102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0432 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0432  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  476  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2298  hypothetical protein  46.8 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.452594  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2297  hypothetical protein  47.08 
 
 		 242 aa  209  4e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.515706  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1485  hypothetical protein  49.79 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.275435  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0485  hypothetical protein  47.95 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757673 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1812  hypothetical protein  43.21 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0831  hypothetical protein  43.1 
 
 		 265 aa  166  4e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0002  hypothetical protein  40.23 
 
 		 263 aa  164  8e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.246824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2013  hypothetical protein  36.72 
 
 		 269 aa  157  1e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00694223 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1168  protein of unknown function DUF62  37.96 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1067  hypothetical protein  38.13 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0014432 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2209  hypothetical protein  36.47 
 
 		 261 aa  152  5e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.171783  normal  0.703654 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2069  hypothetical protein  38.85 
 
 		 262 aa  149  5e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.119618 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0216  hypothetical protein  37.21 
 
 		 263 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0919  hypothetical protein  39.61 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.628003  normal  0.0175561 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0204  hypothetical protein  34.52 
 
 		 250 aa  144  9e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1832  protein of unknown function DUF62  38.4 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2370  protein of unknown function DUF62  36.47 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1448  protein of unknown function DUF62  36.7 
 
 		 273 aa  142  7e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2246  protein of unknown function DUF62  37.65 
 
 		 274 aa  141  9e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2034  protein of unknown function DUF62  36.43 
 
 		 268 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0876  hypothetical protein  35.34 
 
 		 266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000358269  normal  0.0734484 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1391  protein of unknown function DUF62  36.58 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4783  hypothetical protein  35.09 
 
 		 271 aa  136  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0222  hypothetical protein  39.85 
 
 		 281 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0702  hypothetical protein  37.5 
 
 		 262 aa  135  6.0000000000000005e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00401534  normal  0.259483 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3689  protein of unknown function DUF62  37.84 
 
 		 258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235553  normal  0.0332263 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0388  hypothetical protein  34.5 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.496549 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1405  hypothetical protein  37.8 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.01301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2641  protein of unknown function DUF62  34.1 
 
 		 261 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233531 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0668  hypothetical protein  35.34 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.721814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3794  hypothetical protein  32.68 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1350  protein of unknown function DUF62  31.2 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0963991  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1320  protein of unknown function DUF62  34.38 
 
 		 264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0998105 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0408  protein of unknown function DUF62  36.92 
 
 		 277 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1293  protein of unknown function DUF62  34.38 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0271  hypothetical protein  34.22 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293388  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0269  hypothetical protein  34.22 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.136318  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4209  hypothetical protein  33.47 
 
 		 269 aa  126  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.31115  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2108  protein of unknown function DUF62  35.04 
 
 		 272 aa  125  7e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.111438 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2027  hypothetical protein  32.95 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.920292  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0603  hypothetical protein  32.7 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1502  protein of unknown function DUF62  40.32 
 
 		 263 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.937007  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3529  hypothetical protein  33.58 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.879853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1597  protein of unknown function DUF62  39.92 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3530  hypothetical protein  33.71 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2703  hypothetical protein  36.97 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2362  hypothetical protein  41.8 
 
 		 263 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.817205  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0791  hypothetical protein  35.23 
 
 		 265 aa  118  7.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244115  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1901  hypothetical protein  29.46 
 
 		 252 aa  116  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1378  hypothetical protein  33.58 
 
 		 280 aa  114  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.278488  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1230  protein of unknown function DUF62  28.09 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0382  protein of unknown function DUF62  30.97 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 		 1827 aa  113  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1364  hypothetical protein  36.96 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0427667  hitchhiker  0.000196172 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1405  hypothetical protein  38.13 
 
 		 261 aa  111  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3306  hypothetical protein  34.6 
 
 		 267 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1412  hypothetical protein  29.76 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.303049  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4936  protein of unknown function DUF62  31.54 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.455313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1546  hypothetical protein  31.01 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.890208  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0614  protein of unknown function DUF62  34 
 
 		 252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0140429  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0005  hypothetical protein  29.3 
 
 		 267 aa  108  6e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.148664 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03690  conserved hypothetical protein  31.37 
 
 		 300 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03639  hypothetical protein  31.37 
 
 		 300 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0080  hypothetical protein  31.51 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.158966  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4180  hypothetical protein  31 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0314265 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4274  hypothetical protein  30.34 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5253  hypothetical protein  30.63 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3652  hypothetical protein  32.13 
 
 		 272 aa  105  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000216585  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1548  hypothetical protein  31.52 
 
 		 282 aa  104  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1640  protein of unknown function DUF62  30 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0608  hypothetical protein  34.72 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.425504  normal  0.0157157 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0862  protein of unknown function DUF62  33.67 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2970  hypothetical protein  27.95 
 
 		 261 aa  102  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00085144 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1507  hypothetical protein  35.88 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.941751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0505  protein of unknown function DUF62  31.97 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2821  protein of unknown function DUF62  30.08 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000372456  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8926  protein of unknown function DUF62  33.94 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0792  protein of unknown function DUF62  34.46 
 
 		 272 aa  99.8  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1909  hypothetical protein  31.9 
 
 		 299 aa  99  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1862  protein of unknown function DUF62  29.73 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6514  protein of unknown function DUF62  28.57 
 
 		 298 aa  96.7  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0914028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1438  hypothetical protein  31.25 
 
 		 263 aa  95.9  5e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1036  protein of unknown function DUF62  31.9 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1498  hypothetical protein  28.11 
 
 		 282 aa  93.2  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000610491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3201  protein of unknown function DUF62  34.35 
 
 		 254 aa  92  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.171976 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2724  hypothetical protein  25.64 
 
 		 276 aa  91.7  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50638  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0345  hypothetical protein  29.37 
 
 		 282 aa  91.7  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00540766  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08376  hypothetical protein  24.45 
 
 		 277 aa  89.7  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0139079  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07650  hypothetical protein  30.91 
 
 		 279 aa  89.4  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2242  hypothetical protein  32.53 
 
 		 315 aa  88.6  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.12731  decreased coverage  0.00672311 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2899  protein of unknown function DUF62  32.32 
 
 		 259 aa  86.7  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0750848  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4666  protein of unknown function DUF62  24.21 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.123818  hitchhiker  0.000000000393742 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2710  hypothetical protein  26.12 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.758971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2767  hypothetical protein  26.12 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0260268  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1673  protein of unknown function DUF62  24.51 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2825  protein of unknown function DUF62  30.63 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1975  hypothetical protein  27.72 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.126965  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1026  hypothetical protein  27.04 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0749634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0566  protein of unknown function DUF62  27.99 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>