230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0800 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0800  N-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate reductase  100 
 
 		 190 aa  395  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.19 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2340  glutathione S-transferase  29.21 
 
 		 272 aa  67  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0809017  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2501  glutathione S-transferase-like protein  27.75 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.919556  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0992  glutathione S-transferase-like transmembrane protein  25.58 
 
 		 360 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644569  normal  0.256398 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51860  Glutathione S-transferase, N-terminal:Glutathione S-transferase, C-terminal  26.86 
 
 		 259 aa  61.2  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  25 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4025  Glutathione S-transferase domain  23.38 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.853688  normal  0.245138 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  27.67 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4998  glutathione S-transferase-like protein  23.27 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0183331  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.87 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.48 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5247  putative glutathione S-transferase GSTF2 (GST-II)  25.73 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal  0.155796 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0170  putative glutathione S-transferase  24.57 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.58 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0926  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.14 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.017472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1955  Glutathione S-transferase domain  27.59 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0193951  normal  0.329521 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7338  glutathione S-transferase-like protein  22.91 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.475649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  29.11 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  25 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1911  glutathione S-transferase  25.78 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5440  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.14 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0145  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.13 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.397548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2508  Glutathione S-transferase domain  27.97 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0897  glutathione S-transferase  26.38 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  23.81 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  27.61 
 
 		 220 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2330  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.28 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.639612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0442  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.57 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2166  Glutathione S-transferase domain protein  28.32 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193029  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2556  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.38 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0079  glutathione S-transferase-like  28 
 
 		 221 aa  52.4  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  27.11 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09299  glutathione transferase (Eurofung)  29.37 
 
 		 237 aa  52  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.018125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6849  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.71 
 
 		 112 aa  52  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  24.4 
 
 		 201 aa  51.2  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4150  glutathione S-transferase domain protein  31.67 
 
 		 186 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4110  Glutathione S-transferase domain protein  31.67 
 
 		 186 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.59 
 
 		 208 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3564  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.93 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.146055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4186  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.91 
 
 		 202 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.367804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.12 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  23.53 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1469  glutathione S-transferase domain-containing protein  24 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3457  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.17 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0220469  normal  0.0243961 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3532  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.5 
 
 		 238 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1991  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.32 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175013  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0839  glutathione S-transferase family protein  27.13 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1689  glutathione S-transferase-like  28.46 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2090  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.21 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1894  glutathione S-transferase family protein  24 
 
 		 207 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00008239 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4215  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.84 
 
 		 220 aa  48.9  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0158899 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1077  Glutathione S-transferase domain protein  29.27 
 
 		 216 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2245  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.19 
 
 		 207 aa  48.9  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.33 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4995  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.5 
 
 		 218 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401874 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.98 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0789  Glutathione S-transferase domain  26.83 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.100128 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1641  Glutathione S-transferase domain protein  24.31 
 
 		 240 aa  48.5  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606226  normal  0.332972 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1629  glutathione S-transferase  23.04 
 
 		 207 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.197221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3092  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.75 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.061874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3821  glutathione S-transferase domain-containing protein  24 
 
 		 207 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3695  Glutathione S-transferase domain  28.81 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0434501  hitchhiker  0.00000154046 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5781  Glutathione S-transferase domain protein  31.58 
 
 		 217 aa  48.5  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4891  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.5 
 
 		 216 aa  48.5  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.479159 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1329  glutathione S-transferase domain-containing protein  22.75 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.923957  normal  0.630065 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3560  Glutathione S-transferase domain  28.85 
 
 		 213 aa  48.1  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.945145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5865  glutathione S-transferase-like protein  27.06 
 
 		 166 aa  48.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06563  elongation factor 1-gamma, putative (Eurofung)  27.98 
 
 		 411 aa  48.1  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.246122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1653  Glutathione S-transferase domain protein  24.64 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  23.23 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1843  Glutathione S-transferase domain protein  30.38 
 
 		 217 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1699  Glutathione S-transferase domain protein  29.66 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2824  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.83 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3329  Glutathione S-transferase domain  23.16 
 
 		 235 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1306  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.2 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0607  putative glutathione S-transferase protein  27.69 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4069  putative glutathione-S-transferase protein  28.19 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.822879 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3856  glutathione S-transferase family protein  22.55 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3775  putative glutathione-S-transferase protein  28.19 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1381  Glutathione S-transferase domain protein  29.27 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0785607  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2483  glutathione S-transferase-like protein  23.72 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.478501  normal  0.101029 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1407  Glutathione S-transferase domain protein  23.6 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0606838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.74 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3950  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.24 
 
 		 227 aa  46.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.532798  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2631  glutathione S-transferase-like  30 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.400604  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4030  putative glutathione-S-transferase protein  28.19 
 
 		 240 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  24.24 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1946  Glutathione S-transferase domain protein  23.04 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.243361  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1469  glutathione S-transferase-like  27.38 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368467  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.45 
 
 		 220 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3435  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.17 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.288694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.24 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1684  glutathione S-transferase-like protein  26.4 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.24 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  25.74 
 
 		 255 aa  47  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  22.67 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6685  glutathione S-transferase  29.27 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2364  glutathione S-transferase-like protein  29.01 
 
 		 220 aa  45.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0709999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1555  glutathione S-transferase-like  22.67 
 
 		 203 aa  45.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>