More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2085 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2085  magnesium and cobalt transport protein CorA  100 
 
 
353 aa  712    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  47.46 
 
 
367 aa  366  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3419  magnesium and cobalt transport protein CorA  49.01 
 
 
355 aa  359  3e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222754  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.57 
 
 
353 aa  353  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0176371  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1189  magnesium/cobalt transporter CorA  48.42 
 
 
365 aa  350  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  48 
 
 
351 aa  349  4e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  48 
 
 
351 aa  349  5e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0252  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.71 
 
 
353 aa  348  6e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2983  magnesium and cobalt transport protein CorA  47.14 
 
 
354 aa  347  2e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.23033  normal  0.025318 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3012  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.76 
 
 
354 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.815439  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0646  magnesium and cobalt transport protein CorA  47.13 
 
 
353 aa  342  5.999999999999999e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2520  magnesium and cobalt transport protein CorA  47.75 
 
 
357 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107852  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2244  magnesium and cobalt transport protein CorA  49.03 
 
 
357 aa  332  6e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000192841  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1870  magnesium and cobalt transport protein CorA  49.16 
 
 
363 aa  328  6e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  48 
 
 
341 aa  328  6e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0433  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.87 
 
 
356 aa  326  3e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.07 
 
 
354 aa  322  8e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1617  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.94 
 
 
354 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1006  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.22 
 
 
547 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1399  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.35 
 
 
354 aa  316  4e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1732  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.06 
 
 
355 aa  313  3.9999999999999997e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0556  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.28 
 
 
354 aa  312  5.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_521  magnesium and cobalt transport protein  40.28 
 
 
354 aa  311  1e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.015404  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0582  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.28 
 
 
354 aa  311  2e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000747796  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2768  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.81 
 
 
354 aa  310  2.9999999999999997e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1912  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.63 
 
 
374 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107117  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1725  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.46 
 
 
372 aa  305  6e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  40.67 
 
 
358 aa  305  7e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0696  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.36 
 
 
355 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10618  Magnesium and cobalt transport protein  40.74 
 
 
363 aa  301  2e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2333  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.02 
 
 
387 aa  298  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1521  magnesium/cobalt transporter CorA  42.86 
 
 
375 aa  296  3e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0668  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.45 
 
 
385 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0284032  normal  0.71068 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0648  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.45 
 
 
385 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1913  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.25 
 
 
375 aa  292  6e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1928  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.81 
 
 
362 aa  291  8e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185921  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1416  magnesium/cobalt transporter CorA  44.24 
 
 
354 aa  291  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4989  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.92 
 
 
376 aa  281  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0795  magnesium/cobalt transporter CorA  40 
 
 
380 aa  281  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2107  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.26 
 
 
381 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.61648 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1997  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.28 
 
 
395 aa  269  5e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.223184  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2267  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.78 
 
 
360 aa  269  7e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4191  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.07 
 
 
382 aa  267  2e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.259759  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3204  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.46 
 
 
379 aa  265  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648086  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2665  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.75 
 
 
390 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111176 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0436  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.7 
 
 
354 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1992  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.67 
 
 
360 aa  260  3e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1041  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.16 
 
 
348 aa  259  4e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78816  normal  0.435904 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1581  magnesium/cobalt transporter CorA  40.73 
 
 
367 aa  256  3e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0107279  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0489  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.32 
 
 
383 aa  256  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0137  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.39 
 
 
368 aa  255  9e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2937  putative cobalt/magnesium uptake transporter  35.61 
 
 
354 aa  248  9e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2791  putative cobalt/magnesium uptake transporter  35.61 
 
 
354 aa  247  2e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1587  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.59 
 
 
353 aa  246  4e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.188358  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2170  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.42 
 
 
372 aa  245  9e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.574954 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2074  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.04 
 
 
357 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0739  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.08 
 
 
374 aa  235  9e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000829129 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0173  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.46 
 
 
352 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1738  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.9 
 
 
352 aa  233  3e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.277865 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0865  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.46 
 
 
352 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.916446  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4182  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.9 
 
 
381 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4221  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.9 
 
 
381 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0969  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.23 
 
 
356 aa  228  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231272  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0785  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.92 
 
 
332 aa  226  6e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0685097  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1371  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.53 
 
 
387 aa  226  7e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2182  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.56 
 
 
327 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709225  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0054  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.29 
 
 
325 aa  214  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349471  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4037  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.42 
 
 
327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1102  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.14 
 
 
351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.528236  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2667  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.4 
 
 
355 aa  195  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.66 
 
 
321 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.04 
 
 
339 aa  192  8e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3530  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.54 
 
 
357 aa  190  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.203134  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.98 
 
 
339 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1811  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.16 
 
 
333 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.23 
 
 
316 aa  179  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2224  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.23 
 
 
291 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000656607  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0933  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.06 
 
 
325 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3994  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.35 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000979692  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3825  magnesium and cobalt transport protein  32.35 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.9681200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3841  magnesium and cobalt transport protein  32.35 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4306  magnesium/cobalt transporter CorA  32.35 
 
 
320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000440418  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4108  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.35 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.03946e-59 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2783  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.47 
 
 
316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000249719  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4217  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.99 
 
 
316 aa  172  9e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000527032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4153  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.99 
 
 
320 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000417339  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4194  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.99 
 
 
316 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000487176  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3915  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.99 
 
 
316 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000328218  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1043  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.35 
 
 
316 aa  171  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000724407  decreased coverage  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3587  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.13 
 
 
325 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1239  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.55 
 
 
325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1347  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.25 
 
 
340 aa  163  5.0000000000000005e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24256  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6358  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.97 
 
 
325 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1721  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.97 
 
 
325 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2264  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.11 
 
 
325 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1735  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.62 
 
 
325 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2504  putative metal ion transport protein  31.62 
 
 
321 aa  158  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5013  magnesium/cobalt transporter CorA  32.26 
 
 
325 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.117877  normal  0.108957 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0036  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  30.04 
 
 
360 aa  159  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1643  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.26 
 
 
325 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>