102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2242 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2242  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  589  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.12731  decreased coverage  0.00672311 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1909  hypothetical protein  57 
 
 		 299 aa  265  7e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1364  hypothetical protein  49.67 
 
 		 261 aa  224  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0427667  hitchhiker  0.000196172 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0608  hypothetical protein  44.74 
 
 		 262 aa  211  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.425504  normal  0.0157157 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0792  protein of unknown function DUF62  47.88 
 
 		 272 aa  207  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1405  hypothetical protein  50 
 
 		 261 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0222  hypothetical protein  43.18 
 
 		 281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8926  protein of unknown function DUF62  42.57 
 
 		 270 aa  189  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3306  hypothetical protein  41.72 
 
 		 267 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0791  hypothetical protein  40.86 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244115  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0002  hypothetical protein  38.8 
 
 		 263 aa  152  1e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.246824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0603  hypothetical protein  43.44 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2209  hypothetical protein  36.49 
 
 		 261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.171783  normal  0.703654 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1067  hypothetical protein  34.44 
 
 		 259 aa  145  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0014432 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2370  protein of unknown function DUF62  32.66 
 
 		 274 aa  138  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1320  protein of unknown function DUF62  30.67 
 
 		 264 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0998105 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1293  protein of unknown function DUF62  30.92 
 
 		 264 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1168  protein of unknown function DUF62  30.54 
 
 		 244 aa  135  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2013  hypothetical protein  37.5 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00694223 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1832  protein of unknown function DUF62  34.73 
 
 		 277 aa  133  3.9999999999999996e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4783  hypothetical protein  29.77 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1350  protein of unknown function DUF62  33.07 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0963991  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1448  protein of unknown function DUF62  39.38 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0919  hypothetical protein  39.19 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.628003  normal  0.0175561 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2027  hypothetical protein  31.33 
 
 		 280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.920292  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2641  protein of unknown function DUF62  38.95 
 
 		 261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233531 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2034  protein of unknown function DUF62  32.21 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0204  hypothetical protein  40.93 
 
 		 250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0271  hypothetical protein  30.69 
 
 		 263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293388  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0269  hypothetical protein  30.69 
 
 		 263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.136318  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1498  hypothetical protein  37.44 
 
 		 282 aa  125  7e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000610491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0566  protein of unknown function DUF62  32.78 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0702  hypothetical protein  34.34 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00401534  normal  0.259483 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1901  hypothetical protein  27.8 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3794  hypothetical protein  32.68 
 
 		 266 aa  122  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1548  hypothetical protein  36.99 
 
 		 282 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0388  hypothetical protein  34.34 
 
 		 267 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.496549 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  41.21 
 
 		 1827 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1230  protein of unknown function DUF62  25.59 
 
 		 278 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6138  hypothetical protein  32.24 
 
 		 304 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.500966  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1391  protein of unknown function DUF62  34.9 
 
 		 295 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3530  hypothetical protein  33.55 
 
 		 276 aa  119  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3689  protein of unknown function DUF62  36.88 
 
 		 258 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235553  normal  0.0332263 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1405  hypothetical protein  35.16 
 
 		 278 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.01301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2069  hypothetical protein  42.66 
 
 		 262 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.119618 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0614  protein of unknown function DUF62  44.39 
 
 		 252 aa  117  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0140429  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4936  protein of unknown function DUF62  31.01 
 
 		 297 aa  116  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.455313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0408  protein of unknown function DUF62  32.64 
 
 		 277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1412  hypothetical protein  25.25 
 
 		 268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.303049  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03690  conserved hypothetical protein  31.6 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03639  hypothetical protein  31.6 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4209  hypothetical protein  34.04 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.31115  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0005  hypothetical protein  37.63 
 
 		 267 aa  114  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.148664 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1546  hypothetical protein  29.49 
 
 		 298 aa  112  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.890208  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1597  protein of unknown function DUF62  48.7 
 
 		 263 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1502  protein of unknown function DUF62  47.4 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.937007  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07650  hypothetical protein  32.36 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4274  hypothetical protein  32.38 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5253  hypothetical protein  35.55 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2108  protein of unknown function DUF62  40.58 
 
 		 272 aa  110  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.111438 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2246  protein of unknown function DUF62  30.98 
 
 		 274 aa  109  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3529  hypothetical protein  35.83 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.879853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4180  hypothetical protein  32.38 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0314265 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0668  hypothetical protein  34 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.721814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2362  hypothetical protein  38.06 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.817205  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3652  hypothetical protein  34.15 
 
 		 272 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000216585  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1640  protein of unknown function DUF62  33.33 
 
 		 244 aa  107  3e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2703  hypothetical protein  38.18 
 
 		 334 aa  106  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2899  protein of unknown function DUF62  39.81 
 
 		 259 aa  106  7e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0750848  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3201  protein of unknown function DUF62  32.67 
 
 		 254 aa  105  9e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.171976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6514  protein of unknown function DUF62  34.96 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0914028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1026  hypothetical protein  31.58 
 
 		 283 aa  103  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0749634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1378  hypothetical protein  32.25 
 
 		 280 aa  102  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.278488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0216  hypothetical protein  33 
 
 		 263 aa  102  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0478  hypothetical protein  36.45 
 
 		 289 aa  100  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1438  hypothetical protein  32.99 
 
 		 263 aa  99.4  6e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1507  hypothetical protein  38.28 
 
 		 256 aa  99  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.941751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2297  hypothetical protein  36.41 
 
 		 242 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.515706  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1036  protein of unknown function DUF62  31.55 
 
 		 278 aa  98.6  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0080  hypothetical protein  26.1 
 
 		 252 aa  95.1  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.158966  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0382  protein of unknown function DUF62  31.4 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2821  protein of unknown function DUF62  37.76 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000372456  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0505  protein of unknown function DUF62  35.71 
 
 		 305 aa  94.4  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1812  hypothetical protein  32.89 
 
 		 252 aa  92  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0876  hypothetical protein  34.03 
 
 		 266 aa  91.3  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000358269  normal  0.0734484 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1975  hypothetical protein  27.99 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.126965  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2710  hypothetical protein  35.9 
 
 		 282 aa  90.5  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.758971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2767  hypothetical protein  35.9 
 
 		 282 aa  90.5  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0260268  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0862  protein of unknown function DUF62  31.36 
 
 		 293 aa  90.1  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0432  hypothetical protein  32.53 
 
 		 242 aa  90.1  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0485  hypothetical protein  44.85 
 
 		 254 aa  86.7  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757673 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0345  hypothetical protein  36.62 
 
 		 282 aa  86.3  7e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00540766  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1862  protein of unknown function DUF62  26.64 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2724  hypothetical protein  26.74 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50638  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0831  hypothetical protein  38.71 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2825  protein of unknown function DUF62  34.59 
 
 		 359 aa  82.4  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2298  hypothetical protein  29.86 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.452594  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2970  hypothetical protein  24.5 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00085144 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1485  hypothetical protein  42.65 
 
 		 239 aa  75.9  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.275435  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08376  hypothetical protein  24 
 
 		 277 aa  72.4  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0139079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>