More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_34467 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009357  OSTLU_34467  predicted protein  100 
 
 
525 aa  1070    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.250133  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48911  predicted protein  31.91 
 
 
631 aa  267  2.9999999999999995e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31221  predicted protein  32.61 
 
 
559 aa  264  3e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.443393 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02860  tRNA adenylyltransferase, putative  33.87 
 
 
504 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10924  tRNA nucleotidyltransferase (AFU_orthologue; AFUA_2G16660)  30.61 
 
 
605 aa  243  6e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33610  predicted protein  39.77 
 
 
729 aa  240  4e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0854  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.03 
 
 
468 aa  130  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00520307 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5957  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  26.51 
 
 
483 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1109  metal dependent phosphohydrolase  27.47 
 
 
470 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.875974  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06110  tRNA nucleotidyltransferase  26.67 
 
 
477 aa  120  3.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1525  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  26.42 
 
 
475 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0992  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  26.68 
 
 
471 aa  120  7e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2415  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  26.39 
 
 
471 aa  115  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4906  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  25.6 
 
 
495 aa  114  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1306  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  27.44 
 
 
489 aa  113  8.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0872  hypothetical protein  33.19 
 
 
474 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0722  HDIG  25.58 
 
 
476 aa  110  9.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314731  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4849  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.06 
 
 
499 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2535  tRNA adenylyltransferase (tRNA nucleotidyl transferase)  26.08 
 
 
479 aa  106  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1213  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  26.7 
 
 
479 aa  105  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1564  polynucleotide adenylyltransferase region  30.49 
 
 
388 aa  104  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9036  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.9 
 
 
491 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4223  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.82 
 
 
486 aa  102  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0077  poly(A) polymerase family protein  33.63 
 
 
410 aa  102  2e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.991708  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3102  metal-dependent phosphohydrolase  31.85 
 
 
552 aa  102  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1151  polyA polymerase family protein  34.86 
 
 
475 aa  101  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.71029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0665  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  25.46 
 
 
484 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0990908 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4574  HDIG domain-containing protein  33.93 
 
 
485 aa  99  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5092  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.18 
 
 
485 aa  99  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588683 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2058  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.11 
 
 
469 aa  99.4  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0801  polyA polymerase family protein  33.04 
 
 
483 aa  95.1  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  26.91 
 
 
863 aa  95.1  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39600  tRNA adenylyltransferase  28.74 
 
 
523 aa  95.1  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  31.25 
 
 
877 aa  94.4  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4968  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.36 
 
 
490 aa  94  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0883  Poly(A) polymerase, PcnB  32.58 
 
 
401 aa  94  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0632296  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3250  polyA polymerase  37.1 
 
 
455 aa  92.8  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13942  poly(A) polymerase pcnA  31.6 
 
 
480 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00346461  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  29.39 
 
 
859 aa  93.2  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2857  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.68 
 
 
484 aa  92.4  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.858546  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23340  tRNA adenylyltransferase  29.69 
 
 
483 aa  92.4  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  25.82 
 
 
863 aa  92  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2542  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.26 
 
 
492 aa  91.7  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.277933 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4157  metal dependent phosphohydrolase  30.3 
 
 
496 aa  91.7  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  29.58 
 
 
885 aa  90.5  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0060  tRNA adenylyltransferase  33.89 
 
 
475 aa  90.5  7e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.451798 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1449  tRNA nucleotidyltransferase  30.96 
 
 
471 aa  90.1  9e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7321  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.21 
 
 
508 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5773  metal dependent phosphohydrolase  29.24 
 
 
489 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.626419 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3182  Poly(A) polymerase, PcnB  34.05 
 
 
457 aa  89.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0292  poly(A) polymerase  30.34 
 
 
454 aa  89.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000565888  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3362  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36 
 
 
500 aa  88.6  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5397  metal dependent phosphohydrolase  28.81 
 
