More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1339 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1339  flagellar motor protein MotB  100 
 
 
244 aa  496  1e-139  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1622  flagellar motor protein MotB  56.25 
 
 
247 aa  284  1.0000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0358  flagellar motor protein MotB  55.83 
 
 
247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.890291  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0381  flagellar motor protein MotB  55.83 
 
 
247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1191  flagellar motor protein MotB  43.67 
 
 
242 aa  198  7e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0231  flagellar motor protein MotB  42.74 
 
 
238 aa  180  2e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1169  OmpA/MotB domain protein  38.15 
 
 
266 aa  172  5.999999999999999e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00345179  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  32.37 
 
 
271 aa  97.1  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  30.11 
 
 
288 aa  85.5  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1969  flagellar motor protein MotD  25.81 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  27.23 
 
 
238 aa  75.1  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  24.55 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0690  OmpA family protein  33.1 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.398507  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1270  OmpA/MotB  27.24 
 
 
249 aa  72  0.000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.752029  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  38.6 
 
 
224 aa  72  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2180  OmpA/MotB domain protein  23.58 
 
 
235 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.736201  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  25.34 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  26.98 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  26.67 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  24.89 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  28.21 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  27.39 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1016  OmpA/MotB  26.82 
 
 
240 aa  67  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.436254  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  25.23 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  24.22 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  36.7 
 
 
464 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  24.34 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  37.96 
 
 
451 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  25.22 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1877  OmpA/MotB  38.89 
 
 
434 aa  65.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0777893 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  23.37 
 
 
285 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  25.31 
 
 
296 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  25.11 
 
 
269 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  24.35 
 
 
295 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  23.37 
 
 
285 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  25 
 
 
263 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  22.22 
 
 
305 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  25.11 
 
 
257 aa  63.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  25.21 
 
 
257 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  35.4 
 
 
224 aa  63.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00027  flagellar motor protein MotD  24.72 
 
 
286 aa  63.2  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170514  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  22.99 
 
 
285 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  25.79 
 
 
245 aa  63.2  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  24.41 
 
 
338 aa  63.2  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  24.7 
 
 
258 aa  63.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1300  flagellar motor protein MotB  26.92 
 
 
296 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.334413 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  23.14 
 
 
280 aa  62.8  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  33.58 
 
 
1755 aa  62.8  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  32.54 
 
 
217 aa  62.8  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1084  OmpA/MotB domain protein  23.08 
 
 
241 aa  62  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1569  flagellar motor protein MotD  22.43 
 
 
296 aa  62  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  31.21 
 
 
226 aa  62  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0772  OmpA/MotB  36.11 
 
 
464 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  28.89 
 
 
221 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  24.67 
 
 
279 aa  60.8  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1322  flagellar motor protein MotB  24.06 
 
 
309 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.300198  hitchhiker  5.1879400000000003e-23 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2078  flagellar motor protein MotB  24.06 
 
 
309 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000517437  hitchhiker  0.0000035 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  33.33 
 
 
224 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  38.14 
 
 
334 aa  60.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1199  flagellar motor protein MotB  24.06 
 
 
309 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00894206  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  36.11 
 
 
464 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2138  flagellar motor protein MotB  24.06 
 
 
309 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.171106  hitchhiker  1.07849e-26 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2083  flagellar motor protein MotB  24.06 
 
 
309 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.375305  hitchhiker  2.85081e-24 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  24.17 
 
 
296 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  31.62 
 
 
218 aa  60.1  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  33.9 
 
 
230 aa  60.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  26.69 
 
 
268 aa  60.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  28.03 
 
 
218 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  33.33 
 
 
222 aa  60.1  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4703  OmpA/MotB  35.34 
 
 
237 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  27.13 
 
 
257 aa  60.1  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  35.85 
 
 
463 aa  59.7  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  34.43 
 
 
227 aa  59.7  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01860  flagellar motor protein MotB  24.12 
 
 
308 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0228996  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1751  OmpA/MotB domain protein  24.12 
 
 
308 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0290183  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1295  flagellar motor protein MotB  24.12 
 
 
308 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00197011  hitchhiker  0.000000685167 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01849  hypothetical protein  24.12 
 
 
308 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0472674  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1511  flagellar motor protein MotB  24.8 
 
 
377 aa  59.3  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0155028  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2628  flagellar motor protein MotB  24.12 
 
 
308 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00566133  hitchhiker  0.0000000000155511 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2122  flagellar motor protein MotB  24.12 
 
 
308 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245861  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  25.86 
 
 
290 aa  59.3  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1743  flagellar motor protein MotB  24.12 
 
 
308 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  33.03 
 
 
464 aa  59.3  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1985  flagellar motor protein MotB  24.12 
 
 
308 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000595029  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  29.22 
 
 
289 aa  58.9  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  22.46 
 
 
305 aa  58.9  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  34.91 
 
 
537 aa  59.3  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  24.79 
 
 
261 aa  59.3  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  33.01 
 
 
459 aa  58.9  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  23.41 
 
 
253 aa  58.5  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  32.77 
 
 
498 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4286  flagellar motor protein MotB  24.05 
 
 
275 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  34.65 
 
 
218 aa  57.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10918  outer membrane protein A ompA  31.93 
 
 
326 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0884  OmpA/MotB  32.48 
 
 
464 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138624  normal  0.799439 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0835  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 
264 aa  57.4  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.376588  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0748  OmpA/MotB domain-containing protein  25.64 
 
 
302 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2980  OmpA/MotB domain protein  23.87 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.567172 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  27.9 
 
 
236 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  25 
 
 
281 aa  57.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>