More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4012 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4012  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 535 aa  1055    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0470647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2860  AMP-dependent synthetase and ligase  57.36 
 
 		 535 aa  578  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.43217  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2237  AMP-dependent synthetase and ligase  48.33 
 
 		 522 aa  458  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1315  AMP-dependent synthetase and ligase  44.26 
 
 		 965 aa  442  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0799  putative acyl-CoA synthetase  43.31 
 
 		 546 aa  439  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0930157  normal  0.263269 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0495  AMP-dependent synthetase and ligase  43.63 
 
 		 553 aa  434  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.61838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2335  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.38 
 
 		 546 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2296  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.38 
 
 		 546 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1203  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.2 
 
 		 544 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1439  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.2 
 
 		 544 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.64772  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1930  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.2 
 
 		 544 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.641249  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0617  putative acyl-CoA synthetase  42.01 
 
 		 534 aa  422  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.317505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3375  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.2 
 
 		 544 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1895  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.38 
 
 		 547 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4882  AMP-dependent synthetase and ligase  42.51 
 
 		 543 aa  421  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1367  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.07 
 
 		 547 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0878998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1825  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.18 
 
 		 584 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.754963  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1398  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.62 
 
 		 541 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5208  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.73 
 
 		 547 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.592335 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1930  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.81 
 
 		 547 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.049446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2141  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.89 
 
 		 589 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2455  putative acyl-CoA synthetase  41.79 
 
 		 542 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.680464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6172  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.99 
 
 		 569 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489705  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1907  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.99 
 
 		 569 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.45334  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4392  AMP-dependent synthetase and ligase  42.78 
 
 		 542 aa  413  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1843  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.3 
 
 		 556 aa  409  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1027  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.43 
 
 		 560 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2456  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.22 
 
 		 548 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0579  AMP-dependent synthetase and ligase  44.47 
 
 		 521 aa  412  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1863  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.86 
 
 		 534 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.856558  normal  0.360106 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1769  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.33 
 
 		 558 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00212051 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1165  putative acyl-CoA synthetase  40 
 
 		 542 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431504  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5305  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.62 
 
 		 549 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1267  putative acyl-CoA synthetase  40 
 
 		 542 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0759  putative acyl-CoA synthetase  40.33 
 
 		 542 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153349  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1496  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.2 
 
 		 542 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  41.71 
 
 		 547 aa  407  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000420413  normal  0.904573 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5445  AMP-dependent synthetase and ligase  42.91 
 
 		 544 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.513748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1455  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.01 
 
 		 542 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0933982  hitchhiker  0.0000905753 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3348  AMP-dependent synthetase and ligase  41.77 
 
 		 542 aa  403  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1749  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.34 
 
 		 542 aa  405  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0360029  normal  0.897782 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2171  AMP-dependent synthetase and ligase  41.8 
 
 		 546 aa  405  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4187  AMP-dependent synthetase and ligase  39.81 
 
 		 545 aa  404  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554867  normal  0.517417 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4934  putative acyl-CoA synthetase  39.63 
 
 		 542 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.115365  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2946  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.22 
 
 		 546 aa  403  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.916006 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2733  AMP-dependent synthetase and ligase  42.78 
 
 		 542 aa  405  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal  0.088635 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5976  AMP-dependent synthetase and ligase  41.21 
 
 		 551 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.636472  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4293  putative acyl-CoA synthetase  40.07 
 
 		 542 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0244741 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0380  putative acyl-CoA synthetase  43.11 
 
 		 545 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1925  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.99 
 
 		 561 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113828  normal  0.439232 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0436  AMP-dependent synthetase and ligase  40.91 
 
 		 533 aa  397  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0260985  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2275  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.43 
 
 		 562 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0961938  normal  0.119305 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3306  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.67 
 
 		 545 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.135648  normal  0.0145757 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1316  AMP-dependent synthetase and ligase  42.86 
 
