More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB02860 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB02860  tRNA adenylyltransferase, putative  100 
 
 
504 aa  1032    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31221  predicted protein  32.15 
 
 
559 aa  251  2e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.443393 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34467  predicted protein  33.87 
 
 
525 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.250133  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10924  tRNA nucleotidyltransferase (AFU_orthologue; AFUA_2G16660)  42.96 
 
 
605 aa  213  4.9999999999999996e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48911  predicted protein  31.49 
 
 
631 aa  205  2e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33610  predicted protein  37.67 
 
 
729 aa  149  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0854  Polynucleotide adenylyltransferase region  38.1 
 
 
468 aa  126  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00520307 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2415  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.78 
 
 
471 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5957  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.16 
 
 
483 aa  120  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0872  hypothetical protein  32.87 
 
 
474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06110  tRNA nucleotidyltransferase  34.96 
 
 
477 aa  114  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0992  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.18 
 
 
471 aa  113  7.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2058  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.36 
 
 
469 aa  110  5e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1525  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.93 
 
 
475 aa  110  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0665  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.72 
 
 
484 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0990908 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1306  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.77 
 
 
489 aa  108  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4906  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.54 
 
 
495 aa  108  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0801  polyA polymerase family protein  35.04 
 
 
483 aa  106  8e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0722  HDIG  29.96 
 
 
476 aa  106  9e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314731  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1109  metal dependent phosphohydrolase  32.07 
 
 
470 aa  106  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.875974  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1213  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.58 
 
 
479 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1151  polyA polymerase family protein  31.87 
 
 
475 aa  102  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.71029 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2535  tRNA adenylyltransferase (tRNA nucleotidyl transferase)  30.28 
 
 
479 aa  93.2  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1021  polynucleotide adenylyltransferase region  34.98 
 
 
400 aa  91.3  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4849  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.3 
 
 
499 aa  91.3  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0077  poly(A) polymerase family protein  32 
 
 
410 aa  91.3  4e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.991708  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3102  metal-dependent phosphohydrolase  32.75 
 
 
552 aa  90.9  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2030  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.73 
 
 
854 aa  90.9  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.609547  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23340  tRNA adenylyltransferase  30.92 
 
 
483 aa  87.8  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1449  tRNA nucleotidyltransferase  33.95 
 
 
471 aa  87.4  5e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1710  tRNA adenylyltransferase  33.49 
 
 
394 aa  85.9  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.141453  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7321  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  25.57 
 
 
508 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1564  polynucleotide adenylyltransferase region  24.57 
 
 
388 aa  84.7  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  27.68 
 
 
464 aa  85.1  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2544  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.32 
 
 
561 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0497  metal dependent phosphohydrolase  31.97 
 
 
454 aa  84.7  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0060  tRNA adenylyltransferase  33.77 
 
 
475 aa  84  0.000000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.451798 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5092  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.41 
 
 
485 aa  84  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588683 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31840  tRNA adenylyltransferase  31.06 
 
 
471 aa  83.6  0.000000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.48 
 
 
873 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4840  tRNA adenylyltransferase  24.48 
 
 
489 aa  82.8  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.305864  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4574  HDIG domain-containing protein  29.84 
 
 
485 aa  82.8  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0125  polyA polymerase  27.78 
 
 
457 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000172768  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03448  nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  27.31 
 
 
462 aa  82  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4968  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.44 
 
 
490 aa  81.6  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5079  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  25.35 
 
 
487 aa  81.3  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7079  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  25.1 
 
 
502 aa  80.9  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002563  poly(A) polymerase  27.75 
 
 
453 aa  81.3  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000329901  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  27.92 
 
 
883 aa  81.3  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4207  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.7 
 
 
483 aa  81.3  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2542  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.26 
 
 
492 aa  80.5  0.00000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.277933 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2991  poly(A) polymerase  27.59 
 
 
540 aa  80.1  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.406392  normal  0.256154 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4014  poly(A) polymerase  26.78 
 
 
484 aa  79.7  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0546071  normal  0.868909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4809  Poly(A) polymerase, PcnB  28.24 
 
 
466 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0814505  normal  0.0275687 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  27.95 
 
 
863 aa  79  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1390  poly(A) polymerase  31.96 
 
 
424 aa  79  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3571  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.42 
 
 
483 aa  79  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.564653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9036  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.43 
 
 
491 aa  78.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0497  metal dependent phosphohydrolase  32.27 
 
 
492 aa  78.2  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  23.83 
 
 
865 aa  78.2  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0279  hypothetical protein  29.2 
 
 
549 aa  78.2  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3020  putative polynucleotide adenylyltransferase protein  27.38 
 
 
535 aa  77.8  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.03108  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4696  poly(A) polymerase  32.61 
 
 
462 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724393 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0290  poly(A) polymerase  29.2 
 
 
556 aa  77  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0301  poly(A) polymerase  29.2 
 
 
556 aa  77  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6049  poly(A) polymerase  29.52 
 
 
495 aa  77  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.694866  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0026  polyA polymerase family protein  30.04 
 
 
424 aa  77  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0767  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30 
 
 
403 aa  77  0.0000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.746315  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  27.56 
 
 
863 aa  76.6  0.0000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4697  poly(A) polymerase  32.61 
 
 
460 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  hitchhiker  0.0000455164 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1516  tRNA CCA-pyrophosphorylase  27.71 
 
 
400 aa  76.6  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4562  poly(A) polymerase  30.62 
 
 
460 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263697 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1545  tRNA CCA-pyrophosphorylase  27.71 
 
 
400 aa  76.6  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00353359  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2295  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.33 
 
 
448 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.730804  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3827  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.78 
 
 
459 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2607  poly(A) polymerase (plasmid copy number protein)  27.06 
 
 
441 aa  76.3  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000156252  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0026  polyA polymerase family protein  30.34 
 
 
422 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0736  poly(A) polymerase  32.78 
 
 
462 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000305046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6061  metal dependent phosphohydrolase  24.18 
 
 
483 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.182815 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1864  tRNA adenylyltransferase  32.03 
 
 
420 aa  76.3  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.124392  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.14 
 
 
877 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2057  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.66 
 
 
465 aa  75.5  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000115369  normal  0.734292 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3901  polynucleotide adenylyltransferase  28.4 
 
 
496 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000197413  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1314  polyA polymerase  27.39 
 
 
514 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283102  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4531  metal dependent phosphohydrolase  32.67 
 
 
502 aa  75.9  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5397  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.24 
 
 
464 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0461  tRNA CCA-pyrophosphorylase  29.09 
 
 
402 aa  75.5  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4681  HDIG domain-containing protein  31.44 
 
 
483 aa  75.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3304  poly(A) polymerase  27.39 
 
 
515 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3271  poly(A) polymerase  27.39 
 
 
515 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.264957  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2199  poly(A) polymerase  27.39 
 
 
515 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.968524  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2320  polyA polymerase  27.39 
 
 
515 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1092  polyA polymerase  27.39 
 
 
515 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3314  polyA polymerase  27.39 
 
 
515 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  29.78 
 
 
859 aa  75.1  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0845  metal dependent phosphohydrolase  24.69 
 
 
497 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0325439  normal  0.188962 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0507  polyA polymerase  27.39 
 
 
515 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0830  Poly(A) polymerase  28.51 
 
 
491 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.715876  hitchhiker  0.000411869 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0646  polyA polymerase family protein  31.22 
 
 
392 aa  74.3  0.000000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4494  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.84 
 
 
508 aa  74.7  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0150465  normal  0.139356 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>