More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0436 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0436  magnesium and cobalt transport protein CorA  100 
 
 
354 aa  722    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1912  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.65 
 
 
374 aa  291  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107117  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3012  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.96 
 
 
354 aa  291  1e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.815439  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3419  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.28 
 
 
355 aa  290  4e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222754  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.94 
 
 
367 aa  289  4e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.98 
 
 
354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1617  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.57 
 
 
354 aa  275  7e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1913  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.87 
 
 
375 aa  272  7e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0646  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.93 
 
 
353 aa  271  9e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.32 
 
 
353 aa  271  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0176371  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2520  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.83 
 
 
357 aa  271  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107852  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0252  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.32 
 
 
353 aa  270  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2983  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.28 
 
 
354 aa  266  5e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.23033  normal  0.025318 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.68 
 
 
351 aa  265  1e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2085  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.7 
 
 
353 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1521  magnesium/cobalt transporter CorA  38.59 
 
 
375 aa  262  6.999999999999999e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.39 
 
 
341 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1725  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.43 
 
 
372 aa  261  1e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0556  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.21 
 
 
354 aa  260  2e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.1 
 
 
351 aa  258  1e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1189  magnesium/cobalt transporter CorA  39.5 
 
 
365 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1732  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.77 
 
 
355 aa  257  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0582  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.8 
 
 
354 aa  257  3e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000747796  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2244  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.81 
 
 
357 aa  255  7e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000192841  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1870  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.11 
 
 
363 aa  253  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10618  Magnesium and cobalt transport protein  34.65 
 
 
363 aa  253  4.0000000000000004e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  34.92 
 
 
358 aa  252  6e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_521  magnesium and cobalt transport protein  35.21 
 
 
354 aa  252  7e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.015404  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2768  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.44 
 
 
354 aa  248  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1399  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.28 
 
 
354 aa  246  4e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0668  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.83 
 
 
385 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0284032  normal  0.71068 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0648  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.83 
 
 
385 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2333  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.82 
 
 
387 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2267  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.57 
 
 
360 aa  235  9e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1006  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.4 
 
 
547 aa  232  6e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2665  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.24 
 
 
390 aa  232  9e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111176 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0433  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.38 
 
 
356 aa  231  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1041  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.49 
 
 
348 aa  228  1e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78816  normal  0.435904 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0696  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.17 
 
 
355 aa  228  2e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1997  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.45 
 
 
395 aa  226  5.0000000000000005e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.223184  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0795  magnesium/cobalt transporter CorA  36.9 
 
 
380 aa  223  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2107  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.53 
 
 
381 aa  220  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.61648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4989  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.72 
 
 
376 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3204  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.66 
 
 
379 aa  213  2.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648086  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4191  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.96 
 
 
382 aa  211  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.259759  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2074  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
357 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1928  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.79 
 
 
362 aa  204  1e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185921  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1587  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.51 
 
 
353 aa  205  1e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.188358  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0173  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.1 
 
 
352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1416  magnesium/cobalt transporter CorA  33.72 
 
 
354 aa  200  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1738  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.34 
 
 
352 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.277865 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0865  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.81 
 
 
352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.916446  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2937  putative cobalt/magnesium uptake transporter  30.75 
 
 
354 aa  196  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0489  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.45 
 
 
383 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0137  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.96 
 
 
368 aa  196  5.000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1581  magnesium/cobalt transporter CorA  34.85 
 
 
367 aa  196  6e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0107279  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2791  putative cobalt/magnesium uptake transporter  30.46 
 
 
354 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0739  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.56 
 
 
374 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000829129 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2170  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.55 
 
 
372 aa  192  6e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.574954 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1102  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.98 
 
 
351 aa  187  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.528236  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3530  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.06 
 
 
357 aa  186  7e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.203134  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1371  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.17 
 
 
387 aa  182  5.0000000000000004e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4037  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.65 
 
 
327 aa  182  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4182  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.89 
 
 
381 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4221  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.89 
 
 
381 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1992  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.54 
 
 
360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0785  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.37 
 
 
332 aa  179  8e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0685097  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2667  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.81 
 
 
355 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0054  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.28 
 
 
325 aa  160  4e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349471  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2182  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.89 
 
 
327 aa  159  9e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709225  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0969  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.06 
 
 
356 aa  157  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231272  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2224  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.43 
 
 
291 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000656607  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.76 
 
 
322 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.26 
 
 
316 aa  148  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.7 
 
 
339 aa  146  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.3 
 
 
321 aa  144  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.95 
 
 
339 aa  143  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1811  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.19 
 
 
333 aa  142  9e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0933  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.36 
 
 
325 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0057  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.04 
 
 
322 aa  140  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3994  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.96 
 
 
316 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000979692  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3825  magnesium and cobalt transport protein  27.96 
 
 
316 aa  139  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.9681200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4306  magnesium/cobalt transporter CorA  27.96 
 
 
320 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000440418  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4108  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.96 
 
 
316 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.03946e-59 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2129  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.07 
 
 
315 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0400102  normal  0.185773 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3841  magnesium and cobalt transport protein  27.96 
 
 
316 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0789  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  28.24 
 
 
322 aa  137  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.957399  normal  0.0628578 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4153  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.63 
 
 
320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000417339  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4217  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.72 
 
 
316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000527032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1043  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.05 
 
 
316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000724407  decreased coverage  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4194  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.72 
 
 
316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000487176  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1428  magnesium/cobalt transporter CorA  28.42 
 
 
384 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2783  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.96 
 
 
316 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000249719  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3190  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.17 
 
 
332 aa  135  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.38171  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0271  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.62 
 
 
370 aa  136  7.000000000000001e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3915  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.39 
 
 
316 aa  135  9e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000328218  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5404  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.68 
 
 
326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0808766 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2181  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.97 
 
 
314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0833206  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1207  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.93 
 
 
358 aa  130  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110395  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1675  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.32 
 
 
314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>