More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_33610 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_33610  predicted protein  100 
 
 
729 aa  1494    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34467  predicted protein  39.77 
 
 
525 aa  273  6e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.250133  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48911  predicted protein  30.15 
 
 
631 aa  213  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10924  tRNA nucleotidyltransferase (AFU_orthologue; AFUA_2G16660)  39.5 
 
 
605 aa  207  4e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31221  predicted protein  35.32 
 
 
559 aa  205  3e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.443393 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02860  tRNA adenylyltransferase, putative  37.67 
 
 
504 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2415  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.28 
 
 
471 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0854  Polynucleotide adenylyltransferase region  36.32 
 
 
468 aa  102  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00520307 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5957  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.75 
 
 
483 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0872  hypothetical protein  32.09 
 
 
474 aa  99  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1306  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.25 
 
 
489 aa  97.4  8e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4849  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
499 aa  96.3  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2058  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.88 
 
 
469 aa  96.3  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4906  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.97 
 
 
495 aa  95.1  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06110  tRNA nucleotidyltransferase  36.75 
 
 
477 aa  94.4  7e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0992  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.26 
 
 
471 aa  93.2  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0665  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.82 
 
 
484 aa  90.9  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0990908 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4968  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.36 
 
 
490 aa  90.1  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1151  polyA polymerase family protein  36.63 
 
 
475 aa  89.4  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.71029 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4531  metal dependent phosphohydrolase  29.62 
 
 
502 aa  89.7  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7321  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.17 
 
 
508 aa  89.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1213  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.26 
 
 
479 aa  88.6  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0801  polyA polymerase family protein  35.86 
 
 
483 aa  87.8  6e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3102  metal-dependent phosphohydrolase  30.81 
 
 
552 aa  88.2  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1109  metal dependent phosphohydrolase  33.72 
 
 
470 aa  87.8  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.875974  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1525  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.19 
 
 
475 aa  86.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0722  HDIG  33.92 
 
 
476 aa  86.3  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314731  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9036  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.8 
 
 
491 aa  85.5  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4574  HDIG domain-containing protein  35.47 
 
 
485 aa  84.7  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2535  tRNA adenylyltransferase (tRNA nucleotidyl transferase)  33.14 
 
 
479 aa  84.7  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  27.47 
 
 
859 aa  84.3  0.000000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5092  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.5 
 
 
485 aa  84.3  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588683 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2857  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.29 
 
 
484 aa  83.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.858546  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0845  metal dependent phosphohydrolase  29.3 
 
 
497 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0325439  normal  0.188962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9369  hypothetical protein  30.14 
 
 
479 aa  83.2  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6061  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
483 aa  82  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.182815 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5486  metal dependent phosphohydrolase  34.1 
 
 
489 aa  81.3  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.527547  normal  0.550288 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5397  metal dependent phosphohydrolase  31.22 
 
 
455 aa  80.9  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517114  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1488  Poly(A) polymerase (PAP) (plasmid copy number protein)  33.11 
 
 
423 aa  80.1  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4157  metal dependent phosphohydrolase  34.12 
 
 
496 aa  80.1  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5773  metal dependent phosphohydrolase  30.73 
 
 
489 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.626419 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23340  tRNA adenylyltransferase  29 
 
 
483 aa  79.7  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4681  HDIG domain-containing protein  32.22 
 
 
483 aa  79.3  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31840  tRNA adenylyltransferase  31.55 
 
 
471 aa  79  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4223  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.95 
 
 
486 aa  79  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5079  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.22 
 
 
487 aa  79  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4207  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.28 
 
 
483 aa  79  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  28.63 
 
 
863 aa  78.6  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3571  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.36 
 
 
483 aa  78.6  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.564653 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3712  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.87 
 
 
507 aa  78.2  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353872  normal  0.0967324 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1449  tRNA nucleotidyltransferase  34.05 
 
