More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2164 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2164  protein TolQ  100 
 
 		 219 aa  441  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.23408  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0856  MotA/TolQ/ExbB proton channel  70.83 
 
 		 225 aa  313  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339673  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0611  ExbB/TolQ family protein  68.64 
 
 		 222 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0747  protein TolQ  68.35 
 
 		 220 aa  265  4e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.277913  normal  0.181202 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1907  ExbB/TolQ family protein  63.93 
 
 		 220 aa  264  8e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0744  protein TolQ  69.27 
 
 		 225 aa  263  1e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00108567  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1714  protein TolQ  66.97 
 
 		 220 aa  246  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.55654  hitchhiker  0.00228712 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.95 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  46.12 
 
 		 227 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.42 
 
 		 223 aa  177  9e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.42 
 
 		 223 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  48.13 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  46.95 
 
 		 223 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.21 
 
 		 224 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  45.79 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  45.79 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0697  protein TolQ  41.9 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.553708  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0662  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.9 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0696  protein TolQ  41.9 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  42.59 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  38.5 
 
 		 232 aa  156  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0706  Tol-Pal system TolQ  40.55 
 
 		 245 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal  0.496524 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3090  colicin uptake protein TolQ  40.47 
 
 		 228 aa  155  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0237739  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3629  tolQ protein  43.96 
 
 		 228 aa  154  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1246  colicin uptake protein TolQ  39.72 
 
 		 228 aa  154  8e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0152271  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.15 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1153  colicin uptake protein TolQ  39.07 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.86 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.38 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2905  colicin uptake protein TolQ  39.72 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045905  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.06 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0354123  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.27 
 
 		 229 aa  149  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.55 
 
 		 229 aa  149  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2871  colicin uptake protein TolQ  39.25 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018196  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1394  colicin uptake protein TolQ  39.25 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00123539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  41.67 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2959  colicin uptake protein TolQ  39.25 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0410151  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2213  Tol-Pal system TolQ  46.85 
 
 		 240 aa  148  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000350133  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.51 
 
 		 235 aa  148  7e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1728  tolQ protein  40 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.98 
 
 		 231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1276  colicin uptake protein TolQ  39.72 
 
 		 224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000244479  hitchhiker  0.000166082 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  40.83 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.53 
 
 		 243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.47 
 
 		 229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  42.72 
 
 		 241 aa  144  7.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.9 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564154  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1235  colicin uptake protein TolQ  39.25 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0719257  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  41.51 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  41.31 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  41.51 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.31 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  41.51 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.25 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0585  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.47 
 
 		 263 aa  142  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127539  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.04 
 
 		 228 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  40.38 
 
 		 235 aa  141  6e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  41.2 
 
 		 230 aa  141  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.25 
 
 		 228 aa  141  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.25 
 
 		 228 aa  141  7e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0724  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.28 
 
 		 227 aa  141  8e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.49682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01607  hypothetical protein  38.36 
 
 		 232 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  41.74 
 
 		 236 aa  140  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2191  Tol-Pal system TolQ  39.07 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000779627  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.39 
 
 		 235 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.25 
 
 		 228 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00697  membrane spanning protein in TolA-TolQ-TolR complex  39.81 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000447277  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2898  protein TolQ  39.81 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228414  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  41.2 
 
 		 231 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  41.2 
 
 		 231 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0840  colicin uptake protein TolQ  39.81 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248692  normal  0.940018 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0760  colicin uptake protein TolQ  39.81 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000115881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  41.2 
 
 		 231 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2918  colicin uptake protein TolQ  40.19 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000415186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0766  colicin uptake protein TolQ  39.81 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000589791  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00686  hypothetical protein  39.81 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000828113  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  41.2 
 
 		 231 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  40.74 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0790  colicin uptake protein TolQ  39.81 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.9487499999999996e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0659  colicin uptake protein TolQ  39.81 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.56356e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  39.81 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  39.81 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0259  biopolymer transport protein  41.47 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0316714  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4062  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 		 236 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.508438  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  41.31 
 
 		 228 aa  138  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.9 
 
 		 232 aa  138  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.794955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1895  TolQ protein, inner membrane component  39.44 
 
 		 228 aa  138  6e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.42 
 
 		 232 aa  138  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928005  normal  0.316985 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0672  biopolymer transport protein, TolQ  39.42 
 
 		 232 aa  138  7e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00353274  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0903  colicin uptake protein TolQ  39.35 
 
 		 230 aa  138  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000748349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0841  colicin uptake protein TolQ  39.35 
 
 		 230 aa  138  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000287891  normal  0.682306 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0872  colicin uptake protein TolQ  39.35 
 
 		 230 aa  138  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0427185  normal  0.214895 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0781  colicin uptake protein TolQ  39.35 
 
 		 230 aa  138  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000154258  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0808  colicin uptake protein TolQ  39.35 
 
 		 230 aa  138  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000314408  normal  0.698213 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.91 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0591  tonB-system energizer ExbB  41.24 
 
 		 237 aa  136  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1214  protein TolQ  40.65 
 
 		 238 aa  136  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0841  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.5 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1432  tolQ protein  40.67 
 
 		 227 aa  136  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>