251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ01230 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006679  CNJ01230  thymidylate synthase  100 
 
 		 317 aa  659    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0538613  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37780  Thymidylate synthase  63.14 
 
 		 316 aa  411  1e-114  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0107754 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07028  hypothetical protein similar to thymidylate synthase (Broad)  60.18 
 
 		 674 aa  402  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_1690  predicted protein  61.39 
 
 		 495 aa  367  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49676  predicted protein  59.87 
 
 		 499 aa  360  1e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.21688 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_2087  predicted protein  67.26 
 
 		 217 aa  296  4e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2314  thymidylate synthase  46.15 
 
 		 290 aa  256  3e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2011  thymidylate synthase  45.9 
 
 		 300 aa  255  6e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2331  thymidylate synthase  49.13 
 
 		 286 aa  251  8.000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3266  thymidylate synthase  44.93 
 
 		 264 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394281  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3354  thymidylate synthase  44.59 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819498 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0901  thymidylate synthase  47.2 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1471  thymidylate synthase  44.48 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3385  thymidylate synthase  46.55 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2036  thymidylate synthase  44.9 
 
 		 264 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2051  thymidylate synthase  45.39 
 
 		 283 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.266097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2832  thymidylate synthase  46.85 
 
 		 264 aa  238  8e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6453  thymidylate synthase  45.61 
 
 		 264 aa  238  8e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4007  thymidylate synthase  44.75 
 
 		 264 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.997554  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6100  thymidylate synthase  44.44 
 
 		 264 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2311  thymidylate synthase  45.1 
 
 		 273 aa  238  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1309  thymidylate synthase  46.5 
 
 		 264 aa  237  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00097821  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1422  thymidylate synthase  45.45 
 
 		 264 aa  236  4e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.54015 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2351  thymidylate synthase  44.26 
 
 		 264 aa  236  4e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.914614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1410  hypothetical protein  43.79 
 
 		 264 aa  236  4e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.290298 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0699  thymidylate synthase  45.26 
 
 		 264 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312797  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5002  thymidylate synthase  45.17 
 
 		 273 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000135835  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1116  thymidylate synthase  45.8 
 
 		 277 aa  235  6e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4213  thymidylate synthase  45.61 
 
 		 264 aa  235  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3396  thymidylate synthase  45.8 
 
 		 264 aa  235  7e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0862662  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2986  thymidylate synthase  46.32 
 
 		 277 aa  235  8e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0906  thymidylate synthase  45.77 
 
 		 264 aa  235  8e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1050  thymidylate synthase  45.77 
 
 		 264 aa  235  8e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1592  thymidylate synthase  44.76 
 
 		 264 aa  235  8e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00136284  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4525  thymidylate synthase  46.67 
 
 		 264 aa  235  8e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.659361 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3514  thymidylate synthase  43.9 
 
 		 264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.34042  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1197  thymidylate synthase  45.45 
 
 		 277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.489198 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0907  thymidylate synthase  45.45 
 
 		 264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.639895  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3195  thymidylate synthase  45.45 
 
 		 264 aa  233  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1036  thymidylate synthase  44.41 
 
 		 264 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0984  thymidylate synthase  44.41 
 
 		 264 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00298799  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3238  thymidylate synthase  44.41 
 
 		 264 aa  233  3e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.488211  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2027  thymidylate synthase  42.63 
 
 		 285 aa  233  3e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.242999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0888  thymidylate synthase  45.8 
 
 		 264 aa  232  5e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2040  thymidylate synthase  44.91 
 
 		 264 aa  233  5e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00561284  normal  0.510775 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2973  thymidylate synthase  45.8 
 
 		 264 aa  232  5e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.942182  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13308  thymidylate synthase  42.81 
 
 		 274 aa  232  6e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.372372  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3269  thymidylate synthase  45.45 
 
 		 264 aa  232  6e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0325419  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0864  Thymidylate synthase  45.45 
 
 		 264 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2974  thymidylate synthase  45.45 
 
 		 264 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0248193  normal  0.0110834 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4093  thymidylate synthase  45.45 
 