 
471 aa  78.2  0.0000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1495  Poly(A) polymerase (PAP) (plasmid copy number protein)  32.43 
 
 
423 aa  77.8  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  24.54 
 
 
885 aa  77.8  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2544  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.52 
 
 
561 aa  77.8  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0077  poly(A) polymerase family protein  31.72 
 
 
410 aa  77  0.000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.991708  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3924  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.76 
 
 
502 aa  76.6  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  30.73 
 
 
863 aa  77  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13942  poly(A) polymerase pcnA  33.92 
 
 
480 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00346461  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3116  poly(A) polymerase I  34.29 
 
 
482 aa  75.9  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37890  tRNA adenylyltransferase  32.43 
 
 
488 aa  75.1  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2353  tRNA cytidylyltransferase  34.94 
 
 
434 aa  75.1  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.103855  normal  0.215704 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3182  Poly(A) polymerase, PcnB  50 
 
 
457 aa  75.1  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0060  tRNA adenylyltransferase  31.35 
 
 
475 aa  74.7  0.000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.451798 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6436  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.68 
 
 
473 aa  74.3  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  31.01 
 
 
877 aa  74.3  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  32.87 
 
 
888 aa  74.3  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.24 
 
 
462 aa  74.3  0.000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3362  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.07 
 
 
500 aa  74.3  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2312  polyA polymerase  29.8 
 
 
438 aa  73.9  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.049056  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0290  poly(A) polymerase  51.35 
 
 
556 aa  73.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0151  poly(A) polymerase  41.67 
 
 
481 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000345097  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0135  poly(A) polymerase  41.67 
 
 
482 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1618  poly(A) polymerase  41.67 
 
 
455 aa  73.9  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000408315  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0301  poly(A) polymerase  51.35 
 
 
556 aa  73.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2542  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.35 
 
 
492 aa  73.2  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.277933 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0303  poly(A) polymerase  51.35 
 
 
548 aa  72.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.203958  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0279  hypothetical protein  51.35 
 
 
549 aa  73.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4494  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.97 
 
 
508 aa  73.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0150465  normal  0.139356 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03448  nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  29.12 
 
 
462 aa  72.8  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  29.05 
 
 
883 aa  73.2  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0125  polyA polymerase  32.67 
 
 
457 aa  72.4  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000172768  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6049  poly(A) polymerase  41.32 
 
 
495 aa  72  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.694866  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0292  poly(A) polymerase  48 
 
 
454 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000565888  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1162  poly(A) polymerase I  34.09 
 
 
482 aa  72  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000172758  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4840  tRNA adenylyltransferase  28.77 
 
 
489 aa  72  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.305864  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3120  polynucleotide adenylyltransferase region  36.36 
 
 
450 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  31.41 
 
 
880 aa  72  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  30.82 
 
 
907 aa  71.6  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1528  poly(A) polymerase  32.59 
 
 
484 aa  71.6  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000410456  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2803  polynucleotide adenylyltransferase region  31.95 
 
 
510 aa  71.6  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0677  poly(A) polymerase  35.11 
 
 
411 aa  71.6  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.34665  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2139  metal dependent phosphohydrolase  33.13 
 
 
525 aa  71.6  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7079  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 
502 aa  71.2  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0691  poly(A) polymerase family protein  35.38 
 
 
425 aa  70.9  0.00000000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1710  tRNA adenylyltransferase  32.5 
 
 
394 aa  70.9  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.141453  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2607  poly(A) polymerase (plasmid copy number protein)  32.08 
 
 
441 aa  70.9  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000156252  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89537  predicted protein  31.98 
 
 
613 aa  70.5  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22909  normal  0.708818 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0883  Poly(A) polymerase, PcnB  36.84 
 
 
401 aa  70.5  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0632296  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2821  poly(A) polymerase I  27.75 
 
 
449 aa  70.1  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00527466  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2295  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.88 
 
 
448 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.730804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>