102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2298 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2298  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  500  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.452594  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2297  hypothetical protein  45.67 
 
 
242 aa  205  6e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.515706  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0432  hypothetical protein  46.8 
 
 
242 aa  193  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1485  hypothetical protein  45.49 
 
 
239 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.275435  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0485  hypothetical protein  43.55 
 
 
254 aa  178  9e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.757673 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1812  hypothetical protein  45.08 
 
 
252 aa  177  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0831  hypothetical protein  39.68 
 
 
265 aa  156  4e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1320  protein of unknown function DUF62  36.51 
 
 
264 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0998105 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1293  protein of unknown function DUF62  36.51 
 
 
264 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2641  protein of unknown function DUF62  34.77 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233531 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1448  protein of unknown function DUF62  31.8 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3794  hypothetical protein  34.63 
 
 
266 aa  116  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2034  protein of unknown function DUF62  33.08 
 
 
268 aa  115  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1832  protein of unknown function DUF62  34.72 
 
 
277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1168  protein of unknown function DUF62  30.83 
 
 
244 aa  115  8.999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2209  hypothetical protein  31.5 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.171783  normal  0.703654 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2246  protein of unknown function DUF62  31.37 
 
 
274 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0668  hypothetical protein  34.43 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.721814  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0002  hypothetical protein  32.54 
 
 
263 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.246824  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3689  protein of unknown function DUF62  33.59 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235553  normal  0.0332263 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4783  hypothetical protein  30.57 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2069  hypothetical protein  33.72 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.119618 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0271  hypothetical protein  30.04 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293388  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1067  hypothetical protein  28.79 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.0014432 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0269  hypothetical protein  30.04 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.136318  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0216  hypothetical protein  33.21 
 
 
263 aa  110  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1405  hypothetical protein  32.06 
 
 
278 aa  108  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.01301  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3530  hypothetical protein  30.89 
 
 
276 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4209  hypothetical protein  33.2 
 
 
269 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.31115  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0876  hypothetical protein  31.08 
 
 
266 aa  106  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000358269  normal  0.0734484 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2013  hypothetical protein  29.7 
 
 
269 aa  106  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00694223 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1640  protein of unknown function DUF62  30.86 
 
 
244 aa  106  3e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1391  protein of unknown function DUF62  31.15 
 
 
295 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1378  hypothetical protein  32.05 
 
 
280 aa  102  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.278488  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1412  hypothetical protein  28.52 
 
 
268 aa  102  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.303049  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2370  protein of unknown function DUF62  31.7 
 
 
274 aa  101  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3529  hypothetical protein  30.15 
 
 
262 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.879853  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0222  hypothetical protein  32.58 
 
 
281 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2027  hypothetical protein  29.77 
 
 
280 aa  99.8  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.920292  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1350  protein of unknown function DUF62  32.26 
 
 
254 aa  100  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0963991  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0388  hypothetical protein  30.35 
 
 
267 aa  99.4  5e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.496549 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2108  protein of unknown function DUF62  31.54 
 
 
272 aa  97.8  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.111438 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1901  hypothetical protein  29.18 
 
 
252 aa  96.7  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0919  hypothetical protein  31.78 
 
 
258 aa  94.4  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.628003  normal  0.0175561 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0408  protein of unknown function DUF62  30.38 
 
 
277 aa  94.4  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0204  hypothetical protein  29.44 
 
 
250 aa  92.8  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3652  hypothetical protein  28.78 
 
 
272 aa  92  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000216585  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0702  hypothetical protein  29.46 
 
 
262 aa  91.3  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00401534  normal  0.259483 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0791  hypothetical protein  27.57 
 
 
265 aa  91.3  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244115  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1230  protein of unknown function DUF62  27.17 
 
 
278 aa  90.9  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0603  hypothetical protein  31.7 
 
 
262 aa  90.5  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1364  hypothetical protein  30.8 
 
 
261 aa  90.5  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0427667  hitchhiker  0.000196172 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1036  protein of unknown function DUF62  31.69 
 
 
278 aa  90.5  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2899  protein of unknown function DUF62  31.56 
 
 
259 aa  89.4  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0750848  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0614  protein of unknown function DUF62  29.76 
 
 
252 aa  88.6  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0140429  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1546  hypothetical protein  27.34 
 
 
298 aa  87.8  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.890208  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 
1827 aa  86.3  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0005  hypothetical protein  26.85 
 
 
267 aa  85.9  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.148664 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1507  hypothetical protein  32.3 
 
 
256 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.941751  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3306  hypothetical protein  30.08 
 
 
267 aa  85.5  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0080  hypothetical protein  27.78 
 
 
252 aa  84.7  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.158966  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2703  hypothetical protein  30.95 
 
 
334 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4936  protein of unknown function DUF62  28.2 
 
 
297 aa  83.2  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.455313  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0792  protein of unknown function DUF62  29.28 
 
 
272 aa  82.8  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2825  protein of unknown function DUF62  30.74 
 
 
359 aa  82.8  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2362  hypothetical protein  32.27 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.817205  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1597  protein of unknown function DUF62  30.98 
 
 
263 aa  82  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1405  hypothetical protein  30.08 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1502  protein of unknown function DUF62  31.87 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.937007  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3201  protein of unknown function DUF62  29.8 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.171976 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0862  protein of unknown function DUF62  29.41 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0345  hypothetical protein  25.45 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00540766  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0608  hypothetical protein  32.14 
 
 
262 aa  78.2  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.425504  normal  0.0157157 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1498  hypothetical protein  28.57 
 
 
282 aa  77  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000610491  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0382  protein of unknown function DUF62  26.1 
 
 
301 aa  75.5  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2710  hypothetical protein  27.92 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.758971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2767  hypothetical protein  27.92 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0260268  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0505  protein of unknown function DUF62  31.06 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07650  hypothetical protein  29.06 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1548  hypothetical protein  25 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8926  protein of unknown function DUF62  28.84 
 
 
270 aa  72  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1909  hypothetical protein  28.89 
 
 
299 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2242  hypothetical protein  34.22 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.12731  decreased coverage  0.00672311 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2970  hypothetical protein  25.29 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00085144 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6514  protein of unknown function DUF62  26.89 
 
 
298 aa  68.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0914028  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2821  protein of unknown function DUF62  26.28 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000372456  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1975  hypothetical protein  25.64 
 
 
292 aa  67  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.126965  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6138  hypothetical protein  27.59 
 
 
304 aa  65.5  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.500966  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4274  hypothetical protein  23.86 
 
 
300 aa  63.9  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5253  hypothetical protein  23.86 
 
 
300 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03690  conserved hypothetical protein  23.86 
 
 
300 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03639  hypothetical protein  23.86 
 
 
300 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4180  hypothetical protein  23.86 
 
 
300 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0314265 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1438  hypothetical protein  26.32 
 
 
263 aa  62.8  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0478  hypothetical protein  27.31 
 
 
289 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0566  protein of unknown function DUF62  28.73 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2724  hypothetical protein  21.86 
 
 
276 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50638  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08376  hypothetical protein  21.99 
 
 
277 aa  51.6  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0139079  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4666  protein of unknown function DUF62  21.2 
 
 
273 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.123818  hitchhiker  0.000000000393742 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1673  protein of unknown function DUF62  22.11 
 
 
275 aa  49.7  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>