248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_2087 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_2087  predicted protein  100 
 
 		 217 aa  455  1e-127  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_1690  predicted protein  95.39 
 
 		 495 aa  427  1e-119  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49676  predicted protein  75.81 
 
 		 499 aa  335  1.9999999999999998e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.21688 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01230  thymidylate synthase  67.26 
 
 		 317 aa  296  2e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0538613  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07028  hypothetical protein similar to thymidylate synthase (Broad)  63.56 
 
 		 674 aa  295  3e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37780  Thymidylate synthase  60.68 
 
 		 316 aa  285  2.9999999999999996e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0107754 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2314  thymidylate synthase  52.8 
 
 		 290 aa  232  3e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2011  thymidylate synthase  52.56 
 
 		 300 aa  228  8e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2331  thymidylate synthase  52.53 
 
 		 286 aa  225  4e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226871 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2047  thymidylate synthase  54.5 
 
 		 264 aa  225  5.0000000000000005e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1422  thymidylate synthase  53.05 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.54015 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1309  thymidylate synthase  52.83 
 
 		 264 aa  218  6e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00097821  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2832  thymidylate synthase  53.77 
 
 		 264 aa  218  7e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1289  thymidylate synthase  53.05 
 
 		 264 aa  217  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.994913  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1664  thymidylate synthase  53.24 
 
 		 289 aa  216  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4213  thymidylate synthase  53.52 
 
 		 264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2572  thymidylate synthase  53.77 
 
 		 264 aa  215  4e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.31562  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2051  thymidylate synthase  53.24 
 
 		 283 aa  215  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.266097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1854  thymidylate synthase  53.05 
 
 		 264 aa  214  5.9999999999999996e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.247947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0381  thymidylate synthase  51.42 
 
 		 264 aa  214  7e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1355  thymidylate synthase  53.52 
 
 		 264 aa  213  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0892428  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1399  thymidylate synthase  53.52 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3514  thymidylate synthase  52.83 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.34042  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1592  thymidylate synthase  52.58 
 
 		 264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00136284  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0901  thymidylate synthase  53.05 
 
 		 264 aa  212  3.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2986  thymidylate synthase  52.31 
 
 		 277 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4525  thymidylate synthase  55.92 
 
 		 264 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.659361 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0889  thymidylate synthase  52.09 
 
 		 280 aa  211  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0699  thymidylate synthase  53.99 
 
 		 264 aa  211  7e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312797  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0387  thymidylate synthase  50.94 
 
 		 264 aa  211  7e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.610342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0818  thymidylate synthase  52.36 
 
 		 264 aa  210  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5002  thymidylate synthase  53.67 
 
 		 273 aa  209  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000135835  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1792  thymidylate synthase  53.05 
 
 		 264 aa  209  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1823  thymidylate synthase  52.78 
 
 		 284 aa  209  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10557  hitchhiker  0.00355293 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0947  thymidylate synthase  52.36 
 
 		 264 aa  208  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04480  thymidylate synthase  52.11 
 
 		 264 aa  208  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1789  thymidylate synthase  53.81 
 
 		 290 aa  208  4e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.748216  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2311  thymidylate synthase  51.82 
 
 		 273 aa  209  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0436  thymidylate synthase  52.11 
 
 		 264 aa  208  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2351  thymidylate synthase  53.77 
 
 		 264 aa  208  5e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.914614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1091  thymidylate synthase  53.52 
 
 		 264 aa  208  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0270966 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2822  thymidylate synthase  52.58 
 
 		 264 aa  208  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0100579  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1036  thymidylate synthase  51.42 
 
 		 264 aa  207  8e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3266  thymidylate synthase  51.89 
 
 		 264 aa  207  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394281  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2802  thymidylate synthase  53.05 
 
 		 264 aa  207  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395384  normal  0.702269 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0984  thymidylate synthase  51.42 
 
 		 264 aa  207  8e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00298799  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3238  thymidylate synthase  51.42 
 
 		 264 aa  207  8e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.488211  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2781  thymidylate synthase  51.42 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4970  thymidylate synthase  53.08 
 
