More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0607 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0607  putative glutathione S-transferase protein  100 
 
 		 213 aa  432  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0537  Glutathione S-transferase domain  67.32 
 
 		 222 aa  295  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0524  Glutathione S-transferase domain protein  67.86 
 
 		 222 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3382  glutathione S-transferase domain-containing protein  72.4 
 
 		 219 aa  289  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5220  glutathione S-transferase domain-containing protein  72.4 
 
 		 219 aa  289  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0962693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1358  Glutathione S-transferase domain  57.84 
 
 		 206 aa  240  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3695  Glutathione S-transferase domain  54.73 
 
 		 215 aa  240  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0434501  hitchhiker  0.00000154046 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1699  Glutathione S-transferase domain protein  58.71 
 
 		 211 aa  237  9e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2508  Glutathione S-transferase domain  55.61 
 
 		 214 aa  234  9e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3564  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.84 
 
 		 211 aa  231  9e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.146055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6685  glutathione S-transferase  50.48 
 
 		 214 aa  224  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4826  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.06 
 
 		 211 aa  221  8e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3512  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0065  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.95 
 
 		 213 aa  197  7.999999999999999e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.82 
 
 		 200 aa  158  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.55 
 
 		 205 aa  158  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.88 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2556  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.97 
 
 		 210 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1820  glutathione S-transferase-like protein  37.81 
 
 		 201 aa  144  7.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.631165 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0897  glutathione S-transferase  41.45 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1991  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.1 
 
 		 206 aa  142  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175013  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0031  glutathione S-transferase  39.49 
 
 		 198 aa  139  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0039  glutathione S-transferase-like  39.49 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1689  glutathione S-transferase-like  36.89 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1955  Glutathione S-transferase domain  36.84 
 
 		 208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0193951  normal  0.329521 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0995  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.68 
 
 		 213 aa  131  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5702  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.75 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.366134  normal  0.106893 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6295  glutathione S-transferase-like protein  36.63 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2964  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.63 
 
 		 204 aa  128  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2958  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.2 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2166  Glutathione S-transferase domain protein  35.89 
 
 		 208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193029  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2329  glutathione S-transferase-like  36.63 
 
 		 204 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209551  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2943  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.63 
 
 		 204 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2889  glutathione S-transferase-like  37.44 
 
 		 209 aa  125  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.737778  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2990  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.14 
 
 		 204 aa  124  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0145  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.94 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.397548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2937  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.64 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2853  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.14 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4394  Glutathione S-transferase domain  37.62 
 
 		 213 aa  122  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0144  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.18 
 
 		 205 aa  121  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.14 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.519007  normal  0.381422 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4505  Glutathione S-transferase domain  37.56 
 
 		 213 aa  118  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal  0.527562 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2778  glutathione S-transferase-like protein  35.27 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.910721 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1911  glutathione S-transferase  34 
 
 		 207 aa  116  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00444  glutathione S-transferase  51.46 
 
 		 116 aa  114  8.999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0188129  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4186  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.46 
 
 		 202 aa  112  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.367804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.84 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2090  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.14 
 
 		 227 aa  112  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.55 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.49 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3561  Glutathione S-transferase domain protein  33.81 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134068  normal  0.24035 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.16 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2628  Glutathione S-transferase domain  35.12 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2823  glutathione S-transferase  34.98 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0457673  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0407  glutathione S-transferase  34 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2600  glutathione S-transferase  34.48 
 
 		 200 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.465574 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  32.99 
 
 		 205 aa  98.2  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3629  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.86 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395815  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3752  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.86 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0132369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.64 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3183  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.37 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  normal  0.024534 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0783  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.37 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.64 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  32 
 
 		 201 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  31.5 
 
 		 201 aa  95.9  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0755  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.37 
 
 		 209 aa  95.5  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.76216  normal  0.189515 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.12 
 
 		 205 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  31.5 
 
 		 201 aa  94.7  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.64 
 
 		 205 aa  92.4  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2002  glutathione S-transferase-like protein  31.09 
 
 		 185 aa  92  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0243  glutathione S-transferase-like  30 
 
 		 220 aa  90.9  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.34 
 
 		 202 aa  90.9  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0039  glutathione S-transferase-like protein  28.08 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0838  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.77 
 
 		 227 aa  89  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0531264  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2020  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.09 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001312  glutathione S-transferase  30.5 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.57 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3767  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.35 
 
 		 222 aa  85.5  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2423  putative glutathione S-transferase  27.83 
 
 		 217 aa  85.1  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0508  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.21 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1471  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.24 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.214549 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2979  glutathione S-transferase  25.29 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.978891  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4867  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.83 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0739  glutathione S-transferase-like protein  28.84 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000125702  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0387  glutathione S-transferase-like  29.95 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2161  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.75 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2859  Glutathione S-transferase domain protein  31.4 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5409  Glutathione S-transferase domain  33.83 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2947  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.91 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.282557  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0014  glutathione S-transferase-like protein  28.93 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.198681  normal  0.0539534 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3680  glutathione S-transferase  26.44 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0197  Glutathione S-transferase domain protein  31.68 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4165  glutathione S-transferase-like  34.33 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5352  Glutathione S-transferase domain  33.83 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0259  glutathione S-transferase domain-containing protein  30 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4290  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.67 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4150  glutathione S-transferase domain protein  29.9 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4110  Glutathione S-transferase domain protein  29.9 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0178  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.19 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2389  Glutathione S-transferase domain protein  28.72 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.587961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>