50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1045 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1045  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  280  3.0000000000000004e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2231  hypothetical protein  90 
 
 		 153 aa  241  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1031  protein of unknown function DUF323  93.52 
 
 		 265 aa  218  1.9999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2245  hypothetical protein  90.43 
 
 		 118 aa  218  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1234  protein of unknown function DUF323  94.39 
 
 		 265 aa  217  3.9999999999999997e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2259  hypothetical protein  97.2 
 
 		 262 aa  216  6e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1321  protein of unknown function DUF323  82.41 
 
 		 270 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.329702  hitchhiker  0.00614552 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2255  hypothetical protein  92.68 
 
 		 87 aa  149  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  36.04 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  34.69 
 
 		 1044 aa  54.3  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  35.05 
 
 		 1049 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  34.78 
 
 		 965 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1200 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  36.49 
 
 		 1183 aa  50.1  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6045  serine/threonine protein kinase  33.98 
 
 		 842 aa  50.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  32.38 
 
 		 1186 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  33.93 
 
 		 253 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  38.71 
 
 		 775 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  34.69 
 
 		 1023 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  29 
 
 		 614 aa  48.5  0.00003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.53 
 
 		 1044 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  34.44 
 
 		 1007 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  33.7 
 
 		 1064 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  29.13 
 
 		 637 aa  47  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  35.8 
 
 		 603 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  32.26 
 
 		 263 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0602  protein of unknown function DUF323  36.63 
 
 		 273 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0325143  normal  0.360547 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.19 
 
 		 554 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  31.82 
 
 		 1053 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  31.37 
 
 		 1049 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  28.23 
 
 		 923 aa  44.3  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  32.76 
 
 		 621 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  34.57 
 
 		 276 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  35.44 
 
 		 952 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  34.04 
 
 		 390 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  33.75 
 
 		 820 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0185  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 311 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  33.72 
 
 		 303 aa  42.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  37.88 
 
 		 1190 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  36.36 
 
 		 1132 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  34 
 
 		 1581 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  34.94 
 
 		 620 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  32.32 
 
 		 1041 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  51.28 
 
 		 417 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  31.63 
 
 		 412 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0052  protein of unknown function DUF323  30.28 
 
 		 303 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  32.94 
 
 		 1201 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  31.25 
 
 		 358 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  27.06 
 
 		 802 aa  40  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2101  hypothetical protein  38.96 
 
 		 356 aa  40  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00076564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>