More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_89537 on replicon NC_009371
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009371  OSTLU_89537  predicted protein  100 
 
 		 613 aa  1219    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22909  normal  0.708818 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1528  poly(A) polymerase  31.68 
 
 		 484 aa  145  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000410456  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3590  poly(A) polymerase  33.44 
 
 		 463 aa  140  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.787264 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2821  poly(A) polymerase I  27.17 
 
 		 449 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00527466  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2914  poly(A) polymerase  32.45 
 
 		 529 aa  134  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3376  poly(A) polymerase  31.39 
 
 		 443 aa  134  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000590256  normal  0.326432 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3116  poly(A) polymerase I  29.34 
 
 		 482 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0683  poly(A) polymerase I  31.23 
 
 		 437 aa  132  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000190798  normal  0.448758 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3020  putative polynucleotide adenylyltransferase protein  33.94 
 
 		 535 aa  131  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.03108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1024  poly(A) polymerase  30.49 
 
 		 457 aa  131  4.0000000000000003e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0675  poly(A) polymerase  33.57 
 
 		 498 aa  130  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2627  polynucleotide adenylyltransferase protein  33.33 
 
 		 514 aa  131  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0857566  normal  0.147493 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2777  Poly(A) polymerase, PcnB  31.25 
 
 		 509 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0701742  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3340  poly(A) polymerase I  26.51 
 
 		 491 aa  130  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.71757e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3470  poly(A) polymerase I  26.51 
 
 		 491 aa  130  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268944  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2862  poly(A) polymerase  32.48 
 
 		 521 aa  130  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.658276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0882  Polynucleotide adenylyltransferase  33.02 
 
 		 465 aa  130  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0963  poly(A) polymerase  32.39 
 
 		 467 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1008  poly(A) polymerase I  26.64 
 
 		 440 aa  129  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000170509  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4697  poly(A) polymerase  32.9 
 
 		 460 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  hitchhiker  0.0000455164 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4562  poly(A) polymerase  32.9 
 
 		 460 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263697 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3459  poly(A) polymerase  30.31 
 
 		 454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000537308  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0152  poly(A) polymerase I  30.31 
 
 		 454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000005693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0135  poly(A) polymerase  32.37 
 
 		 482 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2456  poly(A) polymerase  32.17 
 
 		 520 aa  128  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0134  poly(A) polymerase I  30.31 
 
 		 454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000109672  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0154  poly(A) polymerase I  30.31 
 
 		 454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000110744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0292  poly(A) polymerase  35.64 
 
 		 454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000565888  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00142  poly(A) polymerase I  30.31 
 
 		 454 aa  127  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00002208  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00141  hypothetical protein  30.31 
 
 		 465 aa  127  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000170376  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0146  poly(A) polymerase I  30.31 
 
 		 454 aa  127  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.2681200000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0147  poly(A) polymerase I  30.31 
 
 		 454 aa  127  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000759631  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4696  poly(A) polymerase  32.9 
 
 		 462 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724393 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3516  poly(A) polymerase I  30.31 
 
 		 465 aa  127  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000476175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1162  poly(A) polymerase I  25.63 
 
 		 482 aa  127  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000172758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3561  poly(A) polymerase  30.89 
 
 		 550 aa  127  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.876731  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0830  Poly(A) polymerase  32.04 
 
 		 491 aa  127  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.715876  hitchhiker  0.000411869 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5444  poly(A) polymerase  31.8 
 
 		 467 aa  126  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0600  poly(A) polymerase  33.09 
 
 		 452 aa  126  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1795  poly(A) polymerase  29.81 
 
 		 439 aa  125  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.649421  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2050  poly(A) polymerase, PcnB  34.96 
 
 		 462 aa  125  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.187335 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62560  poly(A) polymerase  31.5 
 
 		 467 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.804873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0151  poly(A) polymerase  32.27 
 
 		 481 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000345097  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4809  Poly(A) polymerase, PcnB  32.87 
 
 		 466 aa  125  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0814505  normal  0.0275687 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2627  poly(A) polymerase  32.58 
 
 		 512 aa  125  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1769  poly(A) polymerase  32.18 
 
 		 535 aa  125  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1973  poly(A) polymerase  33 
 
 		 531 aa  125  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0262405 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4014  poly(A) polymerase  30.65 
 
 		 484 aa  124  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0546071  normal  0.868909 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3271  poly(A) polymerase  32.21 
 
