More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0305 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0305  transport protein  100 
 
 
366 aa  747    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0423959 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0373  Mg2 transporter protein CorA family protein  65.75 
 
 
360 aa  485  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000133876 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0244  Mg2+ transporter protein, CorA-like  59.62 
 
 
371 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0191  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  59.89 
 
 
371 aa  437  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.503449  normal  0.774114 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3806  Mg2+ transporter protein, CorA-like  59.22 
 
 
412 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000191662  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0379  Mg2 transporter protein CorA family protein  55.82 
 
 
397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0326  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  53.15 
 
 
409 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.199885 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0260  Mg2 transporter protein CorA family protein  54.59 
 
 
401 aa  398  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.206311  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0265  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  54.34 
 
 
401 aa  394  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4927  Mg2 transporter protein CorA family protein  54.38 
 
 
386 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0109111  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0389  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  53.48 
 
 
375 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3150  Mg2+ transporter protein, CorA-like  41.62 
 
 
396 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3287  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  40.05 
 
 
393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2768  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.98 
 
 
354 aa  99.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  25 
 
 
358 aa  95.5  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.67 
 
 
351 aa  90.5  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4989  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.52 
 
 
376 aa  90.1  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.15 
 
 
351 aa  89  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3530  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.52 
 
 
357 aa  88.6  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.203134  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.37 
 
 
341 aa  84  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.73 
 
 
316 aa  84  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2665  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.09 
 
 
390 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111176 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.16 
 
 
353 aa  82  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0176371  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0252  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.37 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4037  magnesium and cobalt transport protein CorA  34 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1587  magnesium and cobalt transport protein CorA  20.57 
 
 
353 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.188358  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1912  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.23 
 
 
374 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107117  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0173  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.58 
 
 
352 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1735  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.89 
 
 
298 aa  80.1  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942891  hitchhiker  0.00692573 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1811  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.27 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3419  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.45 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222754  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2224  magnesium and cobalt transport protein CorA  38 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000656607  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2244  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.13 
 
 
357 aa  80.1  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000192841  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.61 
 
 
367 aa  79.7  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0433  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.63 
 
 
356 aa  79.7  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1189  magnesium/cobalt transporter CorA  31.75 
 
 
365 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2267  magnesium and cobalt transport protein CorA  32 
 
 
360 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2983  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
354 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.23033  normal  0.025318 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2170  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.97 
 
 
372 aa  79.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.574954 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1738  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.3 
 
 
352 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.277865 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0865  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.34 
 
 
352 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.916446  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2520  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.69 
 
 
357 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107852  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0668  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.38 
 
 
385 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0284032  normal  0.71068 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0648  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.38 
 
 
385 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0696  magnesium and cobalt transport protein CorA  36 
 
 
355 aa  75.5  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0582  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.54 
 
 
354 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000747796  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2107  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.41 
 
 
381 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.61648 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1399  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.91 
 
 
354 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0969  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.65 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231272  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3012  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.7 
 
 
354 aa  73.6  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.815439  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0933  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.72 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0150  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  36.27 
 
 
345 aa  73.2  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0556  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.95 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1006  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.98 
 
 
547 aa  72.8  0.000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3786  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  33.33 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.02 
 
 
339 aa  72.8  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4178  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.44 
 
 
322 aa  72.8  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.57 
 
 
354 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1997  magnesium and cobalt transport protein CorA  32 
 
 
395 aa  72.4  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.223184  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1913  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.56 
 
 
375 aa  72.4  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0789  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  32.32 
 
 
322 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.957399  normal  0.0628578 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0263  Mg2 transporter protein CorA family protein  43.42 
 
 
300 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.990966  normal  0.524479 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2424  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.34 
 
 
318 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2937  putative cobalt/magnesium uptake transporter  32.65 
 
 
354 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2791  putative cobalt/magnesium uptake transporter  32.65 
 
 
354 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0137  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.1 
 
 
368 aa  72  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1617  magnesium and cobalt transport protein CorA  25 
 
 
354 aa  72  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1262  putative cation transporter  27.88 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0115831  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2074  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.13 
 
 
357 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1691  Mg2+ transporter protein, CorA-like  25.88 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2182  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.96 
 
 
327 aa  70.5  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709225  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2085  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.9 
 
 
353 aa  70.1  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3204  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.53 
 
 
379 aa  70.1  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648086  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2333  magnesium and cobalt transport protein CorA  25 
 
 
387 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.63 
 
 
339 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1102  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.63 
 
 
351 aa  70.1  0.00000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.528236  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10618  Magnesium and cobalt transport protein  24.71 
 
 
363 aa  69.7  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1675  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
314 aa  69.3  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2213  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.27 
 
 
365 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1521  magnesium/cobalt transporter CorA  25.68 
 
 
375 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0436  magnesium and cobalt transport protein CorA  32 
 
 
354 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2417  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.31 
 
 
315 aa  68.9  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2371  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  24.31 
 
 
315 aa  68.9  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.563119  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1928  magnesium and cobalt transport protein CorA  30 
 
 
362 aa  68.6  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185921  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.81 
 
 
322 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4191  magnesium and cobalt transport protein CorA  30 
 
 
382 aa  68.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.259759  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0646  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.18 
 
 
353 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0204  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.88 
 
 
391 aa  67.8  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174805  hitchhiker  0.00515093 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2307  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.27 
 
 
322 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2181  Mg2 transporter protein CorA family protein  34 
 
 
314 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0833206  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1416  magnesium/cobalt transporter CorA  29.63 
 
 
354 aa  67  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1725  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.29 
 
 
372 aa  67  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0607  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.29 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1371  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.3 
 
 
387 aa  66.2  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0800  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  34.21 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2270  Mg2 transporter protein CorA family protein  34 
 
 
314 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0371321  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.71 
 
 
321 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0943  Mg2 transporter protein, CorA family protein  34.78 
 
 
322 aa  65.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3992  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.36 
 
 
353 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.106328  normal  0.19247 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1870  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.67 
 
 
363 aa  65.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>