More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1992 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1992  magnesium and cobalt transport protein CorA  100 
 
 
360 aa  738    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2074  magnesium and cobalt transport protein CorA  56.11 
 
 
357 aa  408  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1416  magnesium/cobalt transporter CorA  53.38 
 
 
354 aa  325  5e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2333  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.15 
 
 
387 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0137  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.45 
 
 
368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0795  magnesium/cobalt transporter CorA  44.01 
 
 
380 aa  298  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.54 
 
 
367 aa  285  5.999999999999999e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1189  magnesium/cobalt transporter CorA  42.27 
 
 
365 aa  281  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3419  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.92 
 
 
355 aa  276  6e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222754  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2085  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.67 
 
 
353 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0668  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.44 
 
 
385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0284032  normal  0.71068 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0648  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.48 
 
 
385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.39 
 
 
353 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0176371  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3204  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.27 
 
 
379 aa  270  2.9999999999999997e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648086  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0252  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.76 
 
 
353 aa  269  5e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_002936  DET0582  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.74 
 
 
354 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000747796  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.24 
 
 
351 aa  267  2e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.3 
 
 
351 aa  265  1e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2667  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.72 
 
 
355 aa  263  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0556  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.82 
 
 
354 aa  261  1e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0489  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.55 
 
 
383 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_521  magnesium and cobalt transport protein  36.74 
 
 
354 aa  259  4e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.015404  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0646  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.27 
 
 
353 aa  259  6e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2983  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.96 
 
 
354 aa  257  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.23033  normal  0.025318 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3012  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.13 
 
 
354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.815439  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1399  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.67 
 
 
354 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.11 
 
 
341 aa  248  8e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2520  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.06 
 
 
357 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107852  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2665  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.15 
 
 
390 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111176 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1997  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.89 
 
 
395 aa  246  4.9999999999999997e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.223184  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2244  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.55 
 
 
357 aa  246  6e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000192841  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2768  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.26 
 
 
354 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1912  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.71 
 
 
374 aa  241  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107117  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1732  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.44 
 
 
355 aa  240  2.9999999999999997e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  36.61 
 
 
358 aa  239  5e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2267  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.17 
 
 
360 aa  236  5.0000000000000005e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1006  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.16 
 
 
547 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1870  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.85 
 
 
363 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1581  magnesium/cobalt transporter CorA  36.14 
 
 
367 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0107279  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10618  Magnesium and cobalt transport protein  34.45 
 
 
363 aa  234  1.0000000000000001e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1617  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.07 
 
 
354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4989  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.44 
 
 
376 aa  232  6e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2107  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.03 
 
 
381 aa  232  8.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.61648 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4221  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.43 
 
 
381 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1371  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.29 
 
 
387 aa  231  1e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4182  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.43 
 
 
381 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.66 
 
 
354 aa  231  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2182  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.53 
 
 
327 aa  229  4e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709225  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0433  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.2 
 
 
356 aa  229  5e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4191  magnesium and cobalt transport protein CorA  41 
 
 
382 aa  227  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.259759  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1041  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.64 
 
 
348 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78816  normal  0.435904 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0054  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.76 
 
 
325 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349471  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1928  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.12 
 
 
362 aa  217  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185921  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2170  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.06 
 
 
372 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.574954 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1725  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.21 
 
 
372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0696  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.91 
 
 
355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1913  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.06 
 
 
375 aa  212  7.999999999999999e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0739  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.88 
 
 
374 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000829129 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1587  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.87 
 
 
353 aa  210  4e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.188358  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2937  putative cobalt/magnesium uptake transporter  33.56 
 
 
354 aa  201  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1521  magnesium/cobalt transporter CorA  33.52 
 
 
375 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1738  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.28 
 
 
352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.277865 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4037  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.6 
 
 
327 aa  200  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2791  putative cobalt/magnesium uptake transporter  33.22 
 
 
354 aa  199  7e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.7 
 
 
322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0436  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.54 
 
 
354 aa  193  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0173  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.61 
 
 
352 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0785  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.77 
 
 
332 aa  191  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0685097  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.53 
 
 
339 aa  189  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0865  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.05 
 
 
352 aa  186  6e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.916446  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0969  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.15 
 
 
356 aa  186  6e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231272  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.54 
 
 
339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0933  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.76 
 
 
325 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.55 
 
 
321 aa  179  9e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4178  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.26 
 
 
322 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6358  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.39 
 
 
325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1721  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.39 
 
 
325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1735  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.39 
 
 
325 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1642  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.08 
 
 
325 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5013  magnesium/cobalt transporter CorA  34.08 
 
 
325 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.117877  normal  0.108957 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1539  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.22 
 
 
325 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.555793 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1811  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.38 
 
 
333 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1643  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.44 
 
 
325 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222374  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2783  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.54 
 
 
316 aa  170  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000249719  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3994  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.13 
 
 
316 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000979692  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3825  magnesium and cobalt transport protein  32.13 
 
 
316 aa  169  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.9681200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4108  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.13 
 
 
316 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.03946e-59 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3841  magnesium and cobalt transport protein  32.13 
 
 
316 aa  169  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4306  magnesium/cobalt transporter CorA  32.13 
 
 
320 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000440418  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1102  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.45 
 
 
351 aa  169  7e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.528236  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  32 
 
 
316 aa  168  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1043  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.13 
 
 
316 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000724407  decreased coverage  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4194  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.8 
 
 
316 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000487176  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4153  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.8 
 
 
320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000417339  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4217  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.8 
 
 
316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000527032  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1239  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.12 
 
 
325 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3915  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.15 
 
 
316 aa  165  9e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000328218  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2224  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.1 
 
 
291 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000656607  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0057  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.72 
 
 
322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2264  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.63 
 
 
325 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>