More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1115 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1115  putative dehydrogenase/oxidoreductase protein  100 
 
 
300 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2161  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  29.97 
 
 
299 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387864 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1979  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.17 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4460  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  29.37 
 
 
294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1097  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  28.12 
 
 
295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_45774  predicted protein  29.68 
 
 
283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02990  tartronate semialdehyde reductase  29.18 
 
 
296 aa  112  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0580  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  29.18 
 
 
296 aa  112  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0575  tartronate semialdehyde reductase  29.18 
 
 
296 aa  112  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3233  tartronate semialdehyde reductase  29.18 
 
 
294 aa  113  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3314  tartronate semialdehyde reductase  29.18 
 
 
294 aa  113  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02941  hypothetical protein  29.18 
 
 
296 aa  112  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3420  tartronate semialdehyde reductase  29.18 
 
 
294 aa  113  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3603  tartronate semialdehyde reductase  29.18 
 
 
294 aa  113  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4437  tartronate semialdehyde reductase  29.18 
 
 
294 aa  113  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.211957 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2197  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  27.72 
 
 
290 aa  112  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206144  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3441  tartronate semialdehyde reductase  28.83 
 
 
296 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3438  tartronate semialdehyde reductase  28.83 
 
 
296 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3546  tartronate semialdehyde reductase  28.83 
 
 
296 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.370176  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1251  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  28.18 
 
 
298 aa  112  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3607  tartronate semialdehyde reductase  28.83 
 
 
296 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  0.959534 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2172  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.17 
 
 
302 aa  112  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496514  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3510  tartronate semialdehyde reductase  28.83 
 
 
296 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5931  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  30.99 
 
 
296 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3102  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  30.53 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2700  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.01 
 
 
302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1173  tartronate semialdehyde reductase  26.67 
 
 
296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1917  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  30.88 
 
 
298 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.036098  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3216  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  27.11 
 
 
309 aa  109  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.969854  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3379  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  29.47 
 
 
291 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0410434 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4859  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  28.87 
 
 
297 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.748222  normal  0.158599 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0338  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  30.07 
 
 
298 aa  108  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2760  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  29.45 
 
 
298 aa  108  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0685188  normal  0.814405 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1335  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  27.72 
 
 
283 aa  108  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0468216  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0583  NAD-binding 6-phosphogluconate dehydrogenase  30.04 
 
 
293 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2565  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  28.91 
 
 
295 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0395853  normal  0.0235882 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1133  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.01 
 
 
301 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1177  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  28.27 
 
 
295 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.383553  normal  0.478459 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4310  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  29.27 
 
 
294 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0860064 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2852  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  28.03 
 
 
297 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0958  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  30.66 
 
 
299 aa  106  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2366  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  31.93 
 
 
301 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3196  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  27.56 
 
 
296 aa  106  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00788547 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4274  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  27.92 
 
 
295 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.347219  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43420  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  29.82 
 
 
296 aa  105  8e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.164862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1087  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  25.91 
 
 
292 aa  105  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1143  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  27.92 
 
 
295 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.200546 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1923  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  26.57 
 
 
296 aa  105  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238794  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0845  tartronate semialdehyde reductase  28.32 
 
 
294 aa  104  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2119  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  30.03 
 
 
304 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0276919 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3011  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  27.92 
 
 
287 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000101253  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1570  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  29.47 
 
 
297 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101448  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1903  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  25.35 
 
 
282 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.25845  hitchhiker  0.00938968 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2413  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  29.17 
 
 
289 aa  104  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3551  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  27.82 
 
 
292 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000115044  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4299  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  29.47 
 
 
297 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1759  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  28.22 
 
 
289 aa  103  4e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.271447 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0628  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  28.52 
 
 
293 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2547  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  26.32 
 
 
286 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0364167 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0297  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  25.42 
 
 
309 aa  103  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3624  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  28.42 
 
 
297 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1600  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  29.02 
 
 
293 aa  102  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.36162  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5060  oxidoreductase, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor  29.86 
 
 
301 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3089  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  29.47 
 
 
297 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4151  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  25.55 
 
 
292 aa  102  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2221  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  28.52 
 
 
297 aa  102  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3784  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  25.55 
 
 
293 aa  102  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.874704  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3799  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase; 6-phosphogluconate dehydrogenase  25.55 
 
 
293 aa  102  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3864  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  29.05 
 
 
297 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0721878  normal  0.335239 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4063  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  25.55 
 
 
293 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1632  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  30.17 
 
 
303 aa  102  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1372  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase family protein  28.57 
 
 
286 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.90333  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0209  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  25.61 
 
 
294 aa  101  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1214  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  26.35 
 
 
303 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.765092  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0635  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  24.14 
 
 
292 aa  102  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3500  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  31.56 
 
 
296 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.216794 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1968  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  26.74 
 
 
298 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3356  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  25.35 
 
 
286 aa  102  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0320622 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4423  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  30.99 
 
 
296 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1265  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  25.45 
 
 
284 aa  100  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.92382  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2369  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  29.12 
 
 
292 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0210  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  24.73 
 
 
284 aa  101  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.866351  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5900  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent:6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding:3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.08 
 
 
294 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0331  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  28.17 
 
 
287 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-16 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7141  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  28.04 
 
 
303 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0594  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  29.12 
 
 
299 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.84188  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0588  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  28.77 
 
 
287 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0957  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  29.49 
 
 
305 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0699  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  25.27 
 
 
286 aa  101  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000621245 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3153  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  28.52 
 
 
304 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0236  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  26.52 
 
 
284 aa  100  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355607  normal  0.156106 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0466  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  30.56 
 
 
301 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3831  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  29.82 
 
 
296 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0245  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  27.55 
 
 
298 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1714  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  27.87 
 
 
309 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.280932  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45020  putative oxidoreductase  29.82 
 
 
296 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.820061  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4109  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  25.54 
 
 
292 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5958  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  25.86 
 
 
293 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.564119  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1159  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  28.42 
 
 
292 aa  100  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.997729  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4931  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  26.46 
 
 
293 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>