More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0744 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0744  protein TolQ  100 
 
 		 225 aa  460  1e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00108567  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0856  MotA/TolQ/ExbB proton channel  68.78 
 
 		 225 aa  318  5e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339673  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2164  protein TolQ  69.27 
 
 		 219 aa  279  3e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.23408  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0611  ExbB/TolQ family protein  65.16 
 
 		 222 aa  263  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0747  protein TolQ  66.51 
 
 		 220 aa  258  6e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.277913  normal  0.181202 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1907  ExbB/TolQ family protein  61.75 
 
 		 220 aa  257  1e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1714  protein TolQ  68.25 
 
 		 220 aa  244  4.9999999999999997e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.55654  hitchhiker  0.00228712 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.98 
 
 		 268 aa  192  5e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.92 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  46.67 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0662  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 		 247 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0696  protein TolQ  42.45 
 
 		 257 aa  175  5e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0697  protein TolQ  42.45 
 
 		 257 aa  175  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.553708  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  46.39 
 
 		 225 aa  174  7e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  42.18 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  45.6 
 
 		 227 aa  170  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.79 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.18 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  46.63 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  45.6 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.79 
 
 		 223 aa  168  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0706  Tol-Pal system TolQ  41.51 
 
 		 245 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal  0.496524 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3629  tolQ protein  42.93 
 
 		 228 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.6 
 
 		 231 aa  158  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3090  colicin uptake protein TolQ  40.09 
 
 		 228 aa  157  9e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0237739  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1153  colicin uptake protein TolQ  39.17 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1246  colicin uptake protein TolQ  39.63 
 
 		 228 aa  155  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0152271  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2213  Tol-Pal system TolQ  49.77 
 
 		 240 aa  155  4e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000350133  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  41.01 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1235  colicin uptake protein TolQ  41.51 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0719257  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1276  colicin uptake protein TolQ  40.65 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000244479  hitchhiker  0.000166082 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1394  colicin uptake protein TolQ  39.63 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00123539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2871  colicin uptake protein TolQ  39.63 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018196  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.48 
 
 		 243 aa  152  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2905  colicin uptake protein TolQ  38.71 
 
 		 228 aa  152  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045905  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.58 
 
 		 235 aa  151  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2959  colicin uptake protein TolQ  39.91 
 
 		 225 aa  151  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0410151  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0862  protein TolQ  39.81 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000829474  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.25 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00697  membrane spanning protein in TolA-TolQ-TolR complex  40.37 
 
 		 230 aa  148  8e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000447277  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0790  colicin uptake protein TolQ  40.37 
 
 		 230 aa  148  8e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.9487499999999996e-21  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2898  protein TolQ  40.37 
 
 		 230 aa  148  8e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228414  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0766  colicin uptake protein TolQ  40.37 
 
 		 230 aa  148  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000589791  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0659  colicin uptake protein TolQ  40.37 
 
 		 230 aa  148  8e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.56356e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0840  colicin uptake protein TolQ  40.37 
 
 		 230 aa  148  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248692  normal  0.940018 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00686  hypothetical protein  40.37 
 
 		 230 aa  148  8e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000828113  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0760  colicin uptake protein TolQ  40.37 
 
 		 230 aa  148  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000115881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0808  colicin uptake protein TolQ  40.37 
 
 		 230 aa  147  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000314408  normal  0.698213 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0781  colicin uptake protein TolQ  40.37 
 
 		 230 aa  147  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000154258  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0841  colicin uptake protein TolQ  40.37 
 
 		 230 aa  147  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000287891  normal  0.682306 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0872  colicin uptake protein TolQ  40.37 
 
 		 230 aa  147  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0427185  normal  0.214895 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0903  colicin uptake protein TolQ  40.37 
 
 		 230 aa  147  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000748349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.73 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928005  normal  0.316985 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0585  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.44 
 
 		 263 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127539  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0672  biopolymer transport protein, TolQ  39.73 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00353274  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2918  colicin uptake protein TolQ  40.28 
 
 		 227 aa  146  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000415186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  40.09 
 
 		 228 aa  146  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0785  protein TolQ  37.86 
 
 		 222 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0555571  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  37.96 
 
 		 229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.72 
 
 		 235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.46 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.25 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0354123  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  44.15 
 
 		 231 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  37.85 
 
 		 228 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0282  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.51 
 
 		 230 aa  145  6e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235807  hitchhiker  0.000672493 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  44.15 
 
 		 231 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  44.15 
 
 		 231 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  37.85 
 
 		 228 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  44.15 
 
 		 231 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  37.85 
 
 		 228 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.91 
 
 		 232 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.794955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2342  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.75 
 
 		 224 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.105576 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.62 
 
 		 231 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.62 
 
 		 230 aa  145  7.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564154  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.85 
 
 		 228 aa  144  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.85 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0280  transport protein ExbB  38.14 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  40.09 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02500  transport protein ExbB  38.14 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  39.64 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.91 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169266  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.38 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  36.7 
 
 		 229 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.1 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2364  protein TolQ  40.38 
 
 		 231 aa  142  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.501441 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.17 
 
 		 221 aa  142  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.14 
 
 		 229 aa  142  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.14 
 
 		 228 aa  143  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.61 
 
 		 229 aa  142  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.85 
 
 		 228 aa  142  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.85 
 
 		 228 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0270  biopolymer transport protein ExbB, putative  38.61 
 
 		 235 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1214  protein TolQ  39.55 
 
 		 238 aa  142  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3165  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.71 
 
 		 229 aa  141  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  41.49 
 
 		 231 aa  141  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  41.49 
 
 		 231 aa  141  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.56 
 
 		 308 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0136  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.12 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.75 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0724  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.44 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.49682  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>