180  hypothetical protein  35.1 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0314265 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5253  hypothetical protein  35.1 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2899  protein of unknown function DUF62  35.23 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0750848  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03690  conserved hypothetical protein  34.62 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03639  hypothetical protein  34.62 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0862  protein of unknown function DUF62  31.88 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2821  protein of unknown function DUF62  33.21 
 
 
299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000372456  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0382  protein of unknown function DUF62  30.11 
 
 
301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2298  hypothetical protein  32.58 
 
 
245 aa  115  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.452594  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6514  protein of unknown function DUF62  30.8 
 
 
298 aa  115  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0914028  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1026  hypothetical protein  29.81 
 
 
283 aa  113  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0749634  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6138  hypothetical protein  31.58 
 
 
304 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.500966  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1485  hypothetical protein  33.07 
 
 
239 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.275435  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0566  protein of unknown function DUF62  33.97 
 
 
270 aa  112  9e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0505  protein of unknown function DUF62  33.59 
 
 
305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2242  hypothetical protein  32.55 
 
 
315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.12731  decreased coverage  0.00672311 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1036  protein of unknown function DUF62  30.8 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1862  protein of unknown function DUF62  31.03 
 
 
259 aa  107  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1975  hypothetical protein  40.27 
 
 
292 aa  105  7e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.126965  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0345  hypothetical protein  31.67 
 
 
282 aa  103  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00540766  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0831  hypothetical protein  30.86 
 
 
265 aa  101  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2970  hypothetical protein  28.09 
 
 
261 aa  100  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00085144 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08376  hypothetical protein  27.34 
 
 
277 aa  99.8  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0139079  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2724  hypothetical protein  28.88 
 
 
276 aa  96.7  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50638  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0478  hypothetical protein  30.18 
 
 
289 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2825  protein of unknown function DUF62  28.26 
 
 
359 aa  85.9  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>