 		 274 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23310  thymidylate synthase  52.13 
 
 		 271 aa  206  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.0233829 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0906  thymidylate synthase  52.11 
 
 		 264 aa  206  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1050  thymidylate synthase  52.11 
 
 		 264 aa  206  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3385  thymidylate synthase  52.8 
 
 		 283 aa  206  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1450  thymidylate synthase  50.7 
 
 		 279 aa  206  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.810743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2021  thymidylate synthase  52.58 
 
 		 264 aa  206  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2543  thymidylate synthase  52.11 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.33393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0915  thymidylate synthase  50.47 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2040  thymidylate synthase  52.11 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00561284  normal  0.510775 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2568  thymidylate synthase  49.06 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3354  thymidylate synthase  52.83 
 
 		 264 aa  205  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819498 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1729  thymidylate synthase  51.38 
 
 		 277 aa  205  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2927  thymidylate synthase  50.94 
 
 		 264 aa  205  5e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2448  thymidylate synthase  53.05 
 
 		 264 aa  205  5e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.848435  normal  0.156064 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3172  thymidylate synthase  52.09 
 
 		 298 aa  205  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6100  thymidylate synthase  53.3 
 
 		 264 aa  204  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0888  thymidylate synthase  51.42 
 
 		 264 aa  204  7e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2973  thymidylate synthase  51.42 
 
 		 264 aa  204  7e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.942182  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0593  thymidylate synthase  50.7 
 
 		 264 aa  204  7e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.931359 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1962  thymidylate synthase  50.47 
 
 		 264 aa  204  7e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2082  thymidylate synthase  46.43 
 
 		 318 aa  204  8e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2020  thymidylate synthase  46.43 
 
 		 318 aa  204  8e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2236  thymidylate synthase  46.43 
 
 		 318 aa  204  8e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.376946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2263  thymidylate synthase  46.43 
 
 		 318 aa  204  8e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45604e-29 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0404  thymidylate synthase  51.43 
 
 		 290 aa  204  9e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1116  thymidylate synthase  50.93 
 
 		 277 aa  203  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0097  thymidylate synthase  51.64 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2027  thymidylate synthase  51.87 
 
 		 285 aa  203  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.242999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48170  thymidylate synthase  50.23 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3105  thymidylate synthase  46.83 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.447667  hitchhiker  0.0000000000170345 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1197  thymidylate synthase  50.93 
 
 		 277 aa  203  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.489198 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4491  thymidylate synthase  50.69 
 
 		 276 aa  203  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.232863 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02675  thymidylate synthase  50.94 
 
 		 264 aa  202  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0328967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0864  Thymidylate synthase  50.94 
 
 		 264 aa  202  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4093  thymidylate synthase  50.94 
 
 		 264 aa  202  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00531915  normal  0.186397 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2974  thymidylate synthase  50.94 
 
 		 264 aa  202  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0248193  normal  0.0110834 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2266  thymidylate synthase  46.43 
 
 		 318 aa  202  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0871479  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1471  thymidylate synthase  48.07 
 
 		 283 aa  203  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02636  hypothetical protein  50.94 
 
 		 264 aa  202  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0282174  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0662  thymidylate synthase  51.42 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2020  thymidylate synthase  46.43 
 
 		 318 aa  202  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2730  thymidylate synthase  51.89 
 
 		 264 aa  202  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1751  thymidylate synthase  51.64 
 
 		 264 aa  202  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0575891  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3147  thymidylate synthase  50.94 
 
 		 264 aa  202  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2061  thymidylate synthase  46.43 
 
 		 318 aa  202  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2348  thymidylate synthase  46.43 
 
 		 318 aa  202  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000465459  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2219  thymidylate synthase  46.43 
 
 		 318 aa  203  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.615313  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3214  thymidylate synthase  50.94 
 
 		 264 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0238211 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3165  thymidylate synthase  50.94 
 
 		 264 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.623255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3228  thymidylate synthase  50.94 
 
 		 264 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434826 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3148  thymidylate synthase  50.94 
 
 		 264 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>