More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1262 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1262  putative cation transporter  100 
 
 		 309 aa  605  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0115831  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1075  magnesium and cobalt transport protein CorA, putative  98.38 
 
 		 309 aa  596  1e-169  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.184349  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.56 
 
 		 316 aa  132  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1912  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.28 
 
 		 374 aa  124  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107117  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0933  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.81 
 
 		 325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1587  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.14 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.188358  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1811  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.18 
 
 		 333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.39 
 
 		 341 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1738  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.46 
 
 		 352 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.277865 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0433  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.88 
 
 		 356 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3419  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.56 
 
 		 355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222754  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4037  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.38 
 
 		 327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.58 
 
 		 351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0173  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.41 
 
 		 352 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2768  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.83 
 
 		 354 aa  109  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.32 
 
 		 351 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0865  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.65 
 
 		 352 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.916446  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0668  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.81 
 
 		 385 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0284032  normal  0.71068 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0648  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.81 
 
 		 385 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2244  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.76 
 
 		 357 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000192841  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2783  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.56 
 
 		 316 aa  106  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000249719  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2520  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.85 
 
 		 357 aa  106  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107852  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.53 
 
 		 322 aa  106  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.17 
 
 		 354 aa  106  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.99 
 
 		 353 aa  105  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0176371  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4306  magnesium/cobalt transporter CorA  24.17 
 
 		 320 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000440418  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2224  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.91 
 
 		 291 aa  105  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000656607  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3994  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.17 
 
 		 316 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000979692  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3825  magnesium and cobalt transport protein  24.17 
 
 		 316 aa  105  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.9681200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4108  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.17 
 
 		 316 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.03946e-59 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0556  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.48 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3190  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.17 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.38171  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2791  putative cobalt/magnesium uptake transporter  23.97 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.85 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1913  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.56 
 
 		 375 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3841  magnesium and cobalt transport protein  23.84 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1617  magnesium and cobalt transport protein CorA  25 
 
 		 354 aa  103  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0054  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.33 
 
 		 325 aa  103  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349471  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1997  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.89 
 
 		 395 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.223184  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4153  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.84 
 
 		 320 aa  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000417339  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1416  magnesium/cobalt transporter CorA  22.18 
 
 		 354 aa  103  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0252  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.22 
 
 		 353 aa  103  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4194  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.84 
 
 		 316 aa  102  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000487176  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4217  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.84 
 
 		 316 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000527032  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2937  putative cobalt/magnesium uptake transporter  24.44 
 
 		 354 aa  102  8e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  26.34 
 
 		 358 aa  102  8e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.19 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3915  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.13 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000328218  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0582  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.04 
 
 		 354 aa  100  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000747796  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1189  magnesium/cobalt transporter CorA  26.35 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1043  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.85 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000724407  decreased coverage  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0436  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.3 
 
 		 354 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2983  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.24 
 
 		 354 aa  99.8  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.23033  normal  0.025318 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0646  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.32 
 
 		 353 aa  99  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1958  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.48 
 
 		 310 aa  99  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000232842  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1399  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.88 
 
 		 354 aa  99  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2307  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.73 
 
 		 322 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1006  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.95 
 
 		 547 aa  97.8  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1870  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.95 
 
 		 363 aa  97.4  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_521  magnesium and cobalt transport protein  26.52 
 
 		 354 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.015404  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2267  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.55 
 
 		 360 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2085  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.03 
 
 		 353 aa  97.1  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_365  magnesium and cobalt transport protein  20.88 
 
 		 316 aa  97.4  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.391615  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  20.82 
 
 		 367 aa  97.4  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1521  magnesium/cobalt transporter CorA  26.24 
 
 		 375 aa  97.4  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3012  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.95 
 
 		 354 aa  97.1  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.815439  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1581  magnesium/cobalt transporter CorA  22.26 
 
 		 367 aa  95.9  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0107279  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2665  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.43 
 
 		 390 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111176 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1928  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.72 
 
 		 362 aa  94.4  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185921  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2074  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.88 
 
 		 357 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0424  magnesium and cobalt transport protein, putative  20.51 
 
 		 316 aa  93.6  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.11589  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0400  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  19.78 
 
 		 316 aa  92.8  6e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.373431  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4989  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.88 
 
 		 376 aa  91.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2182  magnesium and cobalt transport protein CorA  20.06 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1576  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.72 
 
 		 323 aa  89.7  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.547991  normal  0.190888 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4178  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.3 
 
 		 322 aa  89.4  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1169  Mg2 transporter protein CorA family protein  21.84 
 
 		 344 aa  89.7  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2371  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  23.17 
 
 		 315 aa  89.4  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.563119  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10618  Magnesium and cobalt transport protein  23.99 
 
 		 363 aa  89.4  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2417  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.17 
 
 		 315 aa  89.4  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4191  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.06 
 
 		 382 aa  87.8  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.259759  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1675  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.73 
 
 		 314 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0204  Mg2 transporter protein CorA family protein  18.69 
 
 		 391 aa  87.8  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174805  hitchhiker  0.00515093 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3204  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.78 
 
 		 379 aa  87.8  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648086  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0696  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.77 
 
 		 355 aa  87.8  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1732  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.73 
 
 		 355 aa  87.8  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0795  magnesium/cobalt transporter CorA  22.22 
 
 		 380 aa  86.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5404  Mg2 transporter protein CorA family protein  18.82 
 
 		 326 aa  86.7  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0808766 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2181  Mg2 transporter protein CorA family protein  22.08 
 
 		 314 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0833206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2270  Mg2 transporter protein CorA family protein  21.57 
 
 		 314 aa  85.9  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0371321  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2333  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.31 
 
 		 387 aa  85.5  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2624  magnesium and cobalt transport protein CorA  20.82 
 
 		 323 aa  85.9  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0065  Mg2+ transporter protein, CorA-like  19.71 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3316  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.11 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1371  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.63 
 
 		 387 aa  84  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2129  Mg2 transporter protein CorA family protein  20.53 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0400102  normal  0.185773 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1041  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.08 
 
 		 348 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78816  normal  0.435904 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0816  magnesium and cobalt transport protein CorA  18.95 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2163  magnesium and cobalt transport protein CorA  20.13 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0100402  hitchhiker  0.00146942 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0739  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.9 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000829129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>