102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1862 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1862  protein of unknown function DUF62  100 
 
 
259 aa  529  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1448  protein of unknown function DUF62  40.84 
 
 
273 aa  205  6e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08376  hypothetical protein  42.09 
 
 
277 aa  201  9.999999999999999e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0139079  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2970  hypothetical protein  39.53 
 
 
261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00085144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4666  protein of unknown function DUF62  36.95 
 
 
273 aa  190  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.123818  hitchhiker  0.000000000393742 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2724  hypothetical protein  39.13 
 
 
276 aa  186  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50638  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1673  protein of unknown function DUF62  33.94 
 
 
275 aa  160  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1067  hypothetical protein  33.59 
 
 
259 aa  148  7e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.0014432 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3652  hypothetical protein  33.96 
 
 
272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000216585  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2209  hypothetical protein  32.05 
 
 
261 aa  143  2e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.171783  normal  0.703654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2641  protein of unknown function DUF62  34.33 
 
 
261 aa  138  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233531 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2013  hypothetical protein  30.5 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00694223 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1293  protein of unknown function DUF62  33.21 
 
 
264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4783  hypothetical protein  32.96 
 
 
271 aa  129  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0216  hypothetical protein  29.46 
 
 
263 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1548  hypothetical protein  33.57 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1378  hypothetical protein  33.96 
 
 
280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.278488  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3794  hypothetical protein  32.95 
 
 
266 aa  126  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4209  hypothetical protein  31.94 
 
 
269 aa  126  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.31115  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3530  hypothetical protein  33.21 
 
 
276 aa  124  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1320  protein of unknown function DUF62  33.6 
 
 
264 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0998105 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0002  hypothetical protein  30.23 
 
 
263 aa  123  3e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.246824  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1168  protein of unknown function DUF62  36.95 
 
 
244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3529  hypothetical protein  29.48 
 
 
262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.879853  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1405  hypothetical protein  33.33 
 
 
278 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.01301  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0271  hypothetical protein  33.46 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293388  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0269  hypothetical protein  33.46 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.136318  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0603  hypothetical protein  33.21 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1350  protein of unknown function DUF62  37.7 
 
 
254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0963991  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2370  protein of unknown function DUF62  29.55 
 
 
274 aa  115  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3689  protein of unknown function DUF62  32.31 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235553  normal  0.0332263 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0702  hypothetical protein  28.41 
 
 
262 aa  113  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00401534  normal  0.259483 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1901  hypothetical protein  33.6 
 
 
252 aa  112  6e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0614  protein of unknown function DUF62  31.5 
 
 
252 aa  112  8.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0140429  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0919  hypothetical protein  30.71 
 
 
258 aa  107  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.628003  normal  0.0175561 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2034  protein of unknown function DUF62  31.03 
 
 
268 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0388  hypothetical protein  29.23 
 
 
267 aa  105  7e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.496549 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0204  hypothetical protein  28.74 
 
 
250 aa  105  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1832  protein of unknown function DUF62  29.34 
 
 
277 aa  103  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1640  protein of unknown function DUF62  35.33 
 
 
244 aa  103  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0792  protein of unknown function DUF62  28.06 
 
 
272 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2246  protein of unknown function DUF62  28.91 
 
 
274 aa  102  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1597  protein of unknown function DUF62  26.34 
 
 
263 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8926  protein of unknown function DUF62  26.12 
 
 
270 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2027  hypothetical protein  28.9 
 
 
280 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.920292  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1438  hypothetical protein  29.28 
 
 
263 aa  99  6e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1364  hypothetical protein  29.77 
 
 
261 aa  98.6  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0427667  hitchhiker  0.000196172 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1412  hypothetical protein  29.02 
 
 
268 aa  97.8  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.303049  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1502  protein of unknown function DUF62  25.95 
 
 
263 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.937007  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2362  hypothetical protein  27.16 
 
 
263 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.817205  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3306  hypothetical protein  28.68 
 
 
267 aa  95.1  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0408  protein of unknown function DUF62  28.63 
 
 
277 aa  94.4  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1391  protein of unknown function DUF62  25.19 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0432  hypothetical protein  29.73 
 
 
242 aa  92.8  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  29.39 
 
 
1827 aa  92.4  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1405  hypothetical protein  28.96 
 
 
261 aa  92.4  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3201  protein of unknown function DUF62  27.41 
 
 
254 aa  90.1  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.171976 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1507  hypothetical protein  26.69 
 
 
256 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.941751  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4936  protein of unknown function DUF62  27.95 
 
 
297 aa  89.4  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.455313  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2899  protein of unknown function DUF62  26.47 
 
 
259 aa  88.2  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0750848  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1909  hypothetical protein  32.97 
 
 
299 aa  85.9  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1036  protein of unknown function DUF62  26.15 
 
 
278 aa  85.9  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1230  protein of unknown function DUF62  28.9 
 
 
278 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0608  hypothetical protein  24.71 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.425504  normal  0.0157157 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0080  hypothetical protein  28.98 
 
 
252 aa  83.2  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.158966  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0668  hypothetical protein  27.92 
 
 
252 aa  83.2  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.721814  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0862  protein of unknown function DUF62  25.17 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2069  hypothetical protein  24.31 
 
 
262 aa  82  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.119618 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6138  hypothetical protein  26.79 
 
 
304 aa  79.7  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.500966  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0382  protein of unknown function DUF62  27.84 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1546  hypothetical protein  26.61 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.890208  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1026  hypothetical protein  28.51 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0749634  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0222  hypothetical protein  25.19 
 
 
281 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2297  hypothetical protein  23.14 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.515706  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1812  hypothetical protein  24.05 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0791  hypothetical protein  26.04 
 
 
265 aa  74.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244115  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2108  protein of unknown function DUF62  24.14 
 
 
272 aa  74.7  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.111438 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0005  hypothetical protein  26.59 
 
 
267 aa  73.6  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.148664 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4274  hypothetical protein  25.4 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5253  hypothetical protein  26.59 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4180  hypothetical protein  25.4 
 
 
300 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0314265 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0478  hypothetical protein  26.12 
 
 
289 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2242  hypothetical protein  26.64 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.12731  decreased coverage  0.00672311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6514  protein of unknown function DUF62  25 
 
 
298 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0914028  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03690  conserved hypothetical protein  25 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0485  hypothetical protein  22.05 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.757673 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1498  hypothetical protein  29.67 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000610491  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03639  hypothetical protein  25 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0876  hypothetical protein  22.83 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000358269  normal  0.0734484 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2703  hypothetical protein  24.34 
 
 
334 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0505  protein of unknown function DUF62  23.85 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07650  hypothetical protein  27.1 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0566  protein of unknown function DUF62  24.12 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2825  protein of unknown function DUF62  22.46 
 
 
359 aa  65.9  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2821  protein of unknown function DUF62  30.71 
 
 
299 aa  65.1  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000372456  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0345  hypothetical protein  25.24 
 
 
282 aa  62  0.000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00540766  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1485  hypothetical protein  21.88 
 
 
239 aa  58.9  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.275435  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0831  hypothetical protein  22.71 
 
 
265 aa  57  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2710  hypothetical protein  22.31 
 
 
282 aa  52  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.758971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2767  hypothetical protein  22.31 
 
 
282 aa  52  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0260268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>