More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2667 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2667  magnesium and cobalt transport protein CorA  100 
 
 		 355 aa  736    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1416  magnesium/cobalt transporter CorA  44.41 
 
 		 354 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2074  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.66 
 
 		 357 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2333  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.77 
 
 		 387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0795  magnesium/cobalt transporter CorA  37.78 
 
 		 380 aa  267  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1992  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.5 
 
 		 360 aa  259  4e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3204  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.5 
 
 		 379 aa  258  1e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648086  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0668  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.68 
 
 		 385 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0284032  normal  0.71068 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0648  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.68 
 
 		 385 aa  256  6e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0646  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.15 
 
 		 353 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0137  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.11 
 
 		 368 aa  251  2e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0489  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.8 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3012  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.57 
 
 		 354 aa  246  4e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.815439  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.04 
 
 		 351 aa  238  1e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.55 
 
 		 341 aa  236  4e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1189  magnesium/cobalt transporter CorA  36.94 
 
 		 365 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.32 
 
 		 351 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1581  magnesium/cobalt transporter CorA  34.52 
 
 		 367 aa  235  8e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0107279  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2983  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.39 
 
 		 354 aa  235  9e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.23033  normal  0.025318 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.82 
 
 		 367 aa  230  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3419  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.54 
 
 		 355 aa  231  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222754  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2665  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.04 
 
 		 390 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111176 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4221  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.65 
 
 		 381 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1617  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.44 
 
 		 354 aa  226  4e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4182  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.65 
 
 		 381 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1997  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.89 
 
 		 395 aa  226  5.0000000000000005e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.223184  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10618  Magnesium and cobalt transport protein  34.72 
 
 		 363 aa  224  1e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.13 
 
 		 353 aa  223  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0176371  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2768  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.67 
 
 		 354 aa  222  6e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2107  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.9 
 
 		 381 aa  222  7e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.61648 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.61 
 
 		 354 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2520  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.17 
 
 		 357 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107852  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1006  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.77 
 
 		 547 aa  219  6e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  32.87 
 
 		 358 aa  219  6e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2244  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.4 
 
 		 357 aa  217  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000192841  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2170  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.35 
 
 		 372 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.574954 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4191  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.96 
 
 		 382 aa  215  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.259759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0252  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.73 
 
 		 353 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1399  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.98 
 
 		 354 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0556  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.65 
 
 		 354 aa  209  5e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1041  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.91 
 
 		 348 aa  208  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78816  normal  0.435904 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1725  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.68 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1521  magnesium/cobalt transporter CorA  32.18 
 
 		 375 aa  207  2e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_002936  DET0582  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.65 
 
 		 354 aa  207  3e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000747796  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2085  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.4 
 
 		 353 aa  207  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1913  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.84 
 
 		 375 aa  207  3e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1732  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.52 
 
 		 355 aa  207  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1870  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.15 
 
 		 363 aa  204  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0696  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.34 
 
 		 355 aa  204  2e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1912  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.77 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107117  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1928  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.53 
 
 		 362 aa  201  9.999999999999999e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185921  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0739  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.62 
 
 		 374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000829129 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0433  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.12 
 
 		 356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1587  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.06 
 
 		 353 aa  197  3e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.188358  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_521  magnesium and cobalt transport protein  33.89 
 
 		 354 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.015404  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2182  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.98 
 
 		 327 aa  196  5.000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1371  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.85 
 
 		 387 aa  196  7e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4989  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.06 
 
 		 376 aa  195  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0054  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.44 
 
 		 325 aa  194  3e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349471  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0969  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.82 
 
 		 356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2267  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.84 
 
 		 360 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2791  putative cobalt/magnesium uptake transporter  30.34 
 
 		 354 aa  179  5.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2937  putative cobalt/magnesium uptake transporter  29.86 
 
 		 354 aa  178  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0173  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.76 
 
 		 352 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0865  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.43 
 
 		 352 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.916446  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1738  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.35 
 
 		 352 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.277865 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0785  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.33 
 
 		 332 aa  173  5e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0685097  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0436  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.81 
 
 		 354 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4037  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.78 
 
 		 327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.33 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1102  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.86 
 
 		 351 aa  162  7e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.528236  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.86 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.15 
 
 		 339 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0933  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.06 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3530  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.7 
 
 		 357 aa  149  9e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.203134  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.79 
 
 		 321 aa  146  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0198  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.87 
 
 		 357 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2224  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.69 
 
 		 291 aa  143  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000656607  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1539  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.13 
 
 		 325 aa  143  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.555793 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6358  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.13 
 
 		 325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1721  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.13 
 
 		 325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1735  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.13 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1239  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.84 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0057  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.11 
 
 		 322 aa  140  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2783  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.51 
 
 		 316 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000249719  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1643  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.81 
 
 		 325 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222374  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2266  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.14 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2264  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.48 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2077  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.14 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2133  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.14 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1642  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.14 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3978  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.47 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1811  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.17 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3992  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.47 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.106328  normal  0.19247 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4052  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.47 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1996  magnesium/cobalt transporter CorA  28.48 
 
 		 325 aa  136  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2311  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.14 
 
 		 325 aa  135  9e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0979  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.81 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272451  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.03 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2421  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.64 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>