 		 264 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00531915  normal  0.186397 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3147  thymidylate synthase  45.45 
 
 		 264 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02675  thymidylate synthase  45.8 
 
 		 264 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0328967  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3821  thymidylate synthase  45.8 
 
 		 264 aa  231  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0782248  normal  0.435378 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02636  hypothetical protein  45.8 
 
 		 264 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0282174  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1729  thymidylate synthase  45.7 
 
 		 277 aa  231  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1664  thymidylate synthase  45.61 
 
 		 289 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2887  Thymidylate synthase  45.61 
 
 		 264 aa  231  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.189852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2572  thymidylate synthase  43.39 
 
 		 264 aa  231  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.31562  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0404  thymidylate synthase  45.07 
 
 		 290 aa  230  2e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3014  thymidylate synthase  45.45 
 
 		 264 aa  231  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2812  thymidylate synthase  44.76 
 
 		 264 aa  230  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000021691  hitchhiker  0.0000331365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2660  thymidylate synthase  45.61 
 
 		 264 aa  231  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0593  thymidylate synthase  44.91 
 
 		 264 aa  230  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.931359 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2730  thymidylate synthase  43.24 
 
 		 264 aa  229  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1289  thymidylate synthase  45.1 
 
 		 264 aa  230  3e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.994913  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_002950  PG2060  thymidylate synthase  44.06 
 
 		 267 aa  229  4e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2730  thymidylate synthase  46.13 
 
 		 267 aa  229  4e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1242  thymidylate synthase  42.53 
 
 		 274 aa  229  5e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0595722  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0381  thymidylate synthase  43.51 
 
 		 264 aa  229  5e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1823  thymidylate synthase  45.26 
 
 		 284 aa  229  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10557  hitchhiker  0.00355293 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3035  thymidylate synthase  45.1 
 
 		 264 aa  229  7e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0165  thymidylate synthase  41.72 
 
 		 266 aa  228  9e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.437022  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2822  thymidylate synthase  44.91 
 
 		 264 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0100579  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1091  thymidylate synthase  44.56 
 
 		 264 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0270966 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0889  thymidylate synthase  44.72 
 
 		 280 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3172  thymidylate synthase  45.42 
 
 		 298 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29370  thymidylate synthase  45.42 
 
 		 267 aa  227  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2802  thymidylate synthase  45.26 
 
 		 264 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395384  normal  0.702269 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0818  thymidylate synthase  45.07 
 
 		 264 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3165  thymidylate synthase  43.71 
 
 		 264 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.623255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0915  thymidylate synthase  44.21 
 
 		 264 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3328  thymidylate synthase  43.71 
 
 		 264 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937763 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3214  thymidylate synthase  43.71 
 
 		 264 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0238211 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3228  thymidylate synthase  43.71 
 
 		 264 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434826 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2448  thymidylate synthase  43.86 
 
 		 264 aa  226  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.848435  normal  0.156064 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3148  thymidylate synthase  43.71 
 
 		 264 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1450  thymidylate synthase  44.01 
 
 		 279 aa  226  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.810743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2772  thymidylate synthase  45.1 
 
 		 276 aa  226  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.023604 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0947  thymidylate synthase  44.37 
 
 		 264 aa  226  4e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09380  thymidylate synthase  43.36 
 
 		 264 aa  226  4e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21237  normal  0.43537 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1792  thymidylate synthase  44.72 
 
 		 264 aa  226  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0662  thymidylate synthase  45.61 
 
 		 264 aa  226  6e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2782  Thymidylate synthase  43.86 
 
 		 264 aa  225  7e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0986115  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2061  thymidylate synthase  41.46 
 
 		 318 aa  225  8e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691147  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04480  thymidylate synthase  44.21 
 
 		 264 aa  225  8e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2747  Thymidylate synthase  43.1 
 
 		 277 aa  225  9e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4970  thymidylate synthase  43.24 
 
 		 274 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1399  thymidylate synthase  42.96 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0350  thymidylate synthase  43.18 
 
 		 277 aa  224  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.82099  normal  0.227002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>