More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0790 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0790  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 		 126 aa  236  6.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.188773 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2959  50S ribosomal protein L7/L12  70.63 
 
 		 125 aa  134  5e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.585888  normal  0.16288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  65.08 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  64.29 
 
 		 125 aa  121  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0977  50S ribosomal protein L7/L12  65.87 
 
 		 125 aa  120  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513658 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2696  50S ribosomal protein L7/L12  67.46 
 
 		 123 aa  120  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10114  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  61.11 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  65.87 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1346  50S ribosomal protein L7/L12  67.72 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0781137  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  66.67 
 
 		 124 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  60.32 
 
 		 125 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  68.5 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1953  50S ribosomal protein L7/L12  62.2 
 
 		 127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0817116  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  65.35 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1700  50S ribosomal protein L7/L12  65.87 
 
 		 125 aa  117  7e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  69.05 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0361  50S ribosomal protein L7/L12  63.78 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1899  50S ribosomal protein L7/L12  64.57 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0356  50S ribosomal protein L7/L12  62.6 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0227516  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  62.7 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  62.7 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2728  ribosomal protein L7/L12  67.46 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3840  50S ribosomal protein L7/L12  63.49 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00160785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  63.49 
 
 		 123 aa  114  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  60.63 
 
 		 124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  65.87 
 
 		 125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  68.25 
 
 		 124 aa  114  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1946  50S ribosomal protein L7/L12  67.46 
 
 		 124 aa  114  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0743276  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 		 125 aa  113  7.999999999999999e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4016  50S ribosomal protein L7/L12  64.29 
 
 		 125 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.797485  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4385  50S ribosomal protein L7/L12  64.29 
 
 		 125 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3476  50S ribosomal protein L7/L12  62.2 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145567  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2680  50S ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00234382  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1823  50S ribosomal protein L7/L12  65.08 
 
 		 124 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0030  50S ribosomal protein L7/L12  66.67 
 
 		 123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0666406  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1323  50S ribosomal protein L7/L12  63.49 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.160578 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2360  50S ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 		 125 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2272  50S ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 		 125 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  52.46 
 
 		 122 aa  106  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1421  50S ribosomal protein L7/L12  62.7 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927716  normal  0.299454 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  52.46 
 
 		 122 aa  106  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0570  50S ribosomal protein L7/L12  65.08 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000202265  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  53.54 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  54.92 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  60.47 
 
 		 128 aa  105  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  59.02 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  57.5 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  57.5 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  57.69 
 
 		 129 aa  103  8e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 		 123 aa  103  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4677  50S ribosomal protein L7/L12  59.38 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0969346  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  60.32 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0233  ribosomal protein L7/L12  64.75 
 
 		 129 aa  100  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.643135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  53.66 
 
 		 128 aa  100  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  56.69 
 
 		 126 aa  100  7e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1803  50S ribosomal protein L12P  60.32 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1548  ribosomal protein L7/L12  58.2 
 
 		 127 aa  98.2  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  59.02 
 
 		 125 aa  97.8  4e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0758  50S ribosomal protein L7/L12  55.83 
 
 		 126 aa  97.8  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.599811  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  50.39 
 
 		 129 aa  97.4  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 		 127 aa  96.7  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1473  50S ribosomal protein L7/L12  52.63 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000879556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1042  ribosomal protein L7/L12  63.49 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  60.98 
 
 		 128 aa  95.5  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4317  50S ribosomal protein L7/L12  51.09 
 
 		 140 aa  94.7  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0318  50S ribosomal protein L7/L12  55.12 
 
 		 126 aa  94.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0132009  hitchhiker  0.00085028 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4017  ribosomal protein L7/L12  51.64 
 
 		 127 aa  94.4  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.712821  normal  0.474419 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 		 126 aa  94.4  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  49.18 
 
 		 121 aa  94.4  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3329  50S ribosomal protein L7/L12  51.45 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.979565  normal  0.213901 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  60.32 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  45.9 
 
 		 121 aa  93.6  7e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  56.91 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  55.91 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  58.2 
 
 		 125 aa  92  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2107  50S ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 		 122 aa  91.7  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000324258  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2197  50S ribosomal protein L7/L12  56.56 
 
 		 122 aa  91.7  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000379347  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0567  50S ribosomal protein L7/L12  51.2 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0141  ribosomal protein L7/L12  63.21 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000137208  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4532  50S ribosomal protein L7/L12  56.03 
 
 		 126 aa  90.9  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0619  ribosomal protein L7/L12  56.25 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  56.56 
 
 		 125 aa  90.5  7e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2723  50S ribosomal protein L12P  56.35 
 
 		 129 aa  90.1  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000110024  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0925  50S ribosomal protein L7/L12  59.02 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0352  50S ribosomal protein L7/L12  51.67 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0074009  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3247  50S ribosomal protein L7/L12  56.03 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1107  ribosomal protein L7/L12  49.61 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0747227  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20970  50S ribosomal protein L7/L12  53.08 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  53.72 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  47.54 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0266  50S ribosomal protein L7/L12  48.82 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  58.2 
 
 		 124 aa  89.4  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0746  50S ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 		 124 aa  88.6  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00478946 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0509  50S ribosomal protein L7/L12  57.76 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2343  ribosomal protein L7/L12  53.97 
 
 		 125 aa  88.6  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00477548  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  58.2 
 
 		 125 aa  88.2  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0446  50S ribosomal protein L7/L12  52.46 
 
 		 121 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690504  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0188  50S ribosomal protein L7/L12  52.46 
 
 		 121 aa  87.8  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000136924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>