More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48911 on replicon NC_011687
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_48911  predicted protein  100 
 
 
631 aa  1303    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34467  predicted protein  31.91 
 
 
525 aa  267  4e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.250133  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31221  predicted protein  31.45 
 
 
559 aa  238  3e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.443393 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10924  tRNA nucleotidyltransferase (AFU_orthologue; AFUA_2G16660)  31.59 
 
 
605 aa  221  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02860  tRNA adenylyltransferase, putative  31.49 
 
 
504 aa  205  2e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33610  predicted protein  30.15 
 
 
729 aa  184  6e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0854  Polynucleotide adenylyltransferase region  36.32 
 
 
468 aa  110  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00520307 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2415  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.05 
 
 
471 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1525  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.02 
 
 
475 aa  102  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5957  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.4 
 
 
483 aa  101  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0722  HDIG  38.16 
 
 
476 aa  100  5e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314731  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1109  metal dependent phosphohydrolase  35.92 
 
 
470 aa  99  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.875974  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4574  HDIG domain-containing protein  34.16 
 
 
485 aa  97.8  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1564  polynucleotide adenylyltransferase region  33.33 
 
 
388 aa  97.1  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0992  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.51 
 
 
471 aa  96.7  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5092  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
485 aa  95.5  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588683 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2058  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.95 
 
 
469 aa  94.4  7e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3102  metal-dependent phosphohydrolase  31.5 
 
 
552 aa  93.2  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0665  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.43 
 
 
484 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0990908 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1213  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.11 
 
 
479 aa  92  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0872  hypothetical protein  32.13 
 
 
474 aa  92  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4906  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.59 
 
 
495 aa  91.3  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0801  polyA polymerase family protein  36.02 
 
 
483 aa  91.7  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1864  tRNA adenylyltransferase  35.29 
 
 
420 aa  91.7  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.124392  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1306  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.13 
 
 
489 aa  91.7  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2535  tRNA adenylyltransferase (tRNA nucleotidyl transferase)  30.84 
 
 
479 aa  90.9  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2857  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.75 
 
 
484 aa  90.5  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.858546  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2030  Polynucleotide adenylyltransferase region  34.16 
 
 
854 aa  90.5  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.609547  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06110  tRNA nucleotidyltransferase  35.75 
 
 
477 aa  90.1  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4968  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.62 
 
 
490 aa  89.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2139  metal dependent phosphohydrolase  37.64 
 
 
525 aa  89  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6436  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.56 
 
 
473 aa  86.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13942  poly(A) polymerase pcnA  25.3 
 
 
480 aa  85.1  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00346461  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.89 
 
 
462 aa  85.1  0.000000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2544  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.91 
 
 
561 aa  84.7  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23340  tRNA adenylyltransferase  33.05 
 
 
483 aa  84.7  0.000000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4157  metal dependent phosphohydrolase  32.77 
 
 
496 aa  84.3  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1390  poly(A) polymerase  33.98 
 
 
424 aa  84  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2110  polynucleotide adenylyltransferase region  33.65 
 
 
398 aa  84  0.000000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.402198  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39600  tRNA adenylyltransferase  32.17 
 
 
523 aa  84  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3924  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.19 
 
 
502 aa  83.6  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5773  metal dependent phosphohydrolase  30.59 
 
 
489 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.626419 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2542  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.19 
 
 
492 aa  83.6  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.277933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9036  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.31 
 
 
491 aa  83.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2407  tRNA adenylyltransferase  35.55 
 
 
471 aa  82.8  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  25.15 
 
 
883 aa  82.4  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5397  metal dependent phosphohydrolase  30.59 
 
 
455 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517114  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5486  metal dependent phosphohydrolase  30.59 
 
 
489 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.527547  normal  0.550288 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5397  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.14 
 
 
464 aa  82  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4840  tRNA adenylyltransferase  25.79 
 
 
489 aa  82  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.305864  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4849  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.47 
 