 
455 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517114  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5486  metal dependent phosphohydrolase  28.81 
 
 
489 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.527547  normal  0.550288 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4840  tRNA adenylyltransferase  29.79 
 
 
489 aa  88.6  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.305864  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3101  poly(A) polymerase  35.67 
 
 
442 aa  87.8  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.87683e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1451  poly(A) polymerase  36.05 
 
 
497 aa  87.8  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.584195  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1775  polyA polymerase  36.05 
 
 
477 aa  87.8  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4681  HDIG domain-containing protein  35.09 
 
 
483 aa  88.2  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3924  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.07 
 
 
502 aa  87.4  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03448  nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  26.24 
 
 
462 aa  87.4  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6436  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  27.93 
 
 
473 aa  87.4  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3712  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.27 
 
 
507 aa  87  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353872  normal  0.0967324 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37890  tRNA adenylyltransferase  26.64 
 
 
488 aa  87  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1618  poly(A) polymerase  32.8 
 
 
455 aa  87  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000408315  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.65 
 
 
873 aa  86.7  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1495  Poly(A) polymerase (PAP) (plasmid copy number protein)  30.24 
 
 
423 aa  86.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0497  metal dependent phosphohydrolase  32.24 
 
 
492 aa  86.3  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31840  tRNA adenylyltransferase  28.45 
 
 
471 aa  86.3  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4207  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 
483 aa  86.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1488  Poly(A) polymerase (PAP) (plasmid copy number protein)  30.24 
 
 
423 aa  85.5  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7079  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.06 
 
 
502 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0882  Polynucleotide adenylyltransferase  37.79 
 
 
465 aa  85.9  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002563  poly(A) polymerase  25 
 
 
453 aa  85.1  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000329901  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  28.81 
 
 
883 aa  84.7  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6061  metal dependent phosphohydrolase  29.24 
 
 
483 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.182815 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0845  metal dependent phosphohydrolase  29.61 
 
 
497 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0325439  normal  0.188962 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3571  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.96 
 
 
483 aa  84.7  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.564653 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2607  poly(A) polymerase (plasmid copy number protein)  30.67 
 
 
441 aa  84.3  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000156252  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.9 
 
 
877 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5397  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.18 
 
 
464 aa  84.3  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6049  poly(A) polymerase  32 
 
 
495 aa  84.3  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.694866  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0562  poly(A) polymerase  31.44 
 
 
479 aa  84.3  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.057959  hitchhiker  0.000000459725 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2139  metal dependent phosphohydrolase  25.71 
 
 
525 aa  84.3  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42690  polynucleotide adenylyltransferase; PcnB  28.29 
 
 
463 aa  83.6  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.881175  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4531  metal dependent phosphohydrolase  32.16 
 
 
502 aa  84  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0125  polyA polymerase  28.57 
 
 
457 aa  83.6  0.000000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000172768  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0303  poly(A) polymerase  32.31 
 
 
548 aa  83.6  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.203958  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2821  poly(A) polymerase I  28.12 
 
 
449 aa  83.2  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00527466  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  31.79 
 
 
890 aa  83.2  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4494  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.91 
 
 
508 aa  82.8  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0150465  normal  0.139356 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3590  poly(A) polymerase  26.89 
 
 
463 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.787264 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2627  polynucleotide adenylyltransferase protein  29.91 
 
 
514 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0857566  normal  0.147493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9369  hypothetical protein  32.95 
 
 
479 aa  82.8  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0135  poly(A) polymerase  40.74 
 
 
482 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0677  poly(A) polymerase  31.94 
 
 
411 aa  82.4  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.34665  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0151  poly(A) polymerase  40.74 
 
 
481 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000345097  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1528  poly(A) polymerase  24.94 
 
 
484 aa  81.3  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000410456  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  29.03 
 
 
865 aa  81.3  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  27.04 
 
 
845 aa  80.9  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>