More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0739 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0739  magnesium and cobalt transport protein CorA  100 
 
 
374 aa  775    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000829129 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3419  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.98 
 
 
355 aa  271  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222754  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10618  Magnesium and cobalt transport protein  38.24 
 
 
363 aa  269  5e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.26 
 
 
367 aa  268  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0646  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.57 
 
 
353 aa  259  7e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.76 
 
 
351 aa  257  2e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1870  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.32 
 
 
363 aa  256  4e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1617  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.09 
 
 
354 aa  256  5e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.76 
 
 
354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.14 
 
 
351 aa  251  1e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.37 
 
 
341 aa  250  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1189  magnesium/cobalt transporter CorA  40.45 
 
 
365 aa  250  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0252  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.42 
 
 
353 aa  250  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0668  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.27 
 
 
385 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0284032  normal  0.71068 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0648  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.27 
 
 
385 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2983  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.78 
 
 
354 aa  248  9e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.23033  normal  0.025318 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.52 
 
 
353 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0176371  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2520  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.94 
 
 
357 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107852  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2244  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.78 
 
 
357 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000192841  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0582  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.71 
 
 
354 aa  238  1e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000747796  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0556  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.36 
 
 
354 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1913  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.7 
 
 
375 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3012  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.67 
 
 
354 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.815439  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2333  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.59 
 
 
387 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2085  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.08 
 
 
353 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1006  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.25 
 
 
547 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2768  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.94 
 
 
354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  38.24 
 
 
358 aa  233  3e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1399  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.61 
 
 
354 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2267  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.57 
 
 
360 aa  230  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4989  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.03 
 
 
376 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1912  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.58 
 
 
374 aa  227  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107117  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2665  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.54 
 
 
390 aa  225  9e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111176 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1725  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.7 
 
 
372 aa  224  2e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0489  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.53 
 
 
383 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_521  magnesium and cobalt transport protein  36.03 
 
 
354 aa  220  3e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.015404  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3204  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.72 
 
 
379 aa  220  3.9999999999999997e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648086  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1521  magnesium/cobalt transporter CorA  33.33 
 
 
375 aa  219  8.999999999999998e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0795  magnesium/cobalt transporter CorA  33.93 
 
 
380 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1732  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.14 
 
 
355 aa  216  5e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0433  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.87 
 
 
356 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1997  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.83 
 
 
395 aa  213  4.9999999999999996e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.223184  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2074  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.85 
 
 
357 aa  212  7e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0696  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.86 
 
 
355 aa  211  1e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4191  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.75 
 
 
382 aa  211  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.259759  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1416  magnesium/cobalt transporter CorA  35.14 
 
 
354 aa  209  6e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1928  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.09 
 
 
362 aa  204  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185921  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4221  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.18 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4182  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.18 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0137  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.94 
 
 
368 aa  200  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1581  magnesium/cobalt transporter CorA  33.14 
 
 
367 aa  196  6e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0107279  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2107  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.79 
 
 
381 aa  195  9e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.61648 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1041  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.78 
 
 
348 aa  195  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78816  normal  0.435904 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0436  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.56 
 
 
354 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2170  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.2 
 
 
372 aa  193  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.574954 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1992  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.88 
 
 
360 aa  192  8e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2182  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.18 
 
 
327 aa  192  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709225  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4037  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.56 
 
 
327 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2937  putative cobalt/magnesium uptake transporter  30.03 
 
 
354 aa  188  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0785  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.74 
 
 
332 aa  188  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0685097  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2791  putative cobalt/magnesium uptake transporter  30.03 
 
 
354 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0054  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.38 
 
 
325 aa  186  6e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349471  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2667  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.62 
 
 
355 aa  184  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.01 
 
 
322 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0865  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.05 
 
 
352 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.916446  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1587  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.77 
 
 
353 aa  177  3e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.188358  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0173  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.26 
 
 
352 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.67 
 
 
321 aa  170  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0969  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.21 
 
 
356 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231272  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.45 
 
 
339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1738  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.29 
 
 
352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.277865 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3530  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.43 
 
 
357 aa  163  6e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.203134  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1371  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.99 
 
 
387 aa  162  7e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.25 
 
 
339 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0933  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.07 
 
 
325 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1102  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.58 
 
 
351 aa  151  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.528236  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.91 
 
 
316 aa  150  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2133  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.97 
 
 
325 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2266  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.97 
 
 
325 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2077  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.97 
 
 
325 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2224  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.13 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000656607  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6358  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.72 
 
 
325 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1721  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.72 
 
 
325 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2311  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.03 
 
 
325 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1735  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.72 
 
 
325 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0057  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.77 
 
 
322 aa  146  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0979  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.63 
 
 
325 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272451  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4178  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.64 
 
 
322 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1811  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.55 
 
 
333 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2307  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.43 
 
 
322 aa  143  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1539  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.89 
 
 
325 aa  143  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.555793 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5013  magnesium/cobalt transporter CorA  28.53 
 
 
325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.117877  normal  0.108957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5404  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.59 
 
 
326 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0808766 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1643  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.48 
 
 
325 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222374  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0053  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  28.43 
 
 
330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0614291  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0414  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.07 
 
 
322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0984247  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1642  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.95 
 
 
325 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0816  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.71 
 
 
367 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0271  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.53 
 
 
370 aa  136  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0204  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.61 
 
 
391 aa  136  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174805  hitchhiker  0.00515093 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>