More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1928 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1928  magnesium and cobalt transport protein CorA  100 
 
 		 362 aa  739    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185921  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3419  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.15 
 
 		 355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222754  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10618  Magnesium and cobalt transport protein  43.47 
 
 		 363 aa  324  1e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0646  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.53 
 
 		 353 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2983  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.17 
 
 		 354 aa  309  5e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.23033  normal  0.025318 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.35 
 
 		 351 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.06 
 
 		 351 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2085  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.81 
 
 		 353 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.06 
 
 		 367 aa  305  7e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2520  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.67 
 
 		 357 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107852  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.82 
 
 		 353 aa  300  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0176371  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1189  magnesium/cobalt transporter CorA  39.55 
 
 		 365 aa  296  4e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0252  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.24 
 
 		 353 aa  296  6e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1617  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.21 
 
 		 354 aa  291  8e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1399  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.24 
 
 		 354 aa  289  4e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0582  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.55 
 
 		 354 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000747796  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0556  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.27 
 
 		 354 aa  282  7.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1006  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.15 
 
 		 547 aa  280  2e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.17 
 
 		 354 aa  279  6e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3012  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.04 
 
 		 354 aa  277  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.815439  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2333  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.86 
 
 		 387 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2244  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.62 
 
 		 357 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000192841  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4989  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.66 
 
 		 376 aa  273  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1732  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.79 
 
 		 355 aa  272  6e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.99 
 
 		 341 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_521  magnesium and cobalt transport protein  39.27 
 
 		 354 aa  268  1e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.015404  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0648  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.03 
 
 		 385 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0668  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.03 
 
 		 385 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0284032  normal  0.71068 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1912  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.96 
 
 		 374 aa  266  4e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107117  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  37.64 
 
 		 358 aa  265  8e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1725  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.64 
 
 		 372 aa  265  8.999999999999999e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0795  magnesium/cobalt transporter CorA  36.94 
 
 		 380 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2768  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.43 
 
 		 354 aa  264  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1913  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.9 
 
 		 375 aa  262  6e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1870  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.93 
 
 		 363 aa  260  3e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0433  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.57 
 
 		 356 aa  258  2e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1521  magnesium/cobalt transporter CorA  35.77 
 
 		 375 aa  255  9e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0696  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.86 
 
 		 355 aa  251  1e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0489  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.36 
 
 		 383 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1581  magnesium/cobalt transporter CorA  39.07 
 
 		 367 aa  249  6e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0107279  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1041  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.31 
 
 		 348 aa  245  8e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78816  normal  0.435904 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2267  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.6 
 
 		 360 aa  245  8e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3204  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.22 
 
 		 379 aa  240  2.9999999999999997e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648086  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2665  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.5 
 
 		 390 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111176 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1416  magnesium/cobalt transporter CorA  34.96 
 
 		 354 aa  233  3e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0173  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.88 
 
 		 352 aa  229  5e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0137  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.87 
 
 		 368 aa  229  8e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1738  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.16 
 
 		 352 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.277865 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2937  putative cobalt/magnesium uptake transporter  34.08 
 
 		 354 aa  226  4e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0865  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.62 
 
 		 352 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.916446  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1997  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.28 
 
 		 395 aa  226  7e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.223184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4221  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.5 
 
 		 381 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4182  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.5 
 
 		 381 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2791  putative cobalt/magnesium uptake transporter  33.52 
 
 		 354 aa  222  7e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1587  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.82 
 
 		 353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.188358  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0436  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.79 
 
 		 354 aa  217  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1992  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.12 
 
 		 360 aa  215  9e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4191  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.04 
 
 		 382 aa  214  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.259759  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0739  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.09 
 
 		 374 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000829129 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2074  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.43 
 
 		 357 aa  209  5e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2170  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.79 
 
 		 372 aa  208  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.574954 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2107  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.09 
 
 		 381 aa  199  5e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.61648 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0785  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.77 
 
 		 332 aa  199  9e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0685097  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4037  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.15 
 
 		 327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0054  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.63 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349471  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2667  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.53 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1371  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.12 
 
 		 387 aa  186  5e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2182  magnesium and cobalt transport protein CorA  33 
 
 		 327 aa  182  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0969  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.48 
 
 		 356 aa  181  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.28 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1102  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.87 
 
 		 351 aa  172  6.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.528236  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.81 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.53 
 
 		 339 aa  169  8e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.17 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3530  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.7 
 
 		 357 aa  163  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.203134  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0933  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.35 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.05 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1811  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.96 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2224  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.09 
 
 		 291 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000656607  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2307  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.3 
 
 		 322 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2181  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.39 
 
 		 314 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0833206  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4178  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.86 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2783  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.24 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000249719  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2270  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.39 
 
 		 314 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0371321  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1675  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.72 
 
 		 314 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3994  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.71 
 
 		 316 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000979692  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3825  magnesium and cobalt transport protein  30.71 
 
 		 316 aa  139  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.9681200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3841  magnesium and cobalt transport protein  30.71 
 
 		 316 aa  139  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4306  magnesium/cobalt transporter CorA  30.71 
 
 		 320 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000440418  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4108  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.71 
 
 		 316 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.03946e-59 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2213  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.49 
 
 		 365 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4153  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.71 
 
 		 320 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000417339  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4217  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.71 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000527032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1043  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.46 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000724407  decreased coverage  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4194  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.71 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000487176  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3915  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.71 
 
 		 316 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000328218  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2129  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.04 
 
 		 315 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0400102  normal  0.185773 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4482  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.07 
 
 		 374 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00436374  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0150  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  24.65 
 
 		 345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2421  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.29 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>