 
499 aa  82  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  26.81 
 
 
863 aa  82  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4681  HDIG domain-containing protein  33.51 
 
 
483 aa  81.6  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  29.2 
 
 
877 aa  81.3  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9369  hypothetical protein  32 
 
 
479 aa  81.3  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37890  tRNA adenylyltransferase  32.57 
 
 
488 aa  80.9  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1653  tRNA CCA-pyrophosphorylase  33.18 
 
 
402 aa  80.9  0.00000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  28.21 
 
 
859 aa  80.5  0.00000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  27.23 
 
 
863 aa  80.5  0.00000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3101  poly(A) polymerase  30.4 
 
 
442 aa  80.5  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.87683e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0882  poly(A) polymerase  32.99 
 
 
471 aa  80.5  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0497  metal dependent phosphohydrolase  31.82 
 
 
454 aa  80.1  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3020  putative polynucleotide adenylyltransferase protein  29.07 
 
 
535 aa  80.1  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.03108  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3362  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.95 
 
 
500 aa  80.1  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0845  metal dependent phosphohydrolase  28.78 
 
 
497 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0325439  normal  0.188962 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  27.8 
 
 
885 aa  79.3  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0077  poly(A) polymerase family protein  30.74 
 
 
410 aa  78.6  0.0000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.991708  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1151  polyA polymerase family protein  33.66 
 
 
475 aa  78.6  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.71029 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4223  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.46 
 
 
486 aa  78.6  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31840  tRNA adenylyltransferase  29.96 
 
 
471 aa  77.8  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2952  polynucleotide adenylyltransferase region  31.96 
 
 
406 aa  77.8  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.392505  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1021  polynucleotide adenylyltransferase region  29.32 
 
 
400 aa  77.8  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1449  tRNA nucleotidyltransferase  30.21 
 
 
471 aa  77.8  0.0000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1451  poly(A) polymerase  32.97 
 
 
497 aa  77.8  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.584195  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1775  polyA polymerase  32.97 
 
 
477 aa  77.4  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5079  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.71 
 
 
487 aa  77  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1795  poly(A) polymerase  29.71 
 
 
439 aa  77  0.0000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.649421  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3935  poly(A) polymerase  31.6 
 
 
415 aa  76.6  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000967164  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6061  metal dependent phosphohydrolase  28.83 
 
 
483 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.182815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7079  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.48 
 
 
502 aa  75.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3571  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.33 
 
 
483 aa  75.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.564653 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0279  hypothetical protein  33.71 
 
 
549 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0301  poly(A) polymerase  33.71 
 
 
556 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3712  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.34 
 
 
507 aa  75.5  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353872  normal  0.0967324 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0497  metal dependent phosphohydrolase  30.19 
 
 
492 aa  75.5  0.000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1618  poly(A) polymerase  31.38 
 
 
455 aa  75.5  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000408315  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0390  poly(A) polymerase  29.71 
 
 
439 aa  75.5  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0179793  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6049  poly(A) polymerase  32.57 
 
 
495 aa  75.5  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.694866  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0290  poly(A) polymerase  33.71 
 
 
556 aa  75.5  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0303  poly(A) polymerase  33.71 
 
 
548 aa  74.3  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.203958  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1710  tRNA adenylyltransferase  28.64 
 
 
394 aa  74.3  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.141453  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0883  Poly(A) polymerase, PcnB  28.4 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0632296  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1765  poly(A) polymerase  30.29 
 
 
467 aa  73.6  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4207  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.91 
 
 
483 aa  73.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4475  polynucleotide adenylyltransferase region  32.27 
 
 
418 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239628  hitchhiker  0.001883 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1756  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.21 
 
 
473 aa  73.2  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1972  CBS  30.35 
 
 
898 aa  73.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03578  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2120  tRNA CCA-pyrophosphorylase  29.22 
 
 
404 aa  73.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2866  polynucleotide adenylyltransferase region  31.88 
 
 
380 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62560  poly(A) polymerase  30.05 
 
 
467 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.804873  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>