More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1399 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1399  magnesium and cobalt transport protein CorA  100 
 
 
354 aa  714    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1189  magnesium/cobalt transporter CorA  66.95 
 
 
365 aa  480  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3419  magnesium and cobalt transport protein CorA  59.04 
 
 
355 aa  451  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222754  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  56.34 
 
 
367 aa  431  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  53.56 
 
 
353 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0176371  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0252  magnesium and cobalt transport protein CorA  53.28 
 
 
353 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2520  magnesium and cobalt transport protein CorA  54.65 
 
 
357 aa  413  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107852  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0646  magnesium and cobalt transport protein CorA  51.57 
 
 
353 aa  390  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  54 
 
 
351 aa  386  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2244  magnesium and cobalt transport protein CorA  53.43 
 
 
357 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000192841  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  52.86 
 
 
351 aa  380  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2983  magnesium and cobalt transport protein CorA  50.57 
 
 
354 aa  376  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.23033  normal  0.025318 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3012  magnesium and cobalt transport protein CorA  47.32 
 
 
354 aa  366  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.815439  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  53.99 
 
 
341 aa  364  1e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2768  magnesium and cobalt transport protein CorA  49.58 
 
 
354 aa  363  2e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0433  magnesium and cobalt transport protein CorA  49.15 
 
 
356 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0582  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.91 
 
 
354 aa  355  6.999999999999999e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000747796  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0556  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.63 
 
 
354 aa  349  4e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1617  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.79 
 
 
354 aa  345  5e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1870  magnesium and cobalt transport protein CorA  49.44 
 
 
363 aa  344  1e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.07 
 
 
354 aa  342  5.999999999999999e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1006  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.51 
 
 
547 aa  340  2e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1725  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.48 
 
 
372 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_521  magnesium and cobalt transport protein  47.47 
 
 
354 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.015404  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0696  magnesium and cobalt transport protein CorA  47.06 
 
 
355 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2085  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.35 
 
 
353 aa  335  7.999999999999999e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  46.09 
 
 
358 aa  332  5e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1912  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.35 
 
 
374 aa  330  3e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107117  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10618  Magnesium and cobalt transport protein  41.08 
 
 
363 aa  329  5.0000000000000004e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1913  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.94 
 
 
375 aa  323  3e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2333  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.71 
 
 
387 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1732  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.54 
 
 
355 aa  318  7e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1521  magnesium/cobalt transporter CorA  44.94 
 
 
375 aa  311  2e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0795  magnesium/cobalt transporter CorA  41.55 
 
 
380 aa  308  8e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0648  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.86 
 
 
385 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0668  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.86 
 
 
385 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0284032  normal  0.71068 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2665  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.02 
 
 
390 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111176 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0489  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.61 
 
 
383 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4989  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.24 
 
 
376 aa  301  8.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1416  magnesium/cobalt transporter CorA  42.98 
 
 
354 aa  300  3e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1928  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.24 
 
 
362 aa  300  3e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185921  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2267  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.49 
 
 
360 aa  296  3e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1041  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.86 
 
 
348 aa  291  9e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78816  normal  0.435904 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3204  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.02 
 
 
379 aa  291  1e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648086  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1997  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.94 
 
 
395 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.223184  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2937  putative cobalt/magnesium uptake transporter  41.21 
 
 
354 aa  283  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2791  putative cobalt/magnesium uptake transporter  41.21 
 
 
354 aa  282  7.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4191  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.07 
 
 
382 aa  282  7.000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.259759  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1587  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.41 
 
 
353 aa  280  3e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.188358  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1738  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.1 
 
 
352 aa  278  1e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.277865 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0173  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.1 
 
 
352 aa  278  1e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2074  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.89 
 
 
357 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0865  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.25 
 
 
352 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.916446  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0436  magnesium and cobalt transport protein CorA  40 
 
 
354 aa  271  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1581  magnesium/cobalt transporter CorA  38.61 
 
 
367 aa  269  5e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0107279  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0137  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.2 
 
 
368 aa  266  5e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4182  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.22 
 
 
381 aa  265  8e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4221  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.22 
 
 
381 aa  265  8e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2107  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.66 
 
 
381 aa  264  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.61648 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1992  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.67 
 
 
360 aa  261  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0739  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.61 
 
 
374 aa  251  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000829129 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2170  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.87 
 
 
372 aa  251  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.574954 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0785  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.99 
 
 
332 aa  250  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0685097  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1371  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.88 
 
 
387 aa  250  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2182  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.67 
 
 
327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709225  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0969  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.39 
 
 
356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231272  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1102  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.34 
 
 
351 aa  228  1e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.528236  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4037  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.21 
 
 
327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.69 
 
 
339 aa  219  7e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0054  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.72 
 
 
325 aa  218  2e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349471  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.48 
 
 
316 aa  216  5.9999999999999996e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.31 
 
 
339 aa  215  7e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2667  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.98 
 
 
355 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.04 
 
 
322 aa  206  6e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.11 
 
 
321 aa  204  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3530  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.61 
 
 
357 aa  189  7e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.203134  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1811  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.79 
 
 
333 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0933  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.28 
 
 
325 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2224  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.98 
 
 
291 aa  186  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000656607  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1643  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.71 
 
 
325 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222374  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1207  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.06 
 
 
358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110395  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0057  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.67 
 
 
322 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1675  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.82 
 
 
314 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1735  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.36 
 
 
325 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1539  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.71 
 
 
325 aa  182  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.555793 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6358  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.36 
 
 
325 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1721  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.36 
 
 
325 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2270  Mg2 transporter protein CorA family protein  37.5 
 
 
314 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0371321  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1642  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.01 
 
 
325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2181  Mg2 transporter protein CorA family protein  37.16 
 
 
314 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0833206  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3587  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.83 
 
 
325 aa  179  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1239  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.72 
 
 
325 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5013  magnesium/cobalt transporter CorA  36.36 
 
 
325 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.117877  normal  0.108957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4421  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.79 
 
 
324 aa  176  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377619  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2129  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.43 
 
 
315 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0400102  normal  0.185773 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2266  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.31 
 
 
325 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2133  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.31 
 
 
325 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2077  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.31 
 
 
325 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2221  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.98 
 
 
321 aa  175  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2264  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.62 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>