More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1162 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1162  amino acid ABC transporter, permease protein PEB1  100 
 
 
220 aa  437  9.999999999999999e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0592581  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0997  amino acid ABC transporter, permease protein PEB1  59.55 
 
 
219 aa  260  1e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.43087  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0895  amino acid ABC transporter, permease protein PEB1  59.55 
 
 
219 aa  260  1e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.121462  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0926  amino acid ABC transporter, permease protein PEB1  59.55 
 
 
219 aa  260  1e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0138002  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1136  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.74 
 
 
220 aa  174  8e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.438499  normal  0.203188 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1120  ABC-type amino acid transport system, permease component  44.86 
 
 
216 aa  151  7e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.282302  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1045  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.89 
 
 
215 aa  138  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0715  amino acid ABC transporter, permease protein  36.7 
 
 
216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.303684  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2808  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.28 
 
 
216 aa  125  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0553  glutamine ABC transporter permease  36.59 
 
 
214 aa  122  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0609  amino acid ABC transporter permease  36.1 
 
 
214 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00355475  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0554  glutamine ABC transporter permease  36.1 
 
 
214 aa  122  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282364  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0642  amino acid ABC transporter permease  36.1 
 
 
214 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00728334  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0555  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.61 
 
 
214 aa  122  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0699  amino acid ABC transporter, permease protein  36.14 
 
 
214 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0771  amino acid ABC transporter, permease protein  36.59 
 
 
214 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0678  amino acid ABC transporter, permease protein  36.1 
 
 
214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4660  amino acid ABC transporter, permease protein  35.27 
 
 
214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  hitchhiker  1.97521e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0710  amino acid ABC transporter, permease protein  35.64 
 
 
214 aa  118  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.15 
 
 
492 aa  116  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.24 
 
 
598 aa  115  6e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0310843  hitchhiker  0.00101821 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1474  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.05 
 
 
216 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.44 
 
 
493 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3108  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.11 
 
 
214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2219  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38 
 
 
596 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.118848  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0531  ABC-type amino acid transport system, permease component  30.66 
 
 
216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0001634 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6679  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.88 
 
 
215 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4661  amino acid ABC transporter, permease protein  35.89 
 
 
218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.128052  hitchhiker  2.19299e-21 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3618  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.8 
 
 
401 aa  111  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000215  amino acid ABC transporter permease protein  35.18 
 
 
265 aa  111  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0975  amino acid ABC transporter permease  33.33 
 
 
365 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2496  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.8 
 
 
401 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0938494  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1933  ABC-type amino acid transport system, permease component  33.49 
 
 
219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1514  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.96 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0709  amino acid ABC transporter, permease protein  35.89 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0554  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.45 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0608  amino acid ABC transporter permease  34.45 
 
 
218 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0191188  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0552  glutamine ABC transporter permease  34.45 
 
 
218 aa  109  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0641  amino acid ABC transporter permease  34.45 
 
 
218 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00751047  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2326  amino acid ABC transporter permease  35.53 
 
 
367 aa  109  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1758  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
384 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.115192  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0770  amino acid ABC transporter, permease protein  35.89 
 
 
218 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0698  amino acid ABC transporter, permease protein  34.45 
 
 
218 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36860  amino acid ABC transporter membrane protein  38.2 
 
 
216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.989507 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0123  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.16 
 
 
321 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2004  amino acid ABC transporter, permease protein  35.48 
 
 
239 aa  108  5e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1631  ABC-type amino acid transport system, permease component  37.32 
 
 
222 aa  108  6e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0542  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.41 
 
 
233 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0906  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.31 
 
 
365 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0677  amino acid ABC transporter, permease protein  35.41 
 
 
218 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1870  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.02 
 
 
239 aa  108  8.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000483055  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0553  glutamine ABC transporter permease  34.45 
 
 
218 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.421713  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2430  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  30.99 
 
 
216 aa  108  9.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.891065  normal  0.0353371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1299  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  32.31 
 
 
365 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.504897  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1257  amino acid ABC transporter, permease protein  31.79 
 
 
365 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.154586  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4426  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.31 
 
 
365 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1074  amino acid ABC transporter permease  31.79 
 
 
365 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0912852  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3558  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32 
 
 
365 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.650064 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2553  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  33.85 
 
 
395 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186607  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1561  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.82 
 
 
384 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.670709 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4550  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.79 
 
 
365 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1163  amino acid ABC transporter, permease protein PEB1  33.17 
 
 
229 aa  107  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0440986  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0469  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, permease protein EhuC  34.25 
 
 
216 aa  106  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0543  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.5 
 
 
214 aa  106  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1098  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.73 
 
 
223 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2491  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.6 
 
 
335 aa  105  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2054  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.46 
 
 
233 aa  105  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13320  amino acid ABC transporter membrane protein  33.5 
 
 
212 aa  105  5e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2765  amino acid ABC transporter permease  34.85 
 
 
596 aa  105  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0893  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.85 
 
 
236 aa  105  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.879249  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1222  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.11 
 
 
290 aa  105  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312704  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2021  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.66 
 
 
337 aa  105  7e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.871277  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0151  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.79 
 
 
452 aa  104  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0196891  hitchhiker  0.00000113138 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0122  amino acid ABC transporter permease  31.71 
 
 
369 aa  104  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0436  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.19 
 
 
367 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0927  amino acid ABC transporter, permease protein PEB1  31.28 
 
 
250 aa  104  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0060542  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0998  amino acid ABC transporter, permease protein PEB1  31.28 
 
 
250 aa  104  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0474623  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1513  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.06 
 
 
212 aa  104  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1688  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.65 
 
 
218 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022194  normal  0.493441 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0727  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.17 
 
 
503 aa  104  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000479447  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0530  ABC-type amino acid transport system, permease component  33.01 
 
 
212 aa  104  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.928657  hitchhiker  0.000342419 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0720  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.21 
 
 
402 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.617792 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0894  amino acid ABC transporter, permease protein PEB1  30.95 
 
 
250 aa  103  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.305674  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2820  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  30.1 
 
 
359 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.7628  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4045  ABC transporter permease  31.34 
 
 
222 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2786  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.82 
 
 
596 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4537  amino acid ABC transporter permease  31.63 
 
 
223 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194331  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2944  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.16 
 
 
352 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1946  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.01 
 
 
485 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000538211  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2824  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  30.1 
 
 
359 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.19415  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0684  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.73 
 
 
221 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0799785  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0582  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  34.43 
 
 
223 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46930  putative permease of ABC transporter  31.34 
 
 
222 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055345 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2055  general L-amino acid ABC transporter permease protein  31.47 
 
 
365 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169768  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1912  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.01 
 
 
485 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000291813  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03128  predicted amino-acid transporter subunit  28.71 
 
 
367 aa  102  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4173  amino acid ABC transporter, permease protein  30.23 
 
 
221 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315743  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0436  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.71 
 
 
367 aa  102  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.497316 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03079  hypothetical protein  28.71 
 
 
367 aa  102  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3958  amino acid ABC transporter permease  32.43 
 
 
293 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.411304 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>