More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4989 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4989  magnesium and cobalt transport protein CorA  100 
 
 		 376 aa  778    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2267  magnesium and cobalt transport protein CorA  53.3 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3419  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.02 
 
 		 355 aa  318  7e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222754  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2244  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.61 
 
 		 357 aa  309  4e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000192841  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.66 
 
 		 353 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0176371  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.86 
 
 		 367 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0252  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.94 
 
 		 353 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10618  Magnesium and cobalt transport protein  41.13 
 
 		 363 aa  305  1.0000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0582  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.06 
 
 		 354 aa  302  5.000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000747796  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0556  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.9 
 
 		 354 aa  299  5e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1189  magnesium/cobalt transporter CorA  41.14 
 
 		 365 aa  297  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3012  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.29 
 
 		 354 aa  297  2e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.815439  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.45 
 
 		 351 aa  296  3e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1399  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.81 
 
 		 354 aa  294  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2768  magnesium and cobalt transport protein CorA  40 
 
 		 354 aa  293  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_521  magnesium and cobalt transport protein  42.18 
 
 		 354 aa  292  6e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.015404  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  41.78 
 
 		 358 aa  292  6e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.17 
 
 		 351 aa  290  4e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2085  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.72 
 
 		 353 aa  288  1e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0646  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.4 
 
 		 353 aa  288  1e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2520  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.19 
 
 		 357 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107852  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0648  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.82 
 
 		 385 aa  285  8e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0668  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.82 
 
 		 385 aa  285  8e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0284032  normal  0.71068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2983  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.53 
 
 		 354 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.23033  normal  0.025318 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0795  magnesium/cobalt transporter CorA  42.74 
 
 		 380 aa  281  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.67 
 
 		 341 aa  280  3e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1521  magnesium/cobalt transporter CorA  38.48 
 
 		 375 aa  279  7e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1725  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.23 
 
 		 372 aa  278  1e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2333  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.71 
 
 		 387 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1006  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.32 
 
 		 547 aa  276  3e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2665  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.6 
 
 		 390 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111176 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1912  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.33 
 
 		 374 aa  271  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107117  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.8 
 
 		 354 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1617  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.03 
 
 		 354 aa  269  7e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1928  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.22 
 
 		 362 aa  268  1e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185921  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0696  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.97 
 
 		 355 aa  261  2e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1870  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.33 
 
 		 363 aa  257  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3204  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.55 
 
 		 379 aa  254  1.0000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648086  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1041  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.42 
 
 		 348 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78816  normal  0.435904 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0433  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.06 
 
 		 356 aa  248  1e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1913  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.66 
 
 		 375 aa  246  4e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4191  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.61 
 
 		 382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.259759  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1732  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.08 
 
 		 355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2791  putative cobalt/magnesium uptake transporter  36.69 
 
 		 354 aa  243  3e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2937  putative cobalt/magnesium uptake transporter  36.69 
 
 		 354 aa  243  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0489  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.43 
 
 		 383 aa  243  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0137  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.07 
 
 		 368 aa  239  4e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1997  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.81 
 
 		 395 aa  239  5e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.223184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0739  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.31 
 
 		 374 aa  238  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000829129 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1416  magnesium/cobalt transporter CorA  37.84 
 
 		 354 aa  237  3e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2107  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.9 
 
 		 381 aa  237  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.61648 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2170  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.36 
 
 		 372 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.574954 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0436  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.01 
 
 		 354 aa  227  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1587  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.73 
 
 		 353 aa  226  4e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.188358  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4221  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.72 
 
 		 381 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4182  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.72 
 
 		 381 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1371  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.34 
 
 		 387 aa  219  5e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1992  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.44 
 
 		 360 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0173  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.9 
 
 		 352 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0865  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.9 
 
 		 352 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.916446  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2074  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.1 
 
 		 357 aa  215  9e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1738  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.86 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.277865 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1581  magnesium/cobalt transporter CorA  29.79 
 
 		 367 aa  202  6e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0107279  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.88 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.12 
 
 		 339 aa  197  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.13 
 
 		 321 aa  193  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4037  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.48 
 
 		 327 aa  192  8e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0785  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.25 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0685097  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3530  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.47 
 
 		 357 aa  188  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.203134  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2667  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.98 
 
 		 355 aa  188  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0933  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.22 
 
 		 325 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0969  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.51 
 
 		 356 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1102  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.05 
 
 		 351 aa  181  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.528236  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2182  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.1 
 
 		 327 aa  177  3e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2224  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.15 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000656607  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1811  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.56 
 
 		 333 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 		 322 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0054  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.27 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349471  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1539  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.57 
 
 		 325 aa  162  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.555793 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2133  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.87 
 
 		 325 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2266  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.87 
 
 		 325 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4306  magnesium/cobalt transporter CorA  30.67 
 
 		 320 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000440418  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2077  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.87 
 
 		 325 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3994  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.67 
 
 		 316 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000979692  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3825  magnesium and cobalt transport protein  30.67 
 
 		 316 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.9681200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4108  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.67 
 
 		 316 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.03946e-59 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2783  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.96 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000249719  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3841  magnesium and cobalt transport protein  30.67 
 
 		 316 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1043  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.09 
 
 		 316 aa  160  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000724407  decreased coverage  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4153  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.45 
 
 		 320 aa  159  8e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000417339  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4194  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.45 
 
 		 316 aa  159  9e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000487176  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0979  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.52 
 
 		 325 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272451  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4217  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.45 
 
 		 316 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000527032  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2311  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.22 
 
 		 325 aa  159  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1642  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.57 
 
 		 325 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2421  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.7 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6358  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.57 
 
 		 325 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1735  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.57 
 
 		 325 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1721  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.57 
 
 		 325 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5013  magnesium/cobalt transporter CorA  33.22 
 
 		 325 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.117877  normal  0.108957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>