27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2255 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2255  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  181  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2231  hypothetical protein  92.77 
 
 
153 aa  165  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1234  protein of unknown function DUF323  91.57 
 
 
265 aa  164  4e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1045  hypothetical protein  92.68 
 
 
134 aa  164  4e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1031  protein of unknown function DUF323  89.16 
 
 
265 aa  163  8e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2259  hypothetical protein  95.06 
 
 
262 aa  160  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2245  hypothetical protein  88.1 
 
 
118 aa  158  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1321  protein of unknown function DUF323  83.13 
 
 
270 aa  151  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.329702  hitchhiker  0.00614552 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  37.04 
 
 
603 aa  48.9  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  33.75 
 
 
820 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  34.09 
 
 
276 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  29.41 
 
 
802 aa  43.9  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  32.05 
 
 
1186 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  35.23 
 
 
1132 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  35 
 
 
358 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0185  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 
311 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  35.8 
 
 
637 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  36.25 
 
 
620 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  36.36 
 
 
291 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  40.24 
 
 
621 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  33.73 
 
 
952 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  37.21 
 
 
623 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2035  hypothetical protein  30.77 
 
 
338 aa  40.4  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.68876  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  34.67 
 
 
303 aa  40.4  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  33.33 
 
 
1200 aa  40  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  38.33 
 
 
775 aa  40  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  34.57 
 
 
618 aa  40  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.314695 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>