 		 546 aa  394  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561388  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0437  AMP-dependent synthetase and ligase  40.07 
 
 		 547 aa  395  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0809367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  41 
 
 		 546 aa  391  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2579  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.34 
 
 		 542 aa  391  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.76612  normal  0.235984 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5261  AMP-dependent synthetase and ligase  41.7 
 
 		 548 aa  389  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293821 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3283  AMP-dependent synthetase and ligase  40.41 
 
 		 553 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4824  AMP-dependent synthetase and ligase  40.37 
 
 		 551 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.888846  normal  0.874224 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1837  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.45 
 
 		 541 aa  386  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0196277  normal  0.206597 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5439  medium-chain-fatty-acid-CoA ligase  41.18 
 
 		 545 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2026  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.08 
 
 		 545 aa  382  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0622  AMP-dependent synthetase and ligase  38.43 
 
 		 550 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1678  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.89 
 
 		 545 aa  383  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2639  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.32 
 
 		 480 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1180  AMP-dependent synthetase and ligase  42.18 
 
 		 534 aa  382  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.941071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1913  AMP-dependent synthetase and ligase  39.19 
 
 		 549 aa  383  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000707868  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2393  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.21 
 
 		 542 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0010153  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0605  AMP-dependent synthetase and ligase  41.42 
 
 		 516 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.194166  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1799  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.04 
 
 		 547 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2515  AMP-dependent synthetase and ligase  42.86 
 
 		 527 aa  372  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.921526 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2932  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.22 
 
 		 547 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0465511  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0212  AMP-dependent synthetase and ligase  40.26 
 
 		 539 aa  371  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.240297 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5172  AMP-dependent synthetase and ligase  40.15 
 
 		 549 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.569954  normal  0.858795 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1426  AMP-dependent synthetase and ligase  42.96 
 
 		 544 aa  366  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2845  AMP-dependent synthetase and ligase  39.15 
 
 		 540 aa  365  1e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1771  AMP-dependent synthetase and ligase  39.85 
 
 		 539 aa  358  9.999999999999999e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4136  AMP-dependent synthetase and ligase  40.3 
 
 		 587 aa  357  3.9999999999999996e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1585  AMP-dependent synthetase and ligase  38.86 
 
 		 549 aa  353  4e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2982  AMP-dependent synthetase and ligase  39.96 
 
 		 537 aa  349  6e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.874572  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0094  AMP-dependent synthetase and ligase  39.37 
 
 		 544 aa  343  5.999999999999999e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4589  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.91 
 
 		 538 aa  341  2e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.335072  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.66 
 
 		 536 aa  341  2.9999999999999998e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.894837  normal  0.430514 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5711  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.41 
 
 		 546 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5332  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.41 
 
 		 546 aa  340  4e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.7188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5421  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.41 
 
 		 546 aa  340  4e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2549  AMP-dependent synthetase and ligase  38.69 
 
 		 550 aa  338  1.9999999999999998e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.798559 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0767  AMP-dependent synthetase and ligase  40.08 
 
 		 542 aa  337  3.9999999999999995e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8848  AMP-dependent synthetase and ligase  37.22 
 
 		 541 aa  337  3.9999999999999995e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11076  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.52 
 
 		 543 aa  335  2e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0440642 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3198  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.8 
 
 		 543 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.8 
 
 		 543 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.894285  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3248  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.8 
 
 		 543 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0224  AMP-dependent synthetase and ligase  38.03 
 
 		 549 aa  333  5e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0391267  normal  0.0314439 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0328  AMP-dependent synthetase and ligase  37.85 
 
 		 540 aa  332  8e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4358  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.34 
 
 		 549 aa  330  3e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.124731 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2552  AMP-dependent synthetase and ligase  35.23 
 
 		 575 aa  327  2.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1579  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.45 
 
 		 537 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000333435  normal  0.0479837 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3332  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.26 
 
 		 537 aa  327  3e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000121528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>