More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0244 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0244  Mg2+ transporter protein, CorA-like  100 
 
 
371 aa  767    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0191  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  82.7 
 
 
371 aa  640    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.503449  normal  0.774114 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3806  Mg2+ transporter protein, CorA-like  68.14 
 
 
412 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000191662  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0326  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  63.03 
 
 
409 aa  501  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.199885 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0379  Mg2 transporter protein CorA family protein  63.45 
 
 
397 aa  493  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0260  Mg2 transporter protein CorA family protein  60.9 
 
 
401 aa  474  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.206311  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0265  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  60.9 
 
 
401 aa  471  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4927  Mg2 transporter protein CorA family protein  60.52 
 
 
386 aa  469  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0109111  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0389  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  64.19 
 
 
375 aa  461  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0305  transport protein  59.62 
 
 
366 aa  454  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0423959 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0373  Mg2 transporter protein CorA family protein  61.11 
 
 
360 aa  446  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000133876 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3150  Mg2+ transporter protein, CorA-like  40.32 
 
 
396 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3287  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  41.3 
 
 
393 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4989  magnesium and cobalt transport protein CorA  32 
 
 
376 aa  80.1  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0789  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  36.36 
 
 
322 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.957399  normal  0.0628578 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2665  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.28 
 
 
390 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111176 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2417  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.48 
 
 
315 aa  77  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2371  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  24.48 
 
 
315 aa  77  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.563119  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0150  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  39.36 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.74 
 
 
351 aa  76.6  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4191  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.53 
 
 
382 aa  76.3  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.259759  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.74 
 
 
351 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0668  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.12 
 
 
385 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0284032  normal  0.71068 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3530  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
357 aa  75.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.203134  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2768  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.29 
 
 
354 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0648  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.12 
 
 
385 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2267  magnesium and cobalt transport protein CorA  32 
 
 
360 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.52 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2170  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.26 
 
 
372 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.574954 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0433  magnesium and cobalt transport protein CorA  25 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0204  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.36 
 
 
391 aa  74.3  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174805  hitchhiker  0.00515093 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1912  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.77 
 
 
374 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107117  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  32 
 
 
358 aa  73.6  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1587  magnesium and cobalt transport protein CorA  26 
 
 
353 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.188358  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0173  magnesium and cobalt transport protein CorA  20.47 
 
 
352 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2182  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.22 
 
 
327 aa  72.4  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709225  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1735  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.66 
 
 
298 aa  72.4  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942891  hitchhiker  0.00692573 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2085  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.27 
 
 
353 aa  72.4  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4037  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.81 
 
 
327 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.28 
 
 
353 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0176371  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0865  magnesium and cobalt transport protein CorA  19.29 
 
 
352 aa  72  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.916446  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0582  magnesium and cobalt transport protein CorA  26 
 
 
354 aa  71.2  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000747796  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.5 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0556  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.22 
 
 
354 aa  71.2  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1738  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.29 
 
 
352 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.277865 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2244  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.16 
 
 
357 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000192841  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0252  magnesium and cobalt transport protein CorA  19.92 
 
 
353 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3786  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  32 
 
 
300 aa  70.5  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3419  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.61 
 
 
355 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222754  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2333  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.76 
 
 
387 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1006  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.57 
 
 
547 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1189  magnesium/cobalt transporter CorA  26.19 
 
 
365 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10618  Magnesium and cobalt transport protein  29 
 
 
363 aa  68.9  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2983  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.25 
 
 
354 aa  67.8  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.23033  normal  0.025318 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3204  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.67 
 
 
379 aa  67.8  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648086  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2107  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.49 
 
 
381 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.61648 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1617  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.77 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1997  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.17 
 
 
395 aa  67.4  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.223184  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2937  putative cobalt/magnesium uptake transporter  21.98 
 
 
354 aa  67  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0933  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.41 
 
 
325 aa  67  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0969  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.31 
 
 
356 aa  66.6  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231272  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2224  magnesium and cobalt transport protein CorA  35 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000656607  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28210  Mg2+/Co2+ transporter  24.88 
 
 
371 aa  66.2  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0607  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.33 
 
 
248 aa  65.9  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1811  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.48 
 
 
333 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2520  magnesium and cobalt transport protein CorA  28 
 
 
357 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107852  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2074  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.25 
 
 
357 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.77 
 
 
354 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2791  putative cobalt/magnesium uptake transporter  28.57 
 
 
354 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.94 
 
 
339 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0795  magnesium/cobalt transporter CorA  22.5 
 
 
380 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  28 
 
 
367 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0739  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.97 
 
 
374 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000829129 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1996  magnesium/cobalt transporter CorA  23.33 
 
 
325 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215662  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1643  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.67 
 
 
325 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222374  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4178  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.21 
 
 
322 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2783  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.72 
 
 
316 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000249719  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3012  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.7 
 
 
354 aa  64.7  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.815439  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1870  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.53 
 
 
363 aa  65.1  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1642  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
325 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1539  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
325 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.555793 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1913  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.32 
 
 
375 aa  65.5  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1262  putative cation transporter  20.76 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0115831  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1102  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.76 
 
 
351 aa  64.7  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.528236  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0943  Mg2 transporter protein, CorA family protein  35.9 
 
 
322 aa  65.1  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0341  hypothetical protein  26.67 
 
 
330 aa  64.7  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1416  magnesium/cobalt transporter CorA  24.3 
 
 
354 aa  64.3  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06540  Mg2+/Co2+ transporter  23.76 
 
 
363 aa  64.3  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.62 
 
 
322 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  20.92 
 
 
339 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0816  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.26 
 
 
367 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0003  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.51 
 
 
317 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00000548112  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_521  magnesium and cobalt transport protein  25.84 
 
 
354 aa  63.9  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.015404  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0263  Mg2 transporter protein CorA family protein  22.34 
 
 
300 aa  63.5  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.990966  normal  0.524479 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3994  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.73 
 
 
316 aa  63.5  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000979692  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3825  magnesium and cobalt transport protein  26.73 
 
 
316 aa  63.5  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.9681200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3841  magnesium and cobalt transport protein  26.73 
 
 
316 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4108  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.73 
 
 
316 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.03946e-59 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4306  magnesium/cobalt transporter CorA  26.73 
 
 
320 aa  63.5  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000440418  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0696  magnesium and cobalt transport protein CorA  31 
 
 
355 aa  63.2  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>