137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0170 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0170  putative glutathione S-transferase  100 
 
 
215 aa  446  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51860  Glutathione S-transferase, N-terminal:Glutathione S-transferase, C-terminal  39.13 
 
 
259 aa  136  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0992  glutathione S-transferase-like transmembrane protein  30.54 
 
 
360 aa  105  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644569  normal  0.256398 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2340  glutathione S-transferase  26.87 
 
 
272 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0809017  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2501  glutathione S-transferase-like protein  27.59 
 
 
360 aa  81.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.919556  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7338  glutathione S-transferase-like protein  28.43 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.475649  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5247  putative glutathione S-transferase GSTF2 (GST-II)  26.92 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal  0.155796 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2245  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.16 
 
 
207 aa  62.4  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3561  Glutathione S-transferase domain protein  27.83 
 
 
210 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134068  normal  0.24035 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2330  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.23 
 
 
210 aa  60.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.639612  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.83 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3962  putative glutathione S-transferase  26.7 
 
 
223 aa  60.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3629  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.83 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395815  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3752  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.83 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0132369  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3183  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.86 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  normal  0.024534 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0783  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.44 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1002  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.92 
 
 
218 aa  58.9  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  27.27 
 
 
220 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0755  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.96 
 
 
209 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.76216  normal  0.189515 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5257  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.21 
 
 
220 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.619423 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0033  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.87 
 
 
216 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  24.77 
 
 
220 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.14 
 
 
202 aa  55.8  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.09 
 
 
207 aa  55.8  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0800  N-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate reductase  24.57 
 
 
190 aa  55.5  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2389  Glutathione S-transferase domain protein  24.52 
 
 
183 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.71 
 
 
205 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  24.57 
 
 
205 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.71 
 
 
205 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  24.76 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2958  glutathione S-transferase domain-containing protein  22.56 
 
 
211 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.92 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.4 
 
 
207 aa  53.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.38 
 
 
205 aa  53.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  23.79 
 
 
201 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0838  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.23 
 
 
227 aa  53.1  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0531264  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2289  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.23 
 
 
252 aa  52.8  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497964  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  24.76 
 
 
201 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  22.5 
 
 
214 aa  52.4  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.14 
 
 
205 aa  52  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2979  glutathione S-transferase  26.29 
 
 
211 aa  51.6  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.978891  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5366  Glutathione S-transferase domain protein  24.07 
 
 
207 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4176  glutathione S-transferase-like  24.75 
 
 
225 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4051  putative glutathione S-transferase  28 
 
 
223 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2930  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.77 
 
 
217 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195248  hitchhiker  0.000964394 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.42 
 
 
207 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1132  glutathione S-transferase family protein  23.61 
 
 
224 aa  51.2  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6230  putative glutathione S-transferase  29.94 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0885  glutathione S-transferase  23.61 
 
 
224 aa  50.8  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0233753  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2509  glutathione S-transferase-like protein  25.91 
 
 
208 aa  50.1  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.640237  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1688  Glutathione S-transferase domain protein  25.36 
 
 
243 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.423888 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3092  glutathione S-transferase domain-containing protein  25 
 
 
205 aa  50.1  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.061874 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5781  Glutathione S-transferase domain protein  28.28 
 
 
217 aa  49.3  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2002  glutathione S-transferase-like protein  23.56 
 
 
185 aa  48.9  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0408  glutathione S-transferase-like  25.3 
 
 
200 aa  49.3  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.53035  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1043  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.76 
 
 
212 aa  49.3  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562576  normal  0.573525 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.48 
 
 
210 aa  49.3  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0014  glutathione S-transferase  28.22 
 
 
207 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1521  glutathione S-transferase  28.22 
 
 
207 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1164  glutathione S-transferase  28.22 
 
 
207 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1443  glutathione S-transferase  28.22 
 
 
207 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0019  glutathione S-transferase family protein  28.22 
 
 
207 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.207851  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0017  glutathione S-transferase family protein  28.22 
 
 
207 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0018  glutathione S-transferase  28.22 
 
 
207 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6850  Glutathione S-transferase domain protein  25.69 
 
 
213 aa  48.9  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0557  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.29 
 
 
221 aa  48.5  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3702  Glutathione S-transferase domain protein  24.44 
 
 
226 aa  48.5  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1256  glutathione S-transferase  24.85 
 
 
184 aa  47.8  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.522192  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3593  glutathione S-transferase-like  22.12 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.404871  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6849  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.14 
 
 
112 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2890  glutathione S-transferase-like  24.2 
 
 
215 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3077  glutathione S-transferase-like  23.74 
 
 
214 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.187241  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1854  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.06 
 
 
227 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0255739 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3813  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.16 
 
 
221 aa  47  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.340281  normal  0.596227 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3730  glutathione S-transferase-like  24.06 
 
 
205 aa  46.2  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3532  Glutathione S-transferase domain protein  24.74 
 
 
217 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2423  putative glutathione S-transferase  24.61 
 
 
217 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.76 
 
 
211 aa  46.6  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06190  putative glutathione S-transferase  35.06 
 
 
249 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0166402 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4729  glutathione S-transferase  25.86 
 
 
203 aa  45.8  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0556098  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0039  glutathione S-transferase-like protein  26.11 
 
 
218 aa  45.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0042  glutathione S-transferase-like  25.3 
 
 
196 aa  45.8  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.422861 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3505  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.37 
 
 
229 aa  45.8  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5977  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.96 
 
 
221 aa  45.8  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0221  stringent starvation protein A  25.12 
 
 
206 aa  45.1  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43404  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0579  putative glutathione S-transferase  33.77 
 
 
249 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05193  glutathione S-transferase III  22.64 
 
 
205 aa  45.4  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0398  Glutathione S-transferase domain  25.12 
 
 
206 aa  45.1  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.165939  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1089  glutathione S-transferase-like  26.67 
 
 
227 aa  45.1  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2579  glutathione S-transferase domain-containing protein  22.28 
 
 
217 aa  45.1  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.983145  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0607  putative glutathione S-transferase protein  23.08 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8292  Glutathione S-transferase domain protein  23 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1665  Glutathione S-transferase domain protein  23.56 
 
 
214 aa  44.7  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2015  glutathione S-transferase-like  22.17 
 
 
221 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1177  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.96 
 
 
207 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.902666  normal  0.114361 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1107  glutathione S-transferase  23.44 
 
 
223 aa  44.3  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.300035  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1470  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.68 
 
 
229 aa  44.3  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0523  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.47 
 
 
220 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118067 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001312  glutathione S-transferase  25 
 
 
205 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2196  glutathione S-transferase domain-containing protein  22.61 
 
 
208 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.827244 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>