102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1975 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1975  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  598  1e-170  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.126965  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1498  hypothetical protein  50.35 
 
 
282 aa  290  2e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000610491  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2710  hypothetical protein  47.69 
 
 
282 aa  280  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.758971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2767  hypothetical protein  47.69 
 
 
282 aa  280  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0260268  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0345  hypothetical protein  48.59 
 
 
282 aa  268  1e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00540766  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07650  hypothetical protein  48.38 
 
 
279 aa  268  1e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03690  conserved hypothetical protein  47 
 
 
300 aa  266  4e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03639  hypothetical protein  47 
 
 
300 aa  266  4e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5253  hypothetical protein  45.94 
 
 
300 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4274  hypothetical protein  46.29 
 
 
300 aa  258  6e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4180  hypothetical protein  46.29 
 
 
300 aa  258  7e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0314265 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0382  protein of unknown function DUF62  45 
 
 
301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0505  protein of unknown function DUF62  44.09 
 
 
305 aa  245  6e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4936  protein of unknown function DUF62  43.37 
 
 
297 aa  244  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.455313  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6514  protein of unknown function DUF62  42.11 
 
 
298 aa  232  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0914028  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2821  protein of unknown function DUF62  42.01 
 
 
299 aa  228  7e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000372456  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1546  hypothetical protein  38.16 
 
 
298 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.890208  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0388  hypothetical protein  32.25 
 
 
267 aa  125  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.496549 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1067  hypothetical protein  34.81 
 
 
259 aa  125  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.0014432 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2641  protein of unknown function DUF62  35.42 
 
 
261 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233531 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1293  protein of unknown function DUF62  33.94 
 
 
264 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1320  protein of unknown function DUF62  39.8 
 
 
264 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0998105 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0792  protein of unknown function DUF62  32.71 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2370  protein of unknown function DUF62  31.15 
 
 
274 aa  115  7.999999999999999e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3794  hypothetical protein  34.62 
 
 
266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4783  hypothetical protein  36.55 
 
 
271 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0271  hypothetical protein  29.7 
 
 
263 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293388  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0269  hypothetical protein  29.7 
 
 
263 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.136318  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3530  hypothetical protein  33.33 
 
 
276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1350  protein of unknown function DUF62  36.16 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0963991  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0002  hypothetical protein  32.13 
 
 
263 aa  110  3e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.246824  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1230  protein of unknown function DUF62  27.7 
 
 
278 aa  105  7e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 
1827 aa  105  7e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0222  hypothetical protein  31.94 
 
 
281 aa  105  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2034  protein of unknown function DUF62  40.27 
 
 
268 aa  105  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1405  hypothetical protein  30.5 
 
 
278 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.01301  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4209  hypothetical protein  32.27 
 
 
269 aa  104  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.31115  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1026  hypothetical protein  28.83 
 
 
283 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0749634  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1448  protein of unknown function DUF62  31.73 
 
 
273 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0702  hypothetical protein  30.8 
 
 
262 aa  103  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00401534  normal  0.259483 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1832  protein of unknown function DUF62  40.85 
 
 
277 aa  103  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1378  hypothetical protein  32.49 
 
 
280 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.278488  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2209  hypothetical protein  27.46 
 
 
261 aa  102  7e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.171783  normal  0.703654 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2013  hypothetical protein  29.35 
 
 
269 aa  101  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00694223 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1364  hypothetical protein  33.21 
 
 
261 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0427667  hitchhiker  0.000196172 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2027  hypothetical protein  38.73 
 
 
280 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.920292  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0408  protein of unknown function DUF62  30.28 
 
 
277 aa  100  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1412  hypothetical protein  30.71 
 
 
268 aa  99.4  6e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.303049  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1405  hypothetical protein  35.21 
 
 
261 aa  99.4  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1391  protein of unknown function DUF62  33.66 
 
 
295 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0566  protein of unknown function DUF62  32.97 
 
 
270 aa  98.6  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0791  hypothetical protein  30.97 
 
 
265 aa  97.4  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244115  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0668  hypothetical protein  36.48 
 
 
252 aa  97.4  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.721814  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0608  hypothetical protein  30.15 
 
 
262 aa  96.7  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.425504  normal  0.0157157 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3306  hypothetical protein  33.08 
 
 
267 aa  96.3  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1548  hypothetical protein  32.12 
 
 
282 aa  94.4  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2703  hypothetical protein  34.94 
 
 
334 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3529  hypothetical protein  31.63 
 
 
262 aa  94  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.879853  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0080  hypothetical protein  32.58 
 
 
252 aa  93.2  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.158966  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1640  protein of unknown function DUF62  36.84 
 
 
244 aa  92.4  8e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8926  protein of unknown function DUF62  29.26 
 
 
270 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0216  hypothetical protein  27.54 
 
 
263 aa  90.9  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0005  hypothetical protein  34.36 
 
 
267 aa  88.6  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.148664 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1901  hypothetical protein  29.76 
 
 
252 aa  88.6  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0919  hypothetical protein  36.05 
 
 
258 aa  88.2  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.628003  normal  0.0175561 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0603  hypothetical protein  29.64 
 
 
262 aa  87  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3652  hypothetical protein  29.14 
 
 
272 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000216585  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2069  hypothetical protein  32.84 
 
 
262 aa  85.9  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.119618 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0614  protein of unknown function DUF62  37.41 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0140429  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3689  protein of unknown function DUF62  41.55 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235553  normal  0.0332263 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2246  protein of unknown function DUF62  36.62 
 
 
274 aa  84  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3201  protein of unknown function DUF62  28.62 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.171976 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2242  hypothetical protein  27.99 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.12731  decreased coverage  0.00672311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6138  hypothetical protein  27.02 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.500966  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2108  protein of unknown function DUF62  32.87 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.111438 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0876  hypothetical protein  34.51 
 
 
266 aa  79  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000358269  normal  0.0734484 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1168  protein of unknown function DUF62  28.28 
 
 
244 aa  77  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1909  hypothetical protein  32.53 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1502  protein of unknown function DUF62  24.11 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.937007  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1438  hypothetical protein  30.87 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0204  hypothetical protein  28.44 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1597  protein of unknown function DUF62  28.57 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2362  hypothetical protein  24.53 
 
 
263 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.817205  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0432  hypothetical protein  32.34 
 
 
242 aa  68.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1507  hypothetical protein  25 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.941751  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1673  protein of unknown function DUF62  32.35 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2298  hypothetical protein  25.64 
 
 
245 aa  67  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.452594  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1812  hypothetical protein  30.99 
 
 
252 aa  65.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0485  hypothetical protein  29.94 
 
 
254 aa  63.9  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.757673 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2297  hypothetical protein  31.94 
 
 
242 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.515706  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0478  hypothetical protein  25 
 
 
289 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1036  protein of unknown function DUF62  23.88 
 
 
278 aa  57  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4666  protein of unknown function DUF62  22.69 
 
 
273 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.123818  hitchhiker  0.000000000393742 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08376  hypothetical protein  30 
 
 
277 aa  56.6  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0139079  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2825  protein of unknown function DUF62  25.56 
 
 
359 aa  55.8  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2970  hypothetical protein  27.67 
 
 
261 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00085144 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0862  protein of unknown function DUF62  25.72 
 
 
293 aa  52.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1485  hypothetical protein  34.83 
 
 
239 aa  52  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.275435  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2724  hypothetical protein  28.17 
 
 
276 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50638  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2899  protein of unknown function DUF62  30.46 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0750848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>