More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1870 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1870  magnesium and cobalt transport protein CorA  100 
 
 
363 aa  726    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  50 
 
 
367 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3419  magnesium and cobalt transport protein CorA  52.82 
 
 
355 aa  366  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222754  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0646  magnesium and cobalt transport protein CorA  47.43 
 
 
353 aa  363  2e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3012  magnesium and cobalt transport protein CorA  48.86 
 
 
354 aa  361  1e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.815439  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  48.43 
 
 
351 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1189  magnesium/cobalt transporter CorA  50.84 
 
 
365 aa  355  1e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  47.86 
 
 
351 aa  352  5e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2983  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.02 
 
 
354 aa  352  7e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.23033  normal  0.025318 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2085  magnesium and cobalt transport protein CorA  49.16 
 
 
353 aa  345  8.999999999999999e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  47.29 
 
 
353 aa  339  4e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0176371  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1399  magnesium and cobalt transport protein CorA  49.44 
 
 
354 aa  338  9e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  52.1 
 
 
341 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2520  magnesium and cobalt transport protein CorA  48.04 
 
 
357 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107852  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0252  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.44 
 
 
353 aa  335  7e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.69 
 
 
354 aa  334  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1617  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.06 
 
 
354 aa  331  1e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10618  Magnesium and cobalt transport protein  43.66 
 
 
363 aa  322  5e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2768  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.48 
 
 
354 aa  318  7e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1725  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.18 
 
 
372 aa  315  7e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2244  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.52 
 
 
357 aa  314  9.999999999999999e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000192841  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  43.5 
 
 
358 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0696  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.58 
 
 
355 aa  308  9e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1006  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.9 
 
 
547 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2333  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.72 
 
 
387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1912  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.17 
 
 
374 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107117  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0582  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.6 
 
 
354 aa  302  7.000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000747796  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0556  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.81 
 
 
354 aa  300  2e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1732  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.57 
 
 
355 aa  298  7e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0648  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.64 
 
 
385 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0668  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.64 
 
 
385 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0284032  normal  0.71068 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0433  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.33 
 
 
356 aa  296  4e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1913  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.41 
 
 
375 aa  296  5e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0489  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.43 
 
 
383 aa  294  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_521  magnesium and cobalt transport protein  40.17 
 
 
354 aa  290  2e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.015404  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2665  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.64 
 
 
390 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111176 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1041  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.06 
 
 
348 aa  291  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78816  normal  0.435904 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0795  magnesium/cobalt transporter CorA  40.96 
 
 
380 aa  290  3e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1521  magnesium/cobalt transporter CorA  40.17 
 
 
375 aa  283  5.000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2107  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.98 
 
 
381 aa  282  8.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.61648 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3204  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.3 
 
 
379 aa  280  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648086  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1997  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.61 
 
 
395 aa  280  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.223184  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1416  magnesium/cobalt transporter CorA  42.09 
 
 
354 aa  276  4e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0739  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.32 
 
 
374 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000829129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2267  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.12 
 
 
360 aa  272  6e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0436  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.11 
 
 
354 aa  267  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1928  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.93 
 
 
362 aa  266  2.9999999999999995e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185921  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4989  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.76 
 
 
376 aa  263  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1581  magnesium/cobalt transporter CorA  42.31 
 
 
367 aa  263  4e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0107279  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4221  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.53 
 
 
381 aa  252  6e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4182  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.53 
 
 
381 aa  252  6e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0137  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.92 
 
 
368 aa  252  7e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2170  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.69 
 
 
372 aa  251  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.574954 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4191  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.9 
 
 
382 aa  244  9.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.259759  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0173  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.15 
 
 
352 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2074  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.2 
 
 
357 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1738  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.43 
 
 
352 aa  239  4e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.277865 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1992  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.85 
 
 
360 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2937  putative cobalt/magnesium uptake transporter  35.88 
 
 
354 aa  237  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2791  putative cobalt/magnesium uptake transporter  35.59 
 
 
354 aa  237  3e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1587  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.01 
 
 
353 aa  237  3e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.188358  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0865  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.87 
 
 
352 aa  235  8e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.916446  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0785  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.98 
 
 
332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0685097  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1371  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.08 
 
 
387 aa  232  8.000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2182  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.34 
 
 
327 aa  225  1e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709225  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0054  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.75 
 
 
325 aa  222  8e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349471  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1102  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.29 
 
 
351 aa  221  1.9999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.528236  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4037  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.36 
 
 
327 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2667  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.15 
 
 
355 aa  204  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0969  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.28 
 
 
356 aa  200  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231272  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.51 
 
 
322 aa  194  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0933  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.99 
 
 
325 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1811  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.59 
 
 
333 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.84 
 
 
339 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.66 
 
 
339 aa  189  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3530  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
357 aa  186  5e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.203134  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.9 
 
 
316 aa  183  5.0000000000000004e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
321 aa  176  6e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3587  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.04 
 
 
325 aa  169  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2264  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.77 
 
 
325 aa  167  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0057  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.42 
 
 
322 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1996  magnesium/cobalt transporter CorA  29.85 
 
 
325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215662  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2224  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.66 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000656607  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5013  magnesium/cobalt transporter CorA  30.03 
 
 
325 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.117877  normal  0.108957 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0816  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.18 
 
 
367 aa  162  9e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4421  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.17 
 
 
324 aa  162  9e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377619  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1735  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.08 
 
 
325 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3994  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.39 
 
 
316 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000979692  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3825  magnesium and cobalt transport protein  29.39 
 
 
316 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.9681200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4306  magnesium/cobalt transporter CorA  29.39 
 
 
320 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000440418  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1539  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.27 
 
 
325 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.555793 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4108  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.39 
 
 
316 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.03946e-59 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06540  Mg2+/Co2+ transporter  34.11 
 
 
363 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1643  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.46 
 
 
325 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4153  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.39 
 
 
320 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000417339  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3841  magnesium and cobalt transport protein  29.39 
 
 
316 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1642  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.46 
 
 
325 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6358  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.77 
 
 
325 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1721  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.77 
 
 
325 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4217  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.39 
 
 
316 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000527032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>