48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2231 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2231  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  319  7e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1045  hypothetical protein  90 
 
 
134 aa  241  1.9999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2245  hypothetical protein  92.31 
 
 
118 aa  226  6e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1234  protein of unknown function DUF323  94.5 
 
 
265 aa  221  3e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1031  protein of unknown function DUF323  92.66 
 
 
265 aa  219  8e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2259  hypothetical protein  96.23 
 
 
262 aa  214  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1321  protein of unknown function DUF323  83.33 
 
 
270 aa  174  4e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.329702  hitchhiker  0.00614552 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2255  hypothetical protein  92.77 
 
 
87 aa  149  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  33.64 
 
 
251 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  34 
 
 
1044 aa  50.8  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  30 
 
 
614 aa  49.3  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  32.56 
 
 
1049 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  40.32 
 
 
775 aa  48.9  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  35.14 
 
 
1049 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  35.14 
 
 
1183 aa  47.8  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  28.47 
 
 
1200 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  37.04 
 
 
637 aa  47.4  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  33 
 
 
1186 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  33 
 
 
1023 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  32.43 
 
 
253 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  32.61 
 
 
965 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  35.8 
 
 
603 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6045  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
842 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  37.35 
 
 
620 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  33.66 
 
 
1581 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  34.57 
 
 
276 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0602  protein of unknown function DUF323  35.56 
 
 
273 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0325143  normal  0.360547 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  34.44 
 
 
1007 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  38.71 
 
 
1064 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  32.56 
 
 
1201 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  30.77 
 
 
263 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.36 
 
 
554 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  36.36 
 
 
1132 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  32.63 
 
 
390 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  34.18 
 
 
952 aa  42.4  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  32.5 
 
 
820 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  33.67 
 
 
303 aa  42  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  29.89 
 
 
1053 aa  41.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  29.46 
 
 
621 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  37.8 
 
 
621 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  28.85 
 
 
412 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  30.91 
 
 
291 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  29.2 
 
 
1818 aa  41.2  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0052  protein of unknown function DUF323  31.91 
 
 
303 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  38.71 
 
 
1190 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  31.68 
 
 
1041 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 
358 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  28.24 
 
 
802 aa  40.4  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>