 		 515 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.264957  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2320  polyA polymerase  32.21 
 
 		 515 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0114  hypothetical protein  32.04 
 
 		 745 aa  124  5e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00228861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3314  polyA polymerase  32.21 
 
 		 515 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2199  poly(A) polymerase  32.21 
 
 		 515 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.968524  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3304  poly(A) polymerase  32.21 
 
 		 515 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1092  polyA polymerase  32.21 
 
 		 515 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2991  poly(A) polymerase  31.93 
 
 		 540 aa  124  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.406392  normal  0.256154 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0507  polyA polymerase  32.21 
 
 		 515 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3800  poly(A) polymerase  33.68 
 
 		 421 aa  124  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000630801  hitchhiker  0.000152208 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0728  poly(A) polymerase  33.33 
 
 		 435 aa  124  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000577304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1618  poly(A) polymerase  31.73 
 
 		 455 aa  124  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000408315  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0736  poly(A) polymerase  31.29 
 
 		 462 aa  124  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305046 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0847  poly(A) polymerase  33.68 
 
 		 513 aa  124  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000196187  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1314  polyA polymerase  32.21 
 
 		 514 aa  124  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283102  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0870  poly(A) polymerase  33.68 
 
 		 513 aa  124  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000796933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0882  poly(A) polymerase  34.03 
 
 		 513 aa  123  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000307041  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0872  polyA polymerase  33.68 
 
 		 438 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3492  poly(A) polymerase  33.68 
 
 		 450 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000092007  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3250  polyA polymerase  34.6 
 
 		 455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0390  poly(A) polymerase  29.49 
 
 		 439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0179793  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4310  polyA polymerase  31.82 
 
 		 474 aa  122  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1488  Poly(A) polymerase (PAP) (plasmid copy number protein)  28.4 
 
 		 423 aa  122  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2607  poly(A) polymerase (plasmid copy number protein)  29.36 
 
 		 441 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000156252  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1467  poly(A) polymerase  33.45 
 
 		 546 aa  122  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0303  poly(A) polymerase  32.72 
 
 		 548 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.203958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3130  poly(A) polymerase  30.77 
 
 		 494 aa  121  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000172182  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3987  poly(A) polymerase I  25.86 
 
 		 505 aa  121  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000599452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3294  poly(A) polymerase  32.99 
 
 		 435 aa  122  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000608896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0727  poly(A) polymerase  32.58 
 
 		 518 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.476146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3182  Poly(A) polymerase, PcnB  33.8 
 
 		 457 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0123  poly(A) polymerase  31.69 
 
 		 753 aa  121  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00291654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0758  poly(A) polymerase  32.58 
 
 		 518 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1765  poly(A) polymerase  33.33 
 
 		 467 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3955  Poly(A) polymerase  31.51 
 
 		 529 aa  120  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0305826 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2312  polyA polymerase  33.22 
 
 		 438 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.049056  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0274  poly(A) polymerase  32.58 
 
 		 518 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0744  poly(A) polymerase  31.51 
 
 		 529 aa  120  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0495763  normal  0.506624 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1480  poly(A) polymerase  33.84 
 
 		 466 aa  120  9e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.976033  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1495  Poly(A) polymerase (PAP) (plasmid copy number protein)  28.1 
 
 		 423 aa  120  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2509  poly(A) polymerase  30.82 
 
 		 535 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.101717  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0216  poly(A) polymerase I  29.52 
 
 		 437 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000405641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1515  poly(A) polymerase  31.39 
 
 		 461 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0267914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0218  poly(A) polymerase I  29.52 
 
 		 454 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474344  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0201  poly(A) polymerase I  29.52 
 
 		 437 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000171206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0212  poly(A) polymerase I  29.52 
 
 		 437 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00291988  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0562  poly(A) polymerase  31.21 
 
 		 479 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.057959  hitchhiker  0.000000459725 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42690  polynucleotide adenylyltransferase; PcnB  32.9 
 
 		 463 aa  119  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.881175  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3406  poly(A) polymerase  32.64 
 
 		 435 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000031653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0200  poly(A) polymerase I  29.52 
 
 		 437 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000820079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03448  nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  29.19 
 
 		 462 aa  118  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2991  poly(A) polymerase  32.76 
 
 		 531 aa  118  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.444638  normal  0.509623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>