More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2170 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2170  magnesium and cobalt transport protein CorA  100 
 
 
372 aa  768    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.574954 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2333  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.51 
 
 
387 aa  282  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0795  magnesium/cobalt transporter CorA  38.2 
 
 
380 aa  271  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3204  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.98 
 
 
379 aa  270  2e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648086  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0648  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.11 
 
 
385 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0668  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.11 
 
 
385 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0284032  normal  0.71068 
 
 
-
 
NC_002936  DET0582  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.89 
 
 
354 aa  265  1e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000747796  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0646  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.28 
 
 
353 aa  263  3e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.57 
 
 
351 aa  259  6e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0556  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.07 
 
 
354 aa  259  7e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2107  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.61 
 
 
381 aa  258  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.61648 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3419  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.89 
 
 
355 aa  257  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222754  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.91 
 
 
351 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2768  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.66 
 
 
354 aa  251  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2665  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.64 
 
 
390 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111176 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.51 
 
 
341 aa  248  1e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_521  magnesium and cobalt transport protein  37.98 
 
 
354 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.015404  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2085  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.42 
 
 
353 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1189  magnesium/cobalt transporter CorA  39.35 
 
 
365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  36.39 
 
 
358 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.92 
 
 
367 aa  243  6e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1870  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.69 
 
 
363 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2983  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.01 
 
 
354 aa  241  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.23033  normal  0.025318 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10618  Magnesium and cobalt transport protein  37.6 
 
 
363 aa  240  2e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.14 
 
 
353 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0176371  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0252  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.35 
 
 
353 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1041  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.18 
 
 
348 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78816  normal  0.435904 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2244  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.26 
 
 
357 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000192841  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1399  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.87 
 
 
354 aa  236  6e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4191  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.01 
 
 
382 aa  235  9e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.259759  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1416  magnesium/cobalt transporter CorA  36.61 
 
 
354 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2520  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.97 
 
 
357 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107852  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1617  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.59 
 
 
354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0489  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.9 
 
 
383 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.31 
 
 
354 aa  231  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4989  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.1 
 
 
376 aa  229  6e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2267  magnesium and cobalt transport protein CorA  36 
 
 
360 aa  226  7e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0137  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.71 
 
 
368 aa  225  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0173  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.18 
 
 
352 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3012  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.67 
 
 
354 aa  223  4e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.815439  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2791  putative cobalt/magnesium uptake transporter  37.25 
 
 
354 aa  221  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0865  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.9 
 
 
352 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.916446  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1997  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.24 
 
 
395 aa  220  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.223184  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2937  putative cobalt/magnesium uptake transporter  36.69 
 
 
354 aa  220  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1587  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.93 
 
 
353 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.188358  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1006  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.65 
 
 
547 aa  218  2e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0433  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.89 
 
 
356 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4182  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.79 
 
 
381 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4221  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.79 
 
 
381 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0696  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.29 
 
 
355 aa  209  9e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1738  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.93 
 
 
352 aa  209  9e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.277865 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2074  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.43 
 
 
357 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1912  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
374 aa  208  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107117  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1992  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.06 
 
 
360 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2667  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.35 
 
 
355 aa  202  7e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1371  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.35 
 
 
387 aa  200  3.9999999999999996e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1928  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.79 
 
 
362 aa  199  6e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185921  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1732  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.51 
 
 
355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1521  magnesium/cobalt transporter CorA  32.3 
 
 
375 aa  197  3e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0054  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.38 
 
 
325 aa  197  3e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349471  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1913  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.8 
 
 
375 aa  195  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0739  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.2 
 
 
374 aa  193  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000829129 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0436  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.55 
 
 
354 aa  192  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1725  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.12 
 
 
372 aa  192  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1581  magnesium/cobalt transporter CorA  30.65 
 
 
367 aa  190  4e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0107279  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1102  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.69 
 
 
351 aa  181  2.9999999999999997e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.528236  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2182  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.39 
 
 
327 aa  176  5e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709225  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4037  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.54 
 
 
327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0969  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.9 
 
 
356 aa  165  9e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231272  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0785  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.47 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0685097  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.09 
 
 
321 aa  162  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
339 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0933  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.39 
 
 
325 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2264  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.95 
 
 
325 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.75 
 
 
339 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6358  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.65 
 
 
325 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1721  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.65 
 
 
325 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1735  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.65 
 
 
325 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1539  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.43 
 
 
325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.555793 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1239  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.88 
 
 
325 aa  153  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1643  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.19 
 
 
325 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222374  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1642  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.5 
 
 
325 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5013  magnesium/cobalt transporter CorA  29.72 
 
 
325 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.117877  normal  0.108957 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1811  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.04 
 
 
333 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1996  magnesium/cobalt transporter CorA  27.33 
 
 
325 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215662  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3915  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.84 
 
 
316 aa  149  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000328218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4108  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.18 
 
 
316 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.03946e-59 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3994  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.18 
 
 
316 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000979692  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3825  magnesium and cobalt transport protein  29.18 
 
 
316 aa  149  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.9681200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4306  magnesium/cobalt transporter CorA  29.18 
 
 
320 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000440418  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3841  magnesium and cobalt transport protein  29.18 
 
 
316 aa  149  9e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4153  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.18 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000417339  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4194  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.18 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000487176  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4217  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.18 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000527032  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.96 
 
 
322 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.37 
 
 
316 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2224  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.46 
 
 
291 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000656607  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2133  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.34 
 
 
325 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2266  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.34 
 
 
325 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2077  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.34 
 
 
325 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>