102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2703 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2703  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  680    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1391  protein of unknown function DUF62  39.38 
 
 
295 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2246  protein of unknown function DUF62  34.55 
 
 
274 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2069  hypothetical protein  35.78 
 
 
262 aa  155  9e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.119618 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1832  protein of unknown function DUF62  40.57 
 
 
277 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1350  protein of unknown function DUF62  34.42 
 
 
254 aa  139  7e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0963991  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2108  protein of unknown function DUF62  34.03 
 
 
272 aa  139  7e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.111438 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0002  hypothetical protein  33.84 
 
 
263 aa  138  2e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.246824  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2370  protein of unknown function DUF62  38.22 
 
 
274 aa  137  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4783  hypothetical protein  34.67 
 
 
271 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2209  hypothetical protein  36.44 
 
 
261 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.171783  normal  0.703654 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2034  protein of unknown function DUF62  31.82 
 
 
268 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2013  hypothetical protein  31.48 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00694223 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1448  protein of unknown function DUF62  32.51 
 
 
273 aa  132  9e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0216  hypothetical protein  32.31 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0408  protein of unknown function DUF62  37.76 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0388  hypothetical protein  38.29 
 
 
267 aa  130  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.496549 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2027  hypothetical protein  36.96 
 
 
280 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.920292  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1640  protein of unknown function DUF62  30.18 
 
 
244 aa  127  3e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3529  hypothetical protein  34.88 
 
 
262 aa  126  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.879853  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0919  hypothetical protein  34.04 
 
 
258 aa  125  1e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.628003  normal  0.0175561 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2641  protein of unknown function DUF62  28.97 
 
 
261 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233531 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1168  protein of unknown function DUF62  33.33 
 
 
244 aa  123  4e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1067  hypothetical protein  36.02 
 
 
259 aa  120  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.0014432 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  36.68 
 
 
1827 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0702  hypothetical protein  36.92 
 
 
262 aa  119  7e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00401534  normal  0.259483 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3794  hypothetical protein  34.91 
 
 
266 aa  119  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3530  hypothetical protein  34.82 
 
 
276 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1546  hypothetical protein  33.18 
 
 
298 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.890208  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0080  hypothetical protein  31.37 
 
 
252 aa  117  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.158966  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1293  protein of unknown function DUF62  33.79 
 
 
264 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1230  protein of unknown function DUF62  32.04 
 
 
278 aa  116  5e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0204  hypothetical protein  30.06 
 
 
250 aa  116  6e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4180  hypothetical protein  31.16 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0314265 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4274  hypothetical protein  31.16 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5253  hypothetical protein  30.7 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1320  protein of unknown function DUF62  31.51 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0998105 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2297  hypothetical protein  34.1 
 
 
242 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.515706  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4936  protein of unknown function DUF62  32.09 
 
 
297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.455313  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1405  hypothetical protein  36.99 
 
 
278 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.01301  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0876  hypothetical protein  32.42 
 
 
266 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000358269  normal  0.0734484 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1378  hypothetical protein  35.91 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.278488  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03690  conserved hypothetical protein  30.23 
 
 
300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1548  hypothetical protein  33.92 
 
 
282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0432  hypothetical protein  36.97 
 
 
242 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1502  protein of unknown function DUF62  38.28 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.937007  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03639  hypothetical protein  30.23 
 
 
300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4209  hypothetical protein  30.66 
 
 
269 aa  110  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.31115  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1597  protein of unknown function DUF62  37.8 
 
 
263 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0792  protein of unknown function DUF62  31.71 
 
 
272 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0608  hypothetical protein  35.98 
 
 
262 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.425504  normal  0.0157157 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0603  hypothetical protein  30.21 
 
 
262 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0485  hypothetical protein  37.5 
 
 
254 aa  107  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.757673 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1901  hypothetical protein  31.1 
 
 
252 aa  107  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0382  protein of unknown function DUF62  30.05 
 
 
301 aa  106  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0791  hypothetical protein  34.98 
 
 
265 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244115  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0614  protein of unknown function DUF62  33.74 
 
 
252 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0140429  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0271  hypothetical protein  29.09 
 
 
263 aa  104  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293388  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3652  hypothetical protein  33.79 
 
 
272 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000216585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0269  hypothetical protein  29.09 
 
 
263 aa  104  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.136318  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2362  hypothetical protein  37.38 
 
 
263 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.817205  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1909  hypothetical protein  36.19 
 
 
299 aa  103  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1498  hypothetical protein  33.02 
 
 
282 aa  103  6e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000610491  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0668  hypothetical protein  36.62 
 
 
252 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.721814  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2821  protein of unknown function DUF62  31.58 
 
 
299 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000372456  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3689  protein of unknown function DUF62  32.74 
 
 
258 aa  99.8  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235553  normal  0.0332263 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1412  hypothetical protein  28.19 
 
 
268 aa  99.4  8e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.303049  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1438  hypothetical protein  34.16 
 
 
263 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0005  hypothetical protein  31.25 
 
 
267 aa  97.4  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.148664 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6514  protein of unknown function DUF62  29.86 
 
 
298 aa  96.7  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0914028  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1485  hypothetical protein  35.27 
 
 
239 aa  96.3  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.275435  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0505  protein of unknown function DUF62  29.63 
 
 
305 aa  95.5  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8926  protein of unknown function DUF62  29.91 
 
 
270 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1975  hypothetical protein  34.94 
 
 
292 aa  94.4  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.126965  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07650  hypothetical protein  35.93 
 
 
279 aa  91.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2710  hypothetical protein  31.19 
 
 
282 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.758971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2767  hypothetical protein  31.19 
 
 
282 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0260268  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2242  hypothetical protein  37.56 
 
 
315 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.12731  decreased coverage  0.00672311 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1507  hypothetical protein  38.12 
 
 
256 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.941751  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1364  hypothetical protein  34.12 
 
 
261 aa  90.5  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0427667  hitchhiker  0.000196172 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1812  hypothetical protein  33.95 
 
 
252 aa  90.5  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3306  hypothetical protein  28.4 
 
 
267 aa  90.1  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0222  hypothetical protein  28.75 
 
 
281 aa  89.7  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1405  hypothetical protein  31.84 
 
 
261 aa  87.4  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2298  hypothetical protein  30.95 
 
 
245 aa  83.2  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.452594  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0345  hypothetical protein  26.09 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00540766  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0862  protein of unknown function DUF62  27.83 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1036  protein of unknown function DUF62  31.91 
 
 
278 aa  82  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2724  hypothetical protein  22.66 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50638  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0831  hypothetical protein  39.74 
 
 
265 aa  79  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6138  hypothetical protein  28.24 
 
 
304 aa  75.9  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.500966  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4666  protein of unknown function DUF62  23.2 
 
 
273 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.123818  hitchhiker  0.000000000393742 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2899  protein of unknown function DUF62  34.25 
 
 
259 aa  75.1  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0750848  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0566  protein of unknown function DUF62  28.57 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2825  protein of unknown function DUF62  30.41 
 
 
359 aa  70.1  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3201  protein of unknown function DUF62  31.94 
 
 
254 aa  69.7  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.171976 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1673  protein of unknown function DUF62  30.58 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08376  hypothetical protein  21.82 
 
 
277 aa  69.3  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0139079  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1862  protein of unknown function DUF62  24.34 
 
 
259 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1026  hypothetical protein  27.01 
 
 
283 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0749634  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>