More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1006 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1006  magnesium and cobalt transport protein CorA  100 
 
 
547 aa  1108    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3419  magnesium and cobalt transport protein CorA  48.83 
 
 
355 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222754  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2983  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.22 
 
 
354 aa  345  1e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.23033  normal  0.025318 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.77 
 
 
367 aa  344  2e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1189  magnesium/cobalt transporter CorA  45.92 
 
 
365 aa  334  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.24 
 
 
353 aa  333  6e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0176371  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0646  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.53 
 
 
353 aa  331  2e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.45 
 
 
351 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.74 
 
 
351 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0252  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.09 
 
 
353 aa  325  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2768  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.99 
 
 
354 aa  323  6e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3012  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.36 
 
 
354 aa  320  3e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.815439  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2085  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.22 
 
 
353 aa  318  1e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1399  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.51 
 
 
354 aa  318  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.87 
 
 
354 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2520  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.39 
 
 
357 aa  313  6.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107852  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1617  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.15 
 
 
354 aa  309  6.999999999999999e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10618  Magnesium and cobalt transport protein  41.89 
 
 
363 aa  305  1.0000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2244  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.65 
 
 
357 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000192841  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  41.38 
 
 
358 aa  299  8e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1912  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.81 
 
 
374 aa  296  8e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107117  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0556  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.79 
 
 
354 aa  291  2e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1870  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.9 
 
 
363 aa  291  2e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1913  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.79 
 
 
375 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0433  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.82 
 
 
356 aa  288  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.01 
 
 
341 aa  288  1e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0582  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.35 
 
 
354 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000747796  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1725  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.54 
 
 
372 aa  287  4e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1732  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.45 
 
 
355 aa  287  4e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_521  magnesium and cobalt transport protein  41.5 
 
 
354 aa  283  5.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.015404  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0795  magnesium/cobalt transporter CorA  40 
 
 
380 aa  281  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2333  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.83 
 
 
387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1521  magnesium/cobalt transporter CorA  38.46 
 
 
375 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2267  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.48 
 
 
360 aa  273  8.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1928  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.15 
 
 
362 aa  272  1e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185921  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3204  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.01 
 
 
379 aa  272  1e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648086  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0696  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.92 
 
 
355 aa  272  1e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4989  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.03 
 
 
376 aa  269  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1041  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.71 
 
 
348 aa  268  2e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78816  normal  0.435904 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0668  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.84 
 
 
385 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0284032  normal  0.71068 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1416  magnesium/cobalt transporter CorA  40.4 
 
 
354 aa  264  4e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0648  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.84 
 
 
385 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0489  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.5 
 
 
383 aa  260  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0137  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.04 
 
 
368 aa  256  1.0000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1997  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.76 
 
 
395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.223184  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0173  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.82 
 
 
352 aa  244  3e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0865  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.1 
 
 
352 aa  242  1e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.916446  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2107  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.67 
 
 
381 aa  237  4e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.61648 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0739  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.25 
 
 
374 aa  234  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000829129 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1581  magnesium/cobalt transporter CorA  36.19 
 
 
367 aa  233  1e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0107279  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0436  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.4 
 
 
354 aa  232  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2074  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.19 
 
 
357 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2937  putative cobalt/magnesium uptake transporter  35.45 
 
 
354 aa  231  3e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1587  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.39 
 
 
353 aa  229  9e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.188358  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2791  putative cobalt/magnesium uptake transporter  35.45 
 
 
354 aa  229  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2665  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.28 
 
 
390 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111176 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1738  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.1 
 
 
352 aa  228  3e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.277865 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4191  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.26 
 
 
382 aa  220  3.9999999999999997e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.259759  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1992  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.16 
 
 
360 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4182  magnesium and cobalt transport protein CorA  34 
 
 
381 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4221  magnesium and cobalt transport protein CorA  34 
 
 
381 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2170  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.65 
 
 
372 aa  217  4e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.574954 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2667  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.77 
 
 
355 aa  203  6e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0969  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.26 
 
 
356 aa  201  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231272  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2182  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.02 
 
 
327 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709225  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1371  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.49 
 
 
387 aa  197  6e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4037  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.58 
 
 
327 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1102  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.36 
 
 
351 aa  191  2.9999999999999997e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.528236  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0054  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.48 
 
 
325 aa  189  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349471  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3530  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.3 
 
 
357 aa  183  7e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.203134  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0785  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.56 
 
 
332 aa  182  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0685097  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.39 
 
 
316 aa  180  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1811  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.69 
 
 
333 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0933  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.05 
 
 
325 aa  166  9e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2224  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.14 
 
 
291 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000656607  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.51 
 
 
322 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2783  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.97 
 
 
316 aa  158  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000249719  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.77 
 
 
339 aa  156  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0979  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.47 
 
 
325 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272451  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2266  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.47 
 
 
325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2133  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.47 
 
 
325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2077  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.47 
 
 
325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4217  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.91 
 
 
316 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000527032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4153  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.91 
 
 
320 aa  152  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000417339  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4194  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.91 
 
 
316 aa  152  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000487176  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3841  magnesium and cobalt transport protein  28.9 
 
 
316 aa  152  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3915  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.1 
 
 
316 aa  152  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000328218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4108  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.55 
 
 
316 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.03946e-59 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3994  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.55 
 
 
316 aa  151  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000979692  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3825  magnesium and cobalt transport protein  30.55 
 
 
316 aa  151  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.9681200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.81 
 
 
339 aa  151  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4306  magnesium/cobalt transporter CorA  30.55 
 
 
320 aa  151  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000440418  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1043  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.91 
 
 
316 aa  150  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000724407  decreased coverage  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11264  magnesium and cobalt transport transmembrane protein corA  30.85 
 
 
366 aa  150  8e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00777117  hitchhiker  0.000740018 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2311  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.77 
 
 
325 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2213  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.07 
 
 
365 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2264  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.91 
 
 
325 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6358  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.18 
 
 
325 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1721  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.18 
 
 
325 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1735  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.07 
 
 
325 aa  147  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